陈思弘
- 作品数:3 被引量:6H指数:2
- 供职机构:上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 缺刻缘绿藻转录组测序及脂质代谢相关基因注释被引量:4
- 2012年
- 为了能深入地了解缺刻缘绿藻花生四烯酸(ArA)和脂质的代谢过程,利用Roche 454 GS FLX测序仪对该藻转录组进行高通量的焦磷酸测序。得到高质量读序(read)382 468条,占原始读序的97.14%,平均每条读序长322 bp,总大小达123 Mb。经CAP3软件拼接得到22 714条重叠群、25 621条singleton。将这些序列与公共数据库进行同源性搜索、比较、基因功能注释和分类。基于转录组中所注释的基因构建缺刻缘绿藻脂质代谢途径:脂肪酸是在叶绿体内从头合成,然后游离脂肪酸进入胞质,由内质网进行三酰甘油的合成,最后可能在油体蛋白作用下形成油滴并储在于细胞中。ArA自油酸是开始经过多个去饱和酶及延长酶的作用而产生的。油酸是由硬脂酰-ACP去饱和酶作用而形成的,而棕榈油酸是在叶绿体的糖脂上被去饱和而产生的。三酰甘油最终被分解成自由脂肪酸和丙酮酸,而长链脂肪酸是以酰基-辅酶A的形式逐级降解的。
- 陈思弘周志刚
- 关键词:缺刻缘绿藻转录组焦磷酸测序
- 基于转录组高通量测序数据构建缺刻缘绿藻脂质代谢网络
- 缺刻缘绿藻(Myrmecia incisa)是迄今为止所知花生四烯酸(20:4ω6,AA)含量最高的微藻种类之一,尤其在氮饥饿胁迫条件下,其AA含量可达脂肪酸总量的45%、藻体干重的7%。利用ROCHE 454 GS F...
- 陈思弘周志刚
- 文献传递
- 条斑紫菜藻红、藻蓝蛋白逐级放大的纯化工艺被引量:2
- 2010年
- 采用"破碎-盐析-层析"的方法纯化条斑紫菜藻胆蛋白,并在提取规模上逐步放大。首先在综合比较凝胶层析去盐效率后,从Sephadex G-25、G-100、S-300和CL-6B中选择G-25作为实验流程中的去盐填料,其次将提取流程的初试原料条斑紫菜量逐步放大,选取了1g、20g和400g三个量,结果表明随着初试紫菜量逐步放大,最终所得藻胆蛋白中吸收光谱纯度>3.2的蛋白产率依次提高,其中400g冻干紫菜的藻红蛋白产率为0.323%,藻蓝蛋白产率为0.148%。由此认为该实验工艺流程具有规模放大的潜力,这为高纯度藻胆蛋白的规模生产提供了一条可行的方案。
- 李春霞吴淑贤蔡春尔汪卿陈思弘李慧何培民
- 关键词:条斑紫菜藻红蛋白藻蓝蛋白SEPHADEX扩大化