李天宇 作品数:10 被引量:2 H指数:1 供职机构: 广西医科大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广西壮族自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 轻工技术与工程 更多>>
利用CRISPR/Cas9筛选膀胱癌T24细胞生长必需基因 2020年 目的:利用CRISPR/Cas9基因编辑技术,筛选维持膀胱癌T24细胞正常生长必需基因,为膀胱癌靶向治疗提供新的思路。方法:将人全基因组文库质粒进行扩繁并包装慢病毒,然后感染T24野生型细胞,用嘌呤霉素(puromycin)进行筛选。为了获取T24细胞生长必需基因表达变化情况,分别收集第1天的活细胞作为对照组,培养第14天的细胞作为实验组,分别提取两组细胞DNA,进行全基因组测序和生物信息学分析获得候选基因。对候选基因进行功能注释和通路分析,并结合TCGA数据库进行生存分析,了解这些基因的主要富集通路及对预后的影响。结果:筛选出了971个可能维持膀胱癌细胞正常生长的必需基因,这些基因主要富集在脂质代谢、糖代谢、细胞周期和蛋白质合成等通路中,其中部分基因可能影响膀胱癌预后。结论:本研究对于进一步验证这些基因在膀胱癌T24细胞中的功能和机制具有重要意义。 韦连心 陶玉婷 黄浩轩 冯超 陆钦晨 李天宇 李天宇关键词:膀胱癌 CD45^(+)CD326^(+)双阳性细胞的特征及其在膀胱癌预后预测中的作用 2024年 目的探讨CD45^(+)CD326^(+)双阳性细胞(double positive cells,DPCs)对膀胱癌预后的影响,并构建膀胱癌DPCs相关基因评分系统,探究不同DPCs评分膀胱癌患者肿瘤微环境的特征。方法采用单细胞测序技术分析DPCs的分子特征,质谱流式技术分析DPCs高比例组和低比例组患者的肿瘤微环境异质性。基于TCGA‐BLCA队列,根据DPCs的特征基因构建评分系统,并在GSE13507队列及GSE32894队列中进行验证。结果膀胱癌患者中DPCs高比例组患者的预后较低比例组患者的预后差(P=0.0158),且高、低比例组患者的肿瘤微环境存在异质性,高比例组患者较低比例患者的免疫细胞和肿瘤细胞有更高的免疫检查点、共抑制因子和共激活因子的表达水平(均P<0.05);基于TCGA‐BLCA队列构建了9个基因(APOBEC3G、CD96、CLEC2D、GNG2、GNLY、IL32、PSMB9、RORA、SKAP1)的膀胱癌DPCs相关基因评分系统。TCGA‐BLCA队列、GSE13507队列和GSE32894队列分析结果显示,高风险评分组膀胱癌患者的总生存期明显比低DPCs评分组短(均P<0.01)。免疫抑制、雌激素等信号通路在高风险评分组中显著富集。结论DPCs与膀胱癌不良预后密切相关,基于DPCs特征基因构建的模型可较准确地预测膀胱癌患者的临床预后。 刘桧 莫晗 冯超 谢远亮 王秋雁 王秋雁关键词:膀胱癌 肿瘤微环境 利用多中心数据整合分析研究复杂疾病的遗传信息与应用 胡艳玲 陈阳 空缺 李健玲 李柳铭 莫曾南 周青鸟 黄远洁 李天宇 陈铭伍 冼磊 余小祥 随着高通量生物检测数据及相关研究文献的产生,充分挖掘这些宝贵信息资源对挖掘疾病相关靶点非常重要。该项目通过开发新的软件程序及算法,整合该实验室及公共多中心基因组数据,开展对复杂疾病相关遗传信息分析,为了解复杂疾病发病机制...关键词:关键词:复杂疾病 生物信息学 生物医学 基于组学技术分析lncRNA MBNL1-AS1对Basal型肌层浸润性膀胱癌的分子特征影响 2025年 目的探究肌层浸润性膀胱癌(muscle-invasive bladder cancer,MIBC)分子亚型特异性,为不同MIBC分子亚型患者的治疗提供指导。方法基于MIBC分子分型方法中的UNC分型法,应用转录组测序数据,将48例MIBC患者分为2种分子亚型即Basal型和Luminal型,并进行差异表达分析以探究MIBC特异性的lncRNAs,并进一步探讨其分子特征和临床意义。结合单细胞质谱流式细胞术(single-cell mass cytometry,CyTOF)和镜像质谱流式细胞术(imaging mass cytometry,IMC)分析MBNL1-AS1高表达组和低表达组Basal型MIBC患者的免疫微环境异质性。结果基于分子分型法筛选发现了在MIBC特异性表达的lncRNA MBNL1-AS1,其低表达与Basal型MIBC患者的不良预后密切相关(P=0.022)。且进一步分析转录组测序数据后发现,在Basal型MIBC中,MBNL1-AS1低表达组具有去分化(P=0.008)、高干性(P=0.020)和高增殖(P=0.010)的特征。MBNL1-AS1低表达组的Basal型MIBC患者的免疫评分与NK CD56bright细胞和Treg细胞的评分呈负相关(P<0.05),而MBNL1-AS1高表达组的B细胞和CD8+T细胞相关基因的表达水平较高。高维度单细胞蛋白质组学分析结果显示,MBNL1-AS1低表达的Basal型MIBC患者表现出较高的Treg细胞亚群丰度(P=0.016)。