徐士林
- 作品数：36 被引量：169H指数：8
- 供职机构：盐城市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：盐城市医学科技发展计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- ARIMA模型在盐城市肺结核发病率预测中的应用被引量：6
- 2017年
- 目的:探讨差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型在盐城肺结核发病率预测中的应用。方法:利用盐城市2011年1月—2016年12月的肺结核月发病率建立乘积季节ARIMA模型,并评价模型的预测效能。结果:盐城市肺结核预测模型为ARIMA(1,1,0)(2,1,0)12,该模型的参数估计具有统计学意义,拟合优度检验统计量最小标准化贝叶斯信息准则(Normalized BIC)=-0.144,残差序列检验统计量Ljung-Box=0.247(P>0.05),残差为白噪声,模型能够拟合出肺结核的发病趋势。结论:ARIMA模型可以应用于盐城市肺结核发病趋势的预测,对肺结核的预防控制有积极的意义。
- 杨长庆嵇冬静李峰徐士林
- 关键词：肺结核发病率
- 江苏省儿童家长肠道病毒71型灭活疫苗接种意愿和影响因素被引量：10
- 2020年
- 目的掌握江苏省家长为儿童接种肠道病毒71型(EV71)灭活疫苗的意愿和影响因素。方法采样分层随机抽样方法,抽取江苏省三个市6月龄-5岁儿童家长进行面对面在线问卷调查,采用多因素Logistic回归分析EV71疫苗接种意愿的影响因素。结果65.9%(593/900)的家长愿意为孩子接种EV71疫苗。多因素Logistic回归分析显示,居住在苏州市或盐城市、愿意为孩子接种水痘疫苗、手足口病认知高、认为疫苗价格能接受的儿童家长为孩子接种EV71疫苗的意愿率高;而家庭有医学背景者接种意愿率低。结论江苏省儿童家长为孩子接种EV71疫苗的意愿率较高,需进一步加强对儿童家长的EV71疫苗相关知识宣传。
- 嵇红嵇红霍翔张雪峰崔佳佳徐士林徐士林陈立凌许阳婷
- 关键词：手足口病影响因素
- 2016年盐城地区麻疹病毒分子分型及血凝素蛋白基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的 鉴定2016年流行于盐城地区的麻疹野病毒的基因型别,并对血凝素蛋白基因进行分子进化特征分析.方法 通过实时荧光RT-PCR方法对2016年盐城市疑似麻疹病例咽拭子标本进行核酸检测,对麻疹病毒核酸阳性标本RT-PCR扩增核蛋白、血凝素蛋白基因并测序,采用相应的生物信息软件对核苷酸及氨基酸序列比对及基因亲缘关系进化特征分析.结果 2016年盐城地区麻疹病毒经基因型分型为H1a基因亚型和D8基因型.5株H1a代表株与江西代表株（KJ136545）聚集成簇形成独立的进化小分支,属H1a-1进化基因群分支;7株D8代表株与2009年美国代表株（JN635404）聚集成簇,属D8-3-2小分支基因群毒株.与疫苗株沪S191相比,盐城地区5株H1a基因亚型代表株240位氨基酸发生了S240 N的变异,丢失了238位N-连接的糖基化位点,7株D8基因型代表株未发生N-糖基化位点的变化.结论 2016年盐城地区麻疹病毒流行株主要为中国本土H1a优势基因亚型和D8输入基因型;除5株H1a基因亚型代表株丢失了238位N-连接的糖基化位点,盐城地区12株麻疹病毒HA基因大部分重要中和抗原位点未发生变异.
