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几种肠道菌中细胞致死性肿胀毒素的检测及其细胞毒性初步研究被引量：1: 2009年; 目的了解肠出血性大肠杆菌、非典型致泻性大肠杆菌、志贺菌及部分肠杆菌中CDT毒素基因存在情况及其细胞毒性。方法用PCR方法检测cdt基因,并将阳性菌株培养上清与HeLa细胞共同孵育检测细胞形态的改变,初步评价CDT毒素的表达及其细胞毒性。结果在肠出血性大肠杆菌O157∶NM中,cdt基因检出率为16.28%(7/43),其中3株为cdt-III型,其他4株为cdt-I型;携带HPI毒力岛的非典型致泻性大肠杆菌中cdt基因检出率为6.25%(5/80);在志贺菌中,cdt基因检出率为2.67%(4/150),非典型致泻性大肠杆菌和志贺菌检出的cdt基因全部为cdt-I型。而在O157∶H7大肠杆菌、枸橼酸杆菌和沙门菌未检出cdt基因。所有cdt基因阳性菌株均使HeLa细胞出现典型的细胞肿胀变化,效应滴度介于1∶2到1∶16之间。结论CDT毒素只在肠出血性大肠杆菌O157∶NM、携带HPI毒力岛的非典型致泻性大肠杆菌和志贺菌中检出,且检出率均比国外同类菌株低,其存在是否与疾病严重程度相关及其细胞毒性机制尚须进一步研究予以证明。; 卢珊孙娜任志鸿叶长芸; 关键词：大肠杆菌志贺菌

使用两种培养基一种气体条件分离高原鼠兔肠道菌: 2017年; 目的使用脑心浸液羊血培养基和KF链球菌羊血培养基对高原鼠兔肠道菌进行分离,以了解脑心浸液羊血培养基上所分离的细菌菌属的种类和丰度,同时用KF链球菌羊血培养基对高原鼠兔肠道菌进行选择性分离以了解高原鼠兔肠道中是否存在新种链球菌。方法使用脑心浸液羊血培养基和KF链球菌羊血培养基,在5%CO2气体条件下对高原鼠兔肠道菌进行培养和分离,使用16S r DNA全长序列分析等方法鉴定细菌。结果从20份高原鼠兔肠内容物标本中共分离607株细菌,可鉴定为19个属,31个种。其中用脑心浸液羊血培养基分离鉴定了495株细菌的19个属,用KF链球菌羊血培养基分离鉴定了112株细菌的3个属。分离鉴定的607株细菌,在属水平上,节杆菌属、肠球菌属、芽孢杆菌属为优势菌属,分别占31.47%、16.14%和15.98%;在种水平上,Arthrobacter luteolus、Enterococcus faecium为优势种。一些菌种为具有医学意义的细菌,如Yersinia enterocolitica、Staphylococcus haemolyticus、Staphylococcus epidermidis等。结论脑心浸液羊血培养基上所分离的菌属丰富,本次实验中尚未发现链球菌新种,分布广泛的青藏高原鼠兔肠道中携带多种致病菌和潜在致病菌。; 张桂杨晶金东卢珊徐建国; 关键词：高原鼠兔肠内容物菌株分离

新疆乌苏市古尔图地区长尾黄鼠感染巴尔通体情况调查被引量：4: 2018年; 目的了解新疆维吾尔自治区(新疆)乌苏市古尔图地区长尾黄鼠的巴尔通体感染状况,为该地区鼠传疾病风险预警与防控措施制定提供科学依据。方法 2017年5-9月采用一日弓形夹法在查岗果勒、布兰布拉克、白石头等地捕获长尾黄鼠86只,无菌采集鼠体肾脏,试剂盒法提取全基因组DNA。应用实时荧光定量PCR法检测样本DNA巴尔通体特异性基因ssrA,计算感染率,分析样本的检测循环阈值(cp值)。结果 42只长尾黄鼠的巴尔通体实时荧光定量PCR检测为阳性,阳性率为48.84%;阳性样本cp值最低为27.49,最高为37.83,其中88.10%阳性样本的cp值在35.00～37.83之间,查岗果勒、布兰布拉克、白石头三地巴尔通体的阳性率分别为48.48%、60.87%和40.00%;布兰布拉克地区巴尔通体感染率、阳性动物染蚤率、蚤指数均高于查岗果勒和白石头地区;三地巴尔通体感染率与动物染蚤率差异无统计学意义(P>0.05)。结论新疆乌苏市古尔图地区长尾黄鼠间存在巴尔通体自然感染,传播范围广,但群体带菌量较低。; 李博岳锡宏卢珊雒涛王信惠黎唯; 关键词：巴尔通体实时荧光定量PCR

