顾海丰
- 作品数：6 被引量：44H指数：4
- 供职机构：中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家质检总局科技计划项目广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学更多>>
- 中药材蛤蚧的特异性PCR鉴定被引量：8
- 2012年
- 以线粒体Cytb、COI、12SrRNA、16SrRNA基因序列为基础,探讨特异性PCR技术鉴定蛤蚧及伪品的可行性。本研究以所扩增的16条COI序列为引物设计依据序列设计了1对位点特异性引物COISF,COISR,同时从Gen-Bank上下载30条序列,设计了CytbSF,CytbSR;16S rRNASF,16S rRNASR;12S rRNASF,12S rRNASR另外3对位点特异性引物,因此共用4对位点特异性引物分别扩增蛤蚧及伪品实验样本。结果表明在复性温度为65℃时,4对引物都出现了理想的结果,即蛤蚧正品出现了扩增条带,而伪品没有扩增条带。同时对市售的蛤蚧商品进行了检测,在所供的7号标本中,有4号为蛤蚧正品,其余3号为蛤蚧伪品。本研究所设计的位点特异性引物可快捷、准确的鉴定蛤蚧及伪品,且在药检工作中具有极大的应用前景。
- 顾海丰夏云徐永莉谷颖乐许尧李力曾晓茂
- 关键词：特异性引物分子鉴定
- DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定被引量：25
- 2009年
- 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序列5’端160bp序列为分析基础,通过遗传距离分析,得出其鉴定物种的准确性为94%,验证了虚拟实验结果.即微型DNA条形码(Minimalistbarcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致,均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据.
- 范京安顾海丰陈世界莫帮辉温演庆何万兴刘伟曾晓茂
- 关键词：实蝇科COI基因DNA条形码物种鉴定
- 蛤蚧及其伪品微型DNA条形码的引物筛选被引量：11
- 2011年
- 文章旨在筛选出适合于扩增蛤蚧及伪品微型DNA条形码引物。通过引物设计软件,经过多序列比对,设计了两对引物mini-barcode F2,mini-barcode R2;mini-barcode F3,mini-barcode R3,并用这两对引物和目前已报道的微型条形码引物PCR扩增蛤蚧及伪品61个样本,结果表明mini-barcode F2,mini-barcode R2和mini-barcode F3,mini-barcode R3这两对引物的PCR扩增成功率分别为100%和90%,而目前已报道的微型条形码引物PCR扩增蛤蚧及其伪品得到了长度约500 bp非微型条形码序列片段。因此目前已报道的微型条形码引物不适用于扩增蛤蚧及伪品,该研究筛选出了适合于蛤蚧及伪品的微型条形码引物。
- 李力顾海丰夏云徐永莉彭锐莫邦辉曾晓茂
- 关键词：PCR引物
- 实蝇科昆虫mtDNA-COI基因序列分析及系统发育研究被引量：6
- 2009年
- 将自测的实蝇科6种和从GenBank中检索到的12属40种的mtDNA-COI基因编码区序列片段进行同源性比较,构建分子系统树.在获得的657 bp序列中,变异位点41.4%、简约位点35.62%,A+T含量为64.7%,转换与颠换的比值为0.868.分子系统树表明:果实蝇属、合腹寡鬃实蝇属为最先分化出来的属,是较为原始的类群;其次是按实蝇属、凤实蝇属、绕实蝇属,腊实蝇属为较晚分化出来的属.按实蝇属、果实蝇属及合腹寡鬃实蝇属是近缘的;绕实蝇属和腊实蝇属是近缘的.
- 范京安顾海丰陈世界莫帮辉温演庆何万兴刘伟曾晓茂
- 关键词：实蝇科系统发育
- 基于亲缘关系的红蛤蚧与黑蛤蚧药效再评估被引量：1
- 2011年
- 目的基于药用亲缘学原理,对红、黑蛤蚧药效情况进行再评估。方法通过Mega软件,采用MP法构建系统发育树,基于系统发育树判断红、黑蛤蚧之间的亲缘关系,并依此探讨红、黑蛤蚧及药效之间的关系。结果红、黑蛤蚧在系统树上相互嵌合在一起,不能各自形成独立分支(单系),来自不同产地的红、黑蛤蚧分别构成了4个独立支系,这与红、黑蛤蚧截然可分的概念相悖。结论红蛤蚧可能具有和黑蛤蚧相似的药效,不同地区的红、黑蛤蚧药效可能存在差异。该研究旨在为红、黑蛤蚧的药效及化学成分研究提供前瞻性的建议,即开展相关研究应基于亲缘关系,分别对不同产地红、黑蛤蚧样品进行分析。
- 顾海丰夏云彭锐郑渝池李力曾晓茂
- 关键词：药效
- COI与16S在小鲵科DNA条形码中应用
- 体上COI (细胞色素C 氧化酶亚单位I) 基因5'端的648 bp 片段是动物条形码的标准标记.然而,在两栖动物中COI 基因却有较高的变异性,其测序常遇到一些挑战.
- 夏云顾海丰彭锐陈勤郑渝池Robert W.Murphy曾晓茂
- 关键词：小鲵科DNA条形码物种鉴定