- 陈国清李春香王瑶李峰徐士林李长城邵荣标
- 关键词：麻疹病毒HA基因N基因
- 2013—2017年盐城市流感流行病学特征分析被引量：8
- 2019年
- 目的了解2013-2017年盐城市流感样病例(ILI)流行病学及病原学特征,为流感预防提供理论依据。方法通过中国流感监测信息系统,收集2013—2017年盐城市ILI及实验室检测信息,采用描述性研究方法对监测数据进行分析。结果 2013—2017年共报告ILI 62 999例,各年ILI%差异有统计学意义(P<0.05)。2015-2017年每年均存在冬春季(第1～10周)和夏秋季(第30～36周)两个流行高峰,2013年和2015年秋季流行高峰较为明显。ILI发病人群以<15岁婴幼儿及儿童为主(占88.8%),各年度年龄组构成差异有统计学意义(P<0.05)。流行毒株以甲H1N1型、乙型和甲H3型中的两型交替出现为主。ILI标本阳性率为8.14%,其中甲H1N1占29.85%,季H3占38.20%,B型占30.69%,病毒阳性率峰值与ILI%高峰存在正相关(r=0.562,P <0.001)。≥60岁龄组阳性率(11.62%)高于5～岁组(7.75%)、15～岁组(5.92%),差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄组感染流感核酸型别差异有统计学意义(P<0.05)。流感/ILI暴发疫情共报告25起,主要集中在2017年(14起)、2016年(7起),其中2017年以乙型为主,2016年以季H3型为主。结论 ILI流行时间分布与病毒阳性率趋势一致,流感病毒流行毒株存在年度变异,建议发病高峰期对中小学及托幼机构、老年人群接种流感疫苗。
- 李长城徐士林姜仁杰陈国清王瑶倪慧明
- 关键词：流感样病例流行性感冒流感病毒流行病学特征病原监测
- 盐城市2015-2017年一类疫苗疑似预防接种异常反应监测分析
- 2022年
- 综合分析盐城市2015-2017年一类疫苗疑似预防接种异常反应(AEFI)监测数据。方法:通过收集中国免疫规划信息系统个案数据和流调信息,采用描述性流行病学方法进行分析数据资料。结果:盐城市2015-2017年累计报告3709例AEFI,平均报告发生率91.26/10万剂;男女性别比1.27:1,主要报告年龄组为12月龄以下婴幼儿;AEFI报告地区发生率前三位是大丰区、东台市和阜宁县;AEFI报告以一般反应为主,多数在接种疫苗后0-3天内发生;AEFI报告症状主要为发热、红肿、硬结和哭闹,其中接种麻风疫苗引起发热和皮疹症状、接种百白破疫苗引起哭闹、红肿、硬结、嗜睡、食欲不振、乏力和出汗等症状、接种脊灰疫苗后引起腹泻症状、接种白破疫苗后引起瘙痒症状、接种A群流脑后引起呕吐症状报告发生率均高于其它种类一类疫苗,差异均具有统计学意义。结论:AEFI监测数据分析有利于我市免疫规划工作开展,确保预防接种安全性。
- 于进姚学君管书慧徐士林
- 关键词：疑似预防接种异常反应描述性流行病学
- 2018年盐城市CVA6型肠道病毒全基因组分子特征分析
- 2024年
- 目的掌握盐城市肠道病毒CVA6型基因进化特征。方法对盐城市鉴定为CVA6型的肠道病毒,通过反转录聚合酶链式反应的方法扩增全基因组序列,扩增产物经纯化测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对、分子进化树构建以及重组分析。结果盐城市2018年共检测疑似疱疹性咽峡炎病例107例,肠道病毒核酸阳性率73.83%,其中CVA6、CVA16、其他肠道病毒分别占50.63%、5.06%、44.30%,未检出EV71。选取3株2018年疱疹性咽峡炎、3株2018年手足口病(流行月峰前、峰中、峰后)、1株2017年手足口病CVA6型代表株进行全基因组测序,遗传进化树显示:7株盐城株位于B进化分支B2基因亚群分支,3株疱疹性咽峡炎CVA6型代表株与2株2018年手足口病CVA6型毒株聚集成簇构成一进化小分支,2株手足口病毒株(2017年、2018年各1株)形成独立的进化小分支,形成2条传播链。选取2个进化小分支中疱疹性咽峡炎、手足口病CVA6型各1株,进行分子进化重组分析,均未发现明显的重组来源。结论2018年盐城市疱疹性咽峡炎的病原谱呈现遗传多样性,CVA6型肠道病毒为优势流行株,与手足口病的CVA6型肠道病毒可能有着共同的来源,盐城株未发现基因重组。
- 王瑶陈国清薛宇铭安然李长城徐士林李春香
- 关键词：疱疹性咽峡炎全基因组序列基因重组
- 盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征
- 2021年