肠集聚性大肠埃希菌分离株脉冲场凝胶电泳分析被引量：3: 2013年; 目的对我国散发腹泻患者肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分离株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,以了解其分子流行病学特征并初步建立我国EAEC菌株的基础数据库。方法参照PulseNet大肠埃希菌O157∶H7的PFGE实验方法对52株EAEC分离株进行分析,并使用BioNumerics软件进行聚类。结果在限制性内切酶XbaⅠ和PulseNet推荐的电泳参数下,菌株基因组酶切片段分布均匀,条带易于识别。52株EAEC分离株产生了48种PFGE带型,初步聚类为A^N 14个群,不同地区来源及不同HEp-2细胞黏附表型的菌株广泛分布在不同PFGE聚类群中。结论我国散发腹泻患者EAEC分离株呈现高度多态性,PFGE电泳参数和限制性内切酶XbaⅠ适用于我国EAEC菌株的分析。; 孙晖刘学通赵爱兰金东熊衍文卢珊; 关键词：脉冲场凝胶电泳分子分型

婴幼儿腹泻感染的非伤寒沙门菌分子分型和耐药情况研究被引量：19: 2014年; 目的研究婴幼儿感染的非伤寒沙门菌的分子流行病学特点和耐药情况。方法收集上海地区腹泻婴幼儿粪便标本,进行沙门菌的分离培养,生化鉴定,血清型分型,分子分型和药物敏感性检测实验。结果 583份婴幼儿粪便中分离出沙门菌共19株,主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)带型相似度较高(88.7%),且主要带型为上海近年流行的优势带型。药物敏感性实验结果显示,菌株对测试的15种抗生素的总体耐药率为78.95%(15/19),对萘啶酸(68.42%)和氨苄西林(63.20%)的耐药率较高,对环丙沙星(10.53%)和庆大霉素(10.53%)的耐药率较低,对三代头孢类抗生素的耐药率较高(40%)。菌株耐药谱分布广泛,发现多重耐药菌株13株。结论本研究中,婴幼儿感染的非伤寒沙门菌耐药情况比较严重;不同血清型和分子分型的菌株耐药性差异无统计学意义。; 崔志刚王爱敏王鸣柳许学斌崔晶花杜小莉闫梅英卢珊; 关键词：婴幼儿腹泻非伤寒沙门菌血清型分子分型耐药

新疆古尔图地区长尾黄鼠感染病原体情况调查被引量：2: 2020年; 目的调查新疆维吾尔自治区(新疆)古尔图地区长尾黄鼠汉赛巴尔通体、伯氏疏螺旋体和嗜吞噬细胞无形体等病原体感染情况,分析该地区自然疫源性疾病流行风险,为制定防控措施提供科学依据。方法 2017年5—9月采用一日弓形夹法捕捉查岗果勒、布兰布拉克、白石头等地长尾黄鼠86只,无菌采集鼠体肾脏,试剂盒法提取全基因组DNA;运用实时荧光定量聚合酶链式反应方法检测样本汉赛巴尔通体ssrA基因、伯氏疏螺旋体recA基因和嗜吞噬细胞无形体Msp2基因。结果共检测86只长尾黄鼠样本,其中汉赛巴尔通体阳性42份,阳性率为48.84%;伯氏疏螺旋体阳性6份,阳性率为6.98%;嗜吞噬细胞无形体阳性3份,阳性率为3.49%。布兰布拉克地区的汉赛巴尔通体感染率高于查岗果勒和白石头地区,白石头地区的伯氏疏螺旋体和嗜吞噬无形体感染率高于其他两地。结论新疆古尔图地区长尾黄鼠存在汉赛巴尔通体、伯氏疏螺旋体和嗜吞噬细胞无形体感染。; 李博卢珊雒涛阿布力克木·阿布都热西提郝琴王信惠张琳古丽阿依·包开西黎唯; 关键词：鼠类实时荧光定量PCR

