闵霞 作品数:6 被引量:18 H指数:3 供职机构: 上海海洋大学水产与生命学院 更多>> 发文基金: 国家现代农业产业技术体系建设项目 黑龙江省自然科学基金 黑龙江水产研究所基本科研业务费专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
几种鲤鱼遗传多样性分析和松浦镜鲤分子辅助育种标记筛选 本文首先利用SPSS13.0分析软件对194尾松浦镜鲤的体重、体长和尾长值进行相关分析,并选用扩增效果好的30个微卫星标记,检测新品种松浦镜鲤繁殖群体的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态... 闵霞关键词:鲤鱼 微卫星 分子辅助育种 鲤鱼cDNA-AFLP技术反应体系的建立 被引量:1 2011年 将cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-amplified fragment length polymorphism)技术应用在鲤鱼基因的转录表达研究中,本文通过对cDNA-AFLP主要步骤的优化和改进,建立起鲤鱼cDNA-AFLP反应体系。结果表明,采用MseⅠ和BstYⅠ酶切鲤鱼cDNA100ng,分别处理2h和3h后,以接头浓度分别为2pmol/μL和0.2pmol/μL、T4连接酶浓度为0.12U/μL的反应体系进行连接。以稀释50倍的预扩增产物为模板、BstYⅠ和MseⅠ比例为1:4的引物配比进行选择扩增可得到稳定的扩增结果。本研究建立的cDNA-AFLP技术将为鲤鱼转录组研究建立基础和技术支持。 李飞 贾智英 闵霞 石连玉关键词:CDNA-AFLP 鲤鱼 水产动物 微卫星分子标记与松浦镜鲤3个表型性状的相关分析 松浦镜鲤是在德国镜鲤的基础上经过多年人工选育的结果,2009年通过全国水产原种和良种审定委员会审定为新品种.本文利用SPSS 13.0分析软件对194尾松浦镜鲤体重、体长和尾长进行了简单相关分析和偏相关分析,结果显示:体... 闵霞 贾智英 李池陶 李飞 石连玉关键词:镜鲤 体长 尾长 微卫星 选育品种松荷鲤遗传结构研究 被引量:12 2012年 本研究随机选取了136尾松荷鲤个体,利用30对多态性较高的微卫星标记对该品种的遗传结构进行了分析。结果表明:群体平均等位基因数(A)为8.33,有效等位基因数(Ae)为5.91,期望杂合度(He)值为0.81,平均多态信息含量(PIC)为0.78,显示出群体丰富的遗传多样性;哈迪-温伯格平衡检验结果显示超过半数的位点都发生了显著或者极显著偏离平衡,表明人工选择压力对群体结构造成了很大的影响;种群有效群体大小和群体瓶颈效应分析表明,有效种群大小约为133,种群近期内可能经历了遗传瓶颈。本研究通过对选育品种松荷鲤遗传变异进行了分析,初步了解了该品种的遗传结构,为松荷鲤的种质资源保存和利用提供了支持。 石连玉 李飞 贾智英 李池陶 闵霞关键词:鲤鱼 微卫星 微卫星分子标记与松浦镜鲤3个表型性状的相关分析 被引量:3 2011年 本文利用SPSS13.0分析软件对194尾松浦镜鲤的体重、体长和尾长值进行相关分析,并选用扩增效果好的30个微卫星标记,检测新品种松浦镜鲤繁殖群体的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息含量(PIC)等遗传参数,以卡方检验估计群体Hardy-Weinberg平衡,最后还将30个基因座的不同基因型与个体的体重、体长和尾长进行了相关分析。结果显示,体重与体长高度线性相关,差异极显著;尾长与体重、体长分别呈显著相关,差异显著。多样性指数结果表明共检测到172个等位基因,片段长度在115~432bp之间,有效等位基因数为1.14~5.32;观测杂合度为0.07~0.92,期望杂合度为0.13~0.91;多态信息含量为0.12~0.79,其中高度多态(PIC≥0.5)21个,中度多态(0.25≤PIC≤0.5)7个,表明这个群体的多样性较高,信息含量比较丰富。我们还发现有4个遗传位点:HLJ328、HLJ693、MFW29和MFW48与体长性状显著相关(P<0.05),其中,位点HLJ328、HLJ693和MFW48还与体重性状显著相关(P<0.05),未发现与尾长性状相关的位点。本文获得的这些标记具有生长特性优势,可作为松浦镜鲤分子辅助育种的参考标记。 闵霞 贾智英 李池陶 李飞 石连玉关键词:镜鲤 微卫星 生长性状 鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析 被引量:1 2012年 根据已克隆的鲤鱼MHC Ⅱ B基因序列,设计1对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对6个鲤鱼群体MHC Ⅱ B基因第3外显子108 bp扩增片段进行多态性分析,结果共获得7种基因型(A-G),其中基因型为B型的个体数占所有群体总个体数的47.45%,且分布于所有群体,其它6种基因型出现频率范围为1.1%~17.15%。回收不同基因型的片段并测序,经比对共发现4个碱基多态位点和3个氨基酸多态位点。易捕鲤和大头鲤两群体中各发现4个突变位点(占3.7%);松荷鲤、松浦鲤和德国镜鲤群体各发现3个突变位点(占2.7%);松浦镜鲤群体仅发现2个突变位点(占1.8%)。用Popgene软件计算每个群体不同位点的杂合度和多态信息含量(PIC),6个鲤鱼群体的观测杂合度(Ho)最大值为0.746 4,最小值为0.103 7;多态信息含量为0.062 3~0.360 9。该研究将为今后深入研究鲤鱼MHC基因多态性及与鲤鱼抗病新品种的选育提供理论依据。 闵霞 贾智英 李池陶 李飞 石连玉关键词:MHC 鲤鱼 多态性