冯丰
- 作品数:2 被引量:4H指数:1
- 供职机构:北京师范大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:理学更多>>
- 生物体系间氢键作用的理论化学研究——一个改进的半经验计算化学方法及其应用
- 在生物分子体系中,氢键作用占有极其重要的地位。氢键对于稳定蛋白质和核酸的结构、实现DNA的稳定遗传、完成DNA指导蛋白质合成,具有十分重要的作用。
当代半经验方法诞生三十多年来,由于具有极快的计算速度和比较稳定的计...
- 冯丰
- 关键词:生物体系氢键结合能半经验方法光化学反应
- DNA和RNA双链稳定性差异的理论研究被引量:4
- 2009年
- 利用适用于分子间弱相互作用,尤其是生物分子间的氢键相互作用的改进的半经验方法RM1BH和达到线性标度的新的半经验算法以及SimuCal_SE方法,与自主开发的量子化学程序包SimuPac1.0,对4组一系列DNA和RNA碱基的氢键结合能进行了计算.这些计算包括单一碱基类型和混合碱基类型两大类情形,最大的原子数达到1064个.计算结果表明,在碱基层数较少时,DNA和RNA氢键结合能差别不大;在碱基层数较多时,RNA的氢键结合能明显高于DNA的氢键结合能;嘌呤和嘧啶的排列方式对结合能略有影响,但不影响上述趋势.可见,氢键对于RNA的稳定性差异起到重要的作用,计算结果支持了实验的结论.
- 冯丰于建国方维海