杨阳
- 作品数:7 被引量:8H指数:2
- 供职机构:安徽医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基因组不稳定相关LncRNA模型预测结肠癌患者预后和顺铂药物敏感性
- 2023年
- 目的探索结肠癌基因组不稳定性相关的长链非编码RNA(LncRNA)和其预测临床预后及治疗的潜力。方法差异分析采用R包“limma”,使用单因素Cox分析和多变量Cox比例风险回归分析构建预后风险模型。预后差异采用Kaplan-Meier法评价,log-rank检验差异显著性。预后模型能效通过时间依赖的受试者工作特征曲线下面积(AUC)进行评价。使用R包“pRRophetic”对患者进行抗癌药物敏感性预测。使用R软件包rms建立了列线图,并计算列线图总体的一致性指数。应用实时荧光定量PCR法检测预后保护因素表达水平差异。结果共获得22个与患者预后基因组不稳定相关LncRNAs,2个为结肠癌患者预后的保护因素,20个为预后危险因素。构建了一个基因组不稳定相关LncRNAs构成的预后模型,高风险评分的患者的AUC更低,中位生存期更短。该模型预测五年生存的AUC在训练集中为0.823,在验证集中为0.722,在总体TCGA结肠癌患者中为0.759。低风险评分的患者顺铂的半数抑制浓度(IC 50)更低,敏感性更高(P<0.0001)。结肠癌组织中预后保护因素的表达显著低于结肠癌旁组织。结论构建一个由8个基因组不稳定相关LncRNAs组成的预后预测风险模型,并加以验证。此外,该模型还可以预测顺铂药物的敏感性。结合肿瘤分期(stage)和该预后模型构建一个列线图。该列线图对于结肠癌患者五年生存的预后预测能力要优于传统的组织病理学特征和前人所构建的预后模型。
- 童曈杨阳余昌俊方昌义
- 关键词:结肠癌肿瘤预后基因组不稳定长链非编码RNA
- 亚甲基四氢叶酸还原酶基因、纤溶酶原激活剂抑制物-1基因多态性与早产及痉挛型脑性瘫痪的关系被引量:4
- 2010年
- 目的研究亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因、纤溶酶原激活剂抑制物-1(PAI-1)基因多态性与早产及痉挛型脑性瘫痪(CP)的相关性,探讨MTHFR基因、PAI-1基因在早产及痉挛型CP发病中的作用。方法采用病例对照研究,研究对象分为4组:早产痉挛型CP组(n=103)、足月HIE+CP组(n=162)、早产组(n=101)、健康足月组(n=171),后2组作为对照组。抽取研究对象外周静脉血1 mL,应用PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)技术检测MTHFR基因C677T、MTHFR基因A1298C和PAI-1基因启动子675位点4G/5G基因多态性。分析基因型分布与早产、痉挛型CP发病的相关性。结果 MTHFR基因677位点T等位基因频率在早产儿和早产CP患儿与足月儿中有统计学差异(χ2=9.94,P<0.01)。MTHFR基因C677T的TT纯合子突变在CP患儿和对照组儿童均与早产的发生呈正相关,MTHFR基因C677T的TT纯合子突变在CP患儿和对照组儿童与痉挛型CP发生均无统计学相关。MTHFR基因1 298位点C等位基因频率和PAI-1基因启动子675位点4G等位基因频率在CP患儿和对照组儿童中均无统计学差异(χ2=2.18、2.36,Pa>0.05)。MTHFR A1298C基因突变和PAI-1基因启动子675位点4G/5G基因多态性的4G/4G基因型与我国儿童早产及痉挛型CP发生均无显著相关性。结论 MTHFR基因C677T的TT基因型与早产的发生显著相关,与痉挛型CP的发生无显著相关。MTHFR基因A1298C和PAI-1基因启动子675位点4G/5G多态性与早产及痉挛型CP的发生均无显著相关。
- 杨阳金岚袁金晶吴德尚清吴丽韩雪梁兵徐玲唐久来
- 关键词:早产痉挛型脑性瘫痪亚甲基四氢叶酸还原酶纤溶酶原激活剂抑制物-1基因多态性