- 目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子分型,采用RT-PCR扩增E-18型肠道病毒VP1基因并测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果该起病毒性脑炎聚集性疫情是由E-18型肠道病毒感染引起,其6例病例;肛拭子肠道病毒核酸通用阳性4例,阳性率66.67%;均为轻症,全部治愈。4株E-18型肠道病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失,长度均为861bp、编码287个氨基酸,其核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和100.0%;与2019年E-18型手足口病盐城株(151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%~99.7%和100.0%;与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%~79.1%和93.4%。遗传进化树显示,2019年盐城市4株病毒性脑炎代表株与1株手足口病代表株聚集成簇,构成1个独立进化分支,属于C2基因亚群分支毒株。与原型株Metcalf相比,盐城市4株病毒性脑炎代表株涉及19个氨基酸位点的变异,变异率为6.62%,与1株手足口病代表株在VP1基因B-C loop区域发生了R84N氨基酸位点的变异。结论该起病毒性脑炎聚集疫情由E-18型肠道病毒引起,该病毒属于C2基因亚群优势进化分支,与本地手足口病代表株可能有共同的来源。
- 李春香陈国清王瑶李峰徐士林李长城
- 关键词：病毒性脑炎基因型VP1基因
- 盐城市2010年手足口病流行病学分析被引量：2
- 2011年
- 目的:通过对2010年盐城市手足口病流行病学和病原学特征的分析,为科学防治手足口病提供依据。方法:对全部重症病例和部分普通病例用咽拭子、肛拭子等方法采集标本行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)核酸测定,对疫情监测数据进行流行病学分析。结果:手足口病4 280例中,发病率为50.41/10万,死亡1例(0.02%),手足口病四季均可发病,以春夏季多见,4～7月为发病高峰季节,以托幼机构和散居儿童发病较多,发病率最高年龄段为1～5岁,占87.99%,男性多于女性。病原学监测结果:采样480份,肠道病毒阴性155例,肠道病毒阳性325例,其中EV71型178例(37.08%),其他肠道病毒103例(21.46%)。结论:盐城市手足口病的发生有明显年龄、性别、季节差异,应针对性加强监测,发现疫情尽快采取有效防控措施,避免疫情蔓延。
- 徐士林杨长庆姜仁杰张红军倪慧明
- 关键词：手足口病逆转录-聚合酶链反应儿童流行病学
- 一起耐多药福氏1a志贺菌感染暴发疫情的调查和分子特征
- 2024年
- 目的对发生在江苏省某精神病院的一起细菌性痢疾暴发疫情进行调查分析。方法开展流行病学调查,采集样本进行分离培养和鉴定,对分离到的菌株进行抗生素药物敏感实验和二代测序,对二代测序数据进行耐药基因、毒力基因、系统发育分析,结合流行病学数据进行溯源和传播路径分析。结果从5例病人和1名密切接触者中分离到了6株耐多药福氏1a志贺菌,携带包括超广谱β-内酰胺酶耐药基因、磺胺类耐药基因和喹诺酮类高水平耐药突变位点等多种耐药基因。系统发育分析发现6株菌高度同源,菌株可能来自于本地或者周边设区市,分离自无症状感染者的菌株的耐药差异来自于质粒的丢失。结论本次疫情由耐多药福氏1a志贺菌引起,应关注该型别的耐药菌株,加强特殊场所、特殊人群的菌痢防控,并在未来疫情调查中推广二代测序和相应生物信息学分析。
- 彭杰夫姜仁杰董晨徐士林艾静周璐钱慧敏
- 关键词：志贺菌精神病院耐多药分子特征分析
- 盐城市2012—2023年手足口病流行特征及病原学变化分析
- 2024年
- 目的:分析盐城市2012—2023年手足口病流行特征和病原学变化,为制定有效防治措施提供依据。方法:选取中国疾病预防控制信息系统报告数据,描述性分析2012—2023年盐城市手足口病发病及病原学检测结果,采用Cox-Stuart进行时间序列趋势检验,中断时间序列法评价EV-A71疫苗应用前后手足口病发病变化趋势。结果:2012—2023年盐城市累计报告手足口病例69 172例,年均发病率(46.87~147.63)/10万。发病高峰多位于春夏季,发病居于前3位的县(市、区)分别为亭湖区、盐都区、东台市,发病年龄主要集中在5岁及以下,男女性别比为1.56∶1。2012—2023年优势病原逐步由EV-A71型转为CVA6、16型。EV-A71疫苗接种措施实施前后EV-A71感染手足口估算发病率、手足口病重症发病率均呈下降趋势。结论:江苏省盐城市应进一步加强手足口病春夏季防控工作,重点关注5岁及以下儿童,重点防控地区为大市区,当前优势病原以CVA6、16型为主。
- 徐士林杨长庆李长城张瑞萍
- 关键词：手足口病病原学