应用高分辨率熔解曲线技术检测大肠埃希菌O157:H7志贺毒素基因变种stx2c被引量：1: 2012年; 目的:探索高分辨率熔解曲线(High Resolution Melting,HRM)分析技术在检测大肠埃希菌O157:H7志贺毒素基因变种stx2c中的应用。方法:用HRM技术对20株O157:H7代表性菌株志贺毒素2基因进行分型,并与测序结果进行比较。结果:20份O157:H7样品中有3种类型熔解曲线。测序结果显示,12例A型熔解曲线中除1例为stx2a+stx2c杂合型外,其它均为原毒素基因型stx2a;1例B型熔解曲线测序结果为stx2a+stx2c杂合型,7例C型熔解曲线菌株测序结果均为stx2c纯合子。结论:HRM技术简便、快速,可作为志贺毒素2基因变种stx2c的检测方法。; 陈强王涛孙晖王艳熊衍文卢珊; 关键词：大肠埃希菌O157:H7 高分辨率熔解曲线分析

大肠埃希菌(EHEC/EPEC)紧密黏附素基因的分型分析被引量：3: 2012年; 目的了解大肠埃希菌分离株eaeA基因的多态性。方法对不同来源的60株大肠埃希菌分离株的eaeA基因进行聚合酶链反应扩增后直接测序,测序结果在NCBI中进行BLASTn比对,根据比对相似性判定eaeA基因的型别。将获得型别的序列与GenBank中肠致病性大肠埃希菌(Enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)和肠出血性大肠埃希菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC)代表性菌株型别的序列用Neighbor-joining法构建系统发生树,分析其进化关系。结果所有EHEC分离株的eaeA基因均为γ型,且序列完全一致。EPEC分离株的eaeA基因型以β1型为主,同时存在ε,κ,ι2,θ型。结论 EHEC分离株的eaeA基因相对保守,型别单一,而EPEC分离株的eaeA基因表现出较大的多态性。; 陈强卢珊赵爱兰熊衍文; 关键词：大肠埃希菌

喜马拉雅旱獭源鹑鸡肠球菌的分离及其耐药性检测被引量：5: 2016年; 目的了解青藏高原喜马拉雅旱獭携带院内感染病原菌鹑鸡肠球菌情况,并检测其对临床常用抗菌药物的耐药性。方法选择性培养基、革兰染色、生化反应和16S rRNA基因序列分析方法对细菌进行分离和鉴定;K-B纸片法检测菌株对15种抗菌药物的耐药情况,并应用PCR方法检测毒力基因和耐药基因。结果 79份喜马拉雅旱獭肠道样本中共分离到3株鹑鸡肠球菌,其中1株对利福平中介,3株均对奎奴普丁中介,对其他被检抗菌药物均敏感;未检测到常见肠球菌毒力基因(asa1、esp、hyl、gel E和cyl A)和相关耐药基因。结论首次在青藏高原旱獭粪便中分离到鹑鸡肠球菌,常见的毒力基因检测阴性,对常见抗菌药物敏感。; 王怡婷金东杨晶卢珊濮吉孟祥莉张桂徐建国; 关键词：喜马拉雅旱獭鹑鸡肠球菌耐药性毒力基因

牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究被引量：7: 2013年; 目的对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力。方法根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumerics软件构建最小生成树(Minimum spanning tree,MST),分析牦牛ST型与HUSEC及人源主要流行血清群STEC菌株ST型间的进化关系。结果 54株牦牛STEC菌株呈现高度遗传多态性,可分为31个ST型别,其中包括7个新的等位基因型和17个新的ST型,并存在与HUSEC及主要流行血清群STEC亲缘关系相同或相近的ST型别。结论青藏高原牦牛携带的STEC具有遗传多样性及一定的特异性,部分菌株具有对人致病的潜力。; 孙晖白向宁赵爱兰孟琼熊衍文卢珊; 关键词：产志贺毒素大肠杆菌多位点序列分型牦牛

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卢珊

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