李晓琴
- 作品数：25 被引量：65H指数：5
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- 相关领域：生物学医药卫生理学更多>>
- 遗传密码突变危险性的全局极小
- 2000年
- 建立遗传密码稳定性的数学理论 ,给出遗传密码总体突变危险性的一个数学定义 ,由此出发讨论它的全局极小化 ,求出突变危险性全局极小化的密码表 ,并研究在什么条件下可以导出标准密码表 .
- 罗辽复李晓琴
- 关键词：遗传密码
- 氨基酸组成聚类、蛋白质结构型和结构型的预测被引量：20
- 1998年
- 用信息聚类方法对蛋白质的氨基酸组成进行聚类，发现存在梯级成团（大集团分解成小集团）现象，６４５个蛋白质可分成１５个小集团，每一个小集团与蛋白质二级结构含量决定的结构型有一定相关性，但与蛋白质五大结构型相关性不明显。指出了由氨基酸成分和二级结构含量预测结构型的方案中存在的问题。提出了由蛋白质二级结构序列预测蛋白质结构型的新方法。
- 李晓琴罗辽复
- 关键词：氨基酸组成信息聚类蛋白质
- miR-3653-3p和miR-3200-5p在人非小细胞肺癌细胞中作用及调节研究
- miRNAs是一类内源性约21-23个核苷酸长度的非编码RNA，研究表明miRNAs参与多种生命过程的调节，其异常表达常与疾病发生相关，是潜在的肿瘤诊断及预后标志物。本研究比较了正常细胞和非小细胞肺癌细胞中miR-365...
- 李晓琴
- 关键词：非小细胞肺癌肿瘤诊断细胞增殖
- 文献传递
- 由氨基酸序列预测蛋白质二级结构的进一步研究被引量：2
- 1992年
- 本文在工作[1][2]的基础上进一步研究了蛋白质二级结构的经验预测,着重讨论了如何制定预测规则的问题,并将预测工作计算机化.在蛋白质资料库中随机选取了21个蛋白质(3296残基)进行预测,正确率对α螺旋和β折迭分别为84.4%和81.9%.
- 李晓琴罗辽复
- 关键词：蛋白氨基酸序列
- 蛋白质的二级结构序列和结构型被引量：4
- 2002年
- 从蛋白质的二级结构序列出发 ,提出了冗余的概念 ,定义了冗余数量和冗余长度 ,给出了不同结构型蛋白的冗余数量和长度的分布特性 .统计结果表明 α类蛋白中 30 %、β类蛋白中84 %、α/β类蛋白中 95 %的序列不同程度的存在冗余 ,冗余数量和冗余长度主要分布在 1～ 3的范围 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用信息聚类方法对 α类、β类、α/ β类、α+ β类的6 0 0个蛋白进行了聚类 ,结果表明 ,对冗余较少的α类蛋白 85 %以上能够较好地聚类在一枝中 ,但对于冗余较多的其它类蛋白不能分在一个大支中 ,大部分可以分散在多个小支中 .以主二级结构序列三联体为参数 ,利用 Mahalanobis距离方法对上述四种结构型进行预测 ,预测的总体准确率为 81 .1 % .聚类结果和利用 Mahalanobis距离分类结果充分展示了蛋白质二级结构序列对结构型的特殊作用 ,但由于冗余的影响使得二级结构序列的信息并未充分显示出来 .
- 李晓琴王守源罗辽复
- 关键词：二级结构序列信息聚类冗余结构蛋白质
- 蛋白质结构型的定义和识别被引量：6
- 2002年
- 提出紧结构域的概念 ,由二级结构序列中一段或几段连续的α螺旋和 β折叠构成的空间紧密堆集的最大折叠体称为紧结构域 .利用 3种紧结构域 (α域 ,β域和α/β域 )定义球蛋白的 5种结构型 :α型蛋白 ,β型蛋白 ,α/β型蛋白 ,多域蛋白和 ζ型蛋白 .将 12 6 1个代表性的蛋白质 (10 2 2家族 )进行分类 ,并和SCOP库的分类做了比较 .进行了删去序列冗余的分析 .在此基础上提出结构型的预测方案 ,成功率在 82 %～ 85 %.
- 李晓琴罗辽复
- 关键词：蛋白质结构型二级结构序列
- 蛋白质结构型的识别方法被引量：1
- 2002年
- 给出了α型、β型、α/ β型、多域型蛋白质二级结构主序列六联体的分布规律 .提出了根据蛋白质二级结构主序列对蛋白质结构型进行识别 (分类 )的方法 .以蛋白质二级结构主序列三联体为参数 ,利用Mahalanobis距离方法对上述 4种结构型的蛋白质进行识别 ,分类的总体准确率为 81% ;以二级结构主序列中六联体的频数构成蛋白质结构的多样性源 ,利用多样性增量极小化对上述 4种结构型进行识别 ,分类的总体准确率为 83% .
- 李晓琴罗辽复
- 关键词：蛋白质结构型识别方法二级结构序列
- 由蛋白质二级结构序列预测拓扑结构
- 1997年
- 提出由蛋白质二级结构序列预测拓扑结构的方案，对全ａ全β和α／β型蛋白质制定了预测规则，预测成功率为８５％～９０％。
- 罗辽复李晓琴
- 关键词：蛋白质拓扑结构
- 蛋白质二级结构由氨基酸和 m RNA序列编码(英文)被引量：2
- 2001年
- 据氨基酸序列 ,密码子序列和蛋白质二级结构序列的比较 ,指出约 1 8%的两肽的密码子具有反常的蛋白质结构偏好性 ,并且这种反常不能用随机涨落解释 。
- 李晓琴刘次全罗辽复
- 关键词：MRNA序列氨基酸序列
- 同义密码子的反常蛋白质二级结构偏好性被引量：4
- 2003年
- 统计分析了 119种人蛋白质和 92种大肠杆菌蛋白质的mRNA序列和蛋白质二级结构的关系 .从二肽频数出发 ,研究了同义密码子使用对蛋白质二级结构的影响 ,证明其影响在 10 %到 2 0 %的量级 .对于人和大肠杆菌 ,在 90 %置信水平上 ,4 0 0对二肽中分别有 79对和 6 0对 ,在 95 %置信水平上 ,分别有 4 5对和 36对二肽的相应密码子二联体具有不同于氨基酸的反常二级结构偏好性 。
- 李晓琴罗辽复刘次全
- 关键词：同义密码子MRNA序列