结论MBNL1-AS1低表达组的Basal型MIBC患者具有去分化、高干性、高增殖和免疫抑制的特点。MBNL1-AS1具有作为Basal型MIBC免疫响应生物标志物的潜能。 梁双 谢远亮 冯超 陆钦晨 陶玉婷 吕宇琦 李天宇 李天宇 王秋雁基于雄激素受体相关基因评分系统在膀胱癌预后预测中的作用及临床意义 2023年 目的 构建膀胱癌雄激素受体(androgen receptors,AR)相关基因评分系统,并探究不同AR评分膀胱癌患者肿瘤微环境特征。方法 基于TCGA-BLCA队列,根据文献报道中的AR相关基因集,构建评分系统,并在GSE-13507队列及自有的29例膀胱癌临床样本中进行验证;应用转录组学和高通量的单细胞质谱流式技术揭示高AR评分组及低AR评分组膀胱癌患者的分子特征及肿瘤微环境异质性。结果 基于TCGA-BLCA队列构建了膀胱癌AR相关基因评分系统。TCGA-BLCA队列和GSE-13507队列分析结果显示,高AR评分组膀胱癌患者的总生存期(overall survival,OS)明显比低AR评分组差(P=0.009,0.010);临床样本分析结果虽然无明显统计学意义但同样显示高AR评分组患者的OS较低AR评分组患者差(P=0.180),且高AR评分组患者的临床分期更晚,病理分级更高。高AR评分组与低AR评分组患者具有不同的分子特征,且肿瘤微环境存在异质性,其中免疫抑制性CD4+T细胞亚群13以及具有免疫抑制表型特征的肿瘤干样细胞亚群13在高AR评分组富集。结论 本研究构建了一个AR相关基因的评分系统,其中高AR评分组患者的预后较低AR评分组患者差,且高AR评分组患者的肿瘤微环境免疫抑制状态更严重,其免疫治疗响应可能更高,更适合进行免疫治疗。 莫晗 刘桧 冯超 谢远亮 王秋雁 王秋雁关键词:膀胱癌 雄激素受体 肿瘤微环境 肾脏良性肿瘤的诊断与治疗(附76例报告) 目的:提高对肾脏良性肿瘤诊断和治疗的认识,探讨其诊治方法。
方法:对我院2000年1月~2008年6月收治的76例肾脏良性肿瘤患者的临床资料进行回顾性分析,并复习相关文献。
结果:因体检或其他疾病就诊... 李天宇关键词:肾脏肿瘤 肿瘤诊断 肿瘤治疗 文献传递 膀胱癌代谢风险模型的构建及其应用 被引量:1 2023年 目的:建立一个高效能的膀胱癌(BLCA)代谢风险模型,并应用多组学技术揭示不同风险人群的异质性特征。方法:利用TCGA-BLCA转录组数据,根据86条代谢通路中共1 660个代谢相关的基因,应用单因素COX分析、Lasso回归分析和多因素COX分析,构建BLCA代谢风险模型;应用转录组学、代谢组学和单细胞蛋白质组学技术揭示高风险和低风险人群的分子表达谱、代谢物表达谱及免疫微环境特征。结果:构建了一个由CYP2J2、GDPD3、IL4I1、ATP6V1B1、AKR1B1、ENGASE、CHPF、MBOAT7、CAD、FASN、AHCY、FLAD1和ALG3 13个基因组成的BLCA代谢风险模型;训练队列对应的受试者工作特征(ROC)曲线预测BLCA患者1年、3年和5年总生存期(OS)的曲线下面积(AUC)分别为0.796、0.702和0.717,广西队列对应的ROC曲线预测BLCA患者1年、2年和3年OS的AUC分别为0.866、0.810和0.816;Kaplan-Meier曲线分析显示,低风险组预后显著优于高风险组(P<0.001);高风险组和低风险组患者的代谢物存在显著改变,在高风险组中富集了焦谷氨酸、柠檬酸和尿酸等代谢物;高风险组患者募集了更多的免疫抑制性细胞亚群,免疫抑制程度更高。结论:本研究构建的代谢风险模型可较为准确地预测BLCA患者的临床预后;不同代谢风险模式的BLCA患者的代谢物和免疫微环境的异质性特征,为BLCA精准治疗方案的开发提供了潜在靶点。 宋鹏帆 何亮余 冯超 王秋雁 李天宇关键词:膀胱癌 代谢 肿瘤预后 免疫微环境 膀胱癌细胞新型信号通路以及药物干预研究 研究背景:膀胱癌是泌尿生殖系统中最常见的恶性肿瘤,其发生、发展是多因素作用的结果,目前缺乏有效的诊治手段。SUMO化修饰是蛋白质翻译后修饰的一种重要形式,参与基因表达调控、DNA损伤等多种细胞过程。SUMO化通路在多种肿... 李天宇关键词:膀胱癌 SUMO化修饰 基因调控网络 药物干预 海参低聚肽在延缓衰老和改善脑功能衰退药物及保健和功能性食品中的应用 本发明公开了生物医药和保健食品技术领域的海参低聚肽在延缓衰老和改善脑功能衰退药物及保健和功能性食品中的应用,海参低聚肽中的低聚肽蛋白含量为85‑95%;海参低聚肽中分子量小于2000Da肽的比例大于98.72%,分子量小... 黄照权 冯超 郭宏伟 苏志恒 卢覃培 叶雨 李天宇 寿昳雯 吴书林一种便于内窥镜下使用的腔内注射装置 本实用新型涉及一种便于内窥镜下使用的腔内注射装置,包括注射器和两端开口内部中空的外壳,外壳包括调节部、连接部和弹性部,弹性部放置在调节部和连接部之间且相互连通,调节部可相对于连接部摆动;注射器包括注射筒、输液管和针头,输... 莫曾南 鲁文浩 颜赟坤 李天宇文献传递