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基于序列的蛋白质折叠速率与膜蛋白功能分类研究: 蛋白质是生命的物质基础。如何理解蛋白质序列,结构和功能三者的关系是生物信息学研究的重要问题。本文致力于研究蛋白质序列和结构,序列和功能之间的关系。本研究主要结果由以下四部分组成：　　㈠提出了一个快速的蛋白质结构比对算...; 高建召; 关键词：蛋白质结构蛋白质折叠

原核生物基因组的CDS与ORF序列的几点分析: 2009年; 基因组的开放阅读框(ORF)是基因识别与基因组分析的基础,有多种软件包给出了它们的生成算法,但结果与指标并不统一.本文给出了po-MORF的定义与它的生成算法,证明了由基因组所确定的po-MORF集合的存在与唯一性,并由该生成算法可以得到全部po-MORF序列.我们还比较了若干原核生物基因组中所有CDS与po-MORF序列的相互关系,并讨论了关于基因识别中的有关问题.; 沈世镒高建召胡刚王奎

基于序列和局部信息熵的蛋白质折叠速率预测模型被引量：2: 2010年; 正确预测蛋白质折叠速率对理解蛋白质的折叠机制非常重要。本文从AAindex数据库中的531种残基物理化学性质、序列长度信息和局部结构信息熵中筛选特征,从而提出了一个基于蛋白质序列信息的线性回归模型。针对三种折叠机制two-state,multi-state和mixed-state,用Jackknife验证模型,预测的折叠速率和实验验证的折叠速率相关系数分别为0.790,0.829和0.778。本文结果表明四阶局部结构信息熵和折叠速率有很高的负相关性;蛋白质的长度和蛋白质的折叠速率成反比关系;螺旋的含量会加快蛋白质的折叠过程。对two-state蛋白质β折叠的含量会减慢蛋白质的折叠过程;和其他模型相比,我们提出的线性回归模型具有输入参数少,计算简单,平均绝对误差小的优点。; 高建召胡刚王奎沈世镒

利用蛋白质的二面角序列对蛋白质结构比对被引量：2: 2009年; 蛋白质结构比对对理解蛋白质功能和进化关系非常重要。提出一种基于蛋白质残基的二面角的结构比对算法。通过动态时间规整算法比对二面角序列,来比较蛋白质的结构,拟合两蛋白结构距离的分布后,利用p-value来评价比对的好坏。主要结果有:利用动态时间规整算法计算得出的结构距离是一个很好的蛋白质结构相似性度量;结构距离服从参数为μ=94.7697,σ=41.5837,ξ=0.1925的广义的极值分布;和其他结构比对算法相比,该算法比CTSS的搜索结果要好。; 高建召胡刚王奎崔家峰; 关键词：广义极值分布动态时间规整

全球新型冠状病毒肺炎疫情发展趋势预测被引量：7: 2020年; 目的对全球新型冠状病毒肺炎疫情的走向进行科学预测。方法基于SEIR(易感者-潜伏者-传染者-恢复者)模型的建模思路,建立积分型普适SEIR模型刻画新型冠状病毒肺炎疫情在易感人群中的传播机制,结合新型冠状病毒肺炎疫情的平均潜伏期、平均传染期、非典型患者占比等参数,利用构建的EpiSIX程序,模拟全球主要疫情国家新型冠状病毒肺炎疫情的总体态势。结果在理想状态下,全球范围内的疫情将不迟于9月底结束,全球确诊总规模在700万例左右(现确诊总数为540万例);其中,美国将达到250万例(现确诊总数是167万例)。结论本研究提出如下警告:现在预测的是首波疫情的结果,要警惕出现二次暴发的可能。; 魏凤英魏凤英王金杰高建召高建召马驰宇彭志行靳祯靳祯; 关键词：SEIR模型停时

用SVM和FFT对膜蛋白功能分类: 2009年; 膜蛋白在细胞生命活动中扮演着重要的角色。目前,有很多方法用来预测和分类膜转运蛋白。然而,预测膜蛋白功能的工作并不多。为了解决这个问题,基于蛋白质序列信息结合快速傅里叶变换利用支持向量机的方法预测来自TCDB数据库中的channels/pores,electrochemical potential-driven transporters和primary active transporters三类膜转运蛋白共1817条蛋白质的功能。模型使用20种氨基酸的分布,残基的疏水性、平均极性和溶剂化自由能为原始的特征数据,利用快速傅里叶变换将其转化为频域上的信息作为机器学习的特征输入。通过五倍交叉检验预测准确率达到了72.1%,而先前的文献报道的准确率为68.1%。论文的研究证明该方法可以有效地对channels/pores,electrochemical potential-driven transporters和primary active transporters三种不同功能的膜转运蛋白进行功能分类。; 高建召王奎胡刚张华; 关键词：支持向量机快速傅里叶变换疏水性

微积分慕课教学资源与应对策略被引量：3: 2017年; 当前高校纷纷开展慕课课程资源建设。文章就微积分或高等数学课程为例,统计网上的资源,然后提出教师应对慕课资源的策略。; 高建召; 关键词：微积分高等数学

The analysis and applications of protein structure: This paper is focused on the analysis of the protein primary and spatial structure and their application. The ...; 沈世镒胡刚王奎高建召; 文献传递

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高建召