- 直肠癌中HuR表达水平及其对新辅助放化疗所致DNA损伤效应的影响被引量:1
- 2021年
- 目的探讨RNA结合蛋白人类抗原R(HuR)在直肠癌组织中的表达水平及其对新辅助放化疗所致DNA损伤效应的影响。方法收集并检测56例中低位(定义为经硬质结/直肠镜测量肿瘤下缘距肛缘≤12 cm)直肠腺癌组织标本对中的HuR表达水平,并分析HuR相对表达水平与患者术后临床病理参数之间的联系。采集并运用免疫组化检测33例初始评估无法根治性切除且行新辅助放化疗的中低位直肠癌患者的肠镜活检石蜡包埋组织标本中的HuR蛋白表达水平,分析其相对表达水平是否影响中低位直肠癌新辅助放化疗的临床客观缓解率。同时在细胞水平(直肠癌细胞株DLD-1)检测HuR水平对电离辐射及化学药物5-氟尿嘧啶(5-FU)所致DNA损伤效应的影响。结果中低位直肠癌组织中HuR蛋白阳性表达率增高,且HuR阳性表达的中低位直肠癌患者的新辅助放化疗临床客观缓解率差于HuR低表达者,差异有统计学意义(P<0.05)。细胞水平彗星实验(Comet assay)显示在直肠癌细胞中敲减HuR表达水平,可增加电离辐射及化疗药物引起的DNA双链断裂(DSBs)的累积。结论HuR高表达的中低位直肠癌患者的新辅助放化疗临床客观缓解率较低,可能与DNA损伤效应机制有关,HuR高表达是导致直肠癌患者放化疗抵抗的关键因素。
- 方昌义杨明威李韵松杨阳何佳慧余昌俊
- 关键词:直肠癌DNA损伤
- 宫内感染致脑性瘫痪的机制研究进展
- 2011年
- 宫内感染是小儿脑性瘫痪最常见的病因之一,其对脑组织的损伤包括直接机制和间接机制。随着直接溶细胞感染、脑水肿和脑室扩大以及脑室管膜炎等直接机制的阐明,宫内感染所致脑性瘫痪的间接机制研究成为该领域的热点。除炎症介质和神经发育相关因子下凋学说外,胎盘分泌激素紊乱、Notch穿膜受体活性改变以及基因突变/缺失等也是导致脑损伤的重要因素,且各机制之间相互作用,形成网络化效应。
- 杨阳吴德唐久来
- 关键词:脑性瘫痪宫内感染炎症因子
- 孕早期HCMV感染对子代大鼠海马钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅱ表达的影响
- 唐久来袁晶晶吴德杨阳杨李许晓燕
- 文献传递
- 低氧诱导因子-1α基因C1772T/G1790A多态性与HIE及HIE致脑性瘫痪的关系被引量:3
- 2010年
- 目的探讨低氧诱导因子-1α(HIF-1α)基因C1772T/G1790A的单核苷酸多态性与缺氧缺血性脑病(HIE)及HIE致脑性瘫痪(脑瘫)的关系。方法选择HIE足月新生儿78例(A组)及健康儿童100例(B组)、有明确HIE病史的足月脑瘫患儿92例(C组)作为研究对象。抽取外周静脉血,参照DNA提取试剂盒说明提取基因组DNA,PCR扩增目的基因,酶切鉴定后进行统计学分析。结果 A组、B组、C组的胎龄、出生体质量、性别及喂养方式比较差异均无统计学意义(Pa>0.05);A组HIF-1α基因C1772T基因型CT型所占较多(30.77%),B组、C组HIF-1α基因C1772T基因型CT型所占较少(分别为18.00%和19.57%);A组、B组、C组的HIF-1α基因C1772T基因型分布差异有统计学意义(P<0.05);A组轻度、中度、重度HIE患儿HIF-1α基因C1772T基因型分布比较差异无统计学意义(P>0.05),C组轻度、中度、重度HIE患儿HIF-1α基因C1772T基因型分布比较差异有统计学意义(P<0.05)。A组、B组HIF-α基因G1790A基因型分布不符合Hardy-Weinberg平衡检验(P<0.05)。结论 HIF-1α基因C1772T的单核苷酸多态性与新生儿HIE密切相关;HIF-1α基因C1772T基因型CT型在HIE患儿中起一定的脑保护作用,可能会减少HIE所致脑瘫的发生。
- 袁金晶李冰吴德杨阳杨亚丽徐玲童光磊梁兵唐久来
- 关键词:缺氧缺血性脑病脑性瘫痪
- 先天性HCMV感染大鼠海马区突触素Ⅰ表达的研究
- 唐久来杨阳吴德杨李袁晶晶许晓燕
- 文献传递