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王磊: 作品数：16 被引量：78H指数：6; 供职机构：信阳师范学院生命科学学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金河南省科技攻关计划河南省教育厅科学技术研究重点项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>

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大别山区特色经济作物茶树和大豆功能基因生物信息分析及高效筛选: 程琳袁红雨江昌俊王磊谢素霞柯丹霞潘晓东连帅彬宫安东张在宝; 大别山区位于中国南北过渡带，2008年，国家环境保护部和中国科学院共同发布“全国生态功能区划”，进一步明确了大别山为国家重要生态功能区。该区域主要以农业经济为主，据调查，境内具有重要科研和经济价值的动、植物达1000余种...; 关键词：; 关键词：茶树大豆经济作物生物信息学

茶树内生菌的应用性研究进展被引量：10: 2017年; 茶树为多年生植物,在长期的自然选择和进化过程中,已形成种群类型丰富且功能多样的内生微生物菌群.在茶树的不同生长阶段中,其内生菌的种群类型、数量、分布及生物学功能等均存在明显差异.内生菌在防治病害、促进生长、降解有机农药、促进风味形成,以及改善Al 3+毒耐受性等方面发挥了重要作用.; 宫安东韩萌真孔宪巍魏彦博王磊程琳; 关键词：茶树内生菌生物多样性

莲藕节水高产栽培技术被引量：16: 2007年; 从节水角度出发,阐述了莲藕保护地栽培技术和节水栽培技术。; 肖琳黄新华庞瑞华王磊李宴会; 关键词：莲藕保护地栽培节水栽培

类风湿关节炎患者外周血环状RNA表达谱研究被引量：6: 2016年; 目的筛选RA患者外周血中差异性表达的环状RNA（circRNA）并进行生物信息学分析，以探讨外周血circRNA在RA发病中的作用。方法采用circRNA芯片对3例RA患者和3名健康对照的外周血中的circRNA进行筛查，用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理，通过Fold Change和P值进行筛选，采用t检验，寻找2组样本间差异表达的circRNA，并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析。结果芯片筛查结果提示有36个circRNA在RA组和对照组之间差异有统计学意义，14个。ircRNA下调，22个circRNA上调。对这些circRNA所涉及的基因进行基因本体论（GO）分析，结果提示，这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等。对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测，其中有1个circRNA（hsa_cire_0005397）预测结果中有1个miRNA（hsa—miR-125a-3p）在文献中得到验证，用CvtoscaDe软件对三者之间的网络关系进行了预测。结论RA患者外周血中的circRNA出现多个差异性表达，circRNA可能参与RA调控机制。; 宋新强张丽丽赵仕琪汪学群王磊陈磊曾宪思; 关键词：靶基因生物信息学

水稻初花期喷施油菜素内酯的生理效应及增产作用被引量：10: 2007年; 在特种稻黑宝3号的初花期喷施0.005～0.020 mg/L油菜素内酯(BR),剑叶中的叶绿素、可溶性糖、淀粉含量提高,光合速率增强,灌浆速率增大,结实率和千粒重增加,比对照增产10.18%～12.85%,对黑糙米中花青苷含量无影响。; 肖琳庞瑞华蔡荣先于萍黄新华王磊; 关键词：水稻油菜素内酯花青苷

雷公藤红素治疗类风湿关节炎的组学联合分析被引量：2: 2022年; 用雷公藤红素处理成纤维样滑膜细胞,通过RNA测序、定量蛋白质组学、分子对接、qPCR和Western blot检测和验证,筛选到差异基因和蛋白质,获得7803个基因和3372个蛋白质,雷公藤红素作用机制与氧化应激和氧气水平高低相关,也涉及细胞组分和细胞外基质蛋白的稳定和合成通路。结果显示,雷公藤红素可通过这些机制来抑制类风湿关节炎的发病。; 宋新强任雨轩代二琴张玉何欢欢范金克赵丽君彭涛王磊; 关键词：类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞雷公藤红素蛋白质组分子对接

茶树己糖磷酸转运器基因GPT的克隆及表达被引量：1: 2016年; Cs-Ev17(Gen Bank登录号:GH618812)为一受假眼小绿叶蝉取食诱导的茶树葡萄糖-6-磷酸/磷酸转运体基因的c DNA片段,采用RACE技术克隆该基因的全长c DNA序列,命名为Cs GPT(Gen Bank登录号:FJ648829)。其全长为1 514 bp,包含一个编码401个氨基酸的开放性阅读框,5'-UTR和3'-UTR的长度分别是27bp和253 bp,其中,3'-UTR具有一个poly(A)加尾信号序列(AATAAA)。生物信息学分析显示,Cs GPT的转运肽由78个氨基酸组成,具有8个跨膜区。序列分析显示,Cs GPT与拟南芥的GPT2、可可的GPT2和蓖麻的GPT2的一致性分别为80%、80%和73%。荧光定量PCR结果显示,Cs GPT在叶片中的表达受假眼小绿叶蝉取食和茉莉酸的诱导。; 张娅婷孙楠刘瑞瑞韩雅彭程琳王磊袁红雨; 关键词：茶树基因表达

基于分子对接技术筛选抗新型冠状病毒的中药活性成分被引量：5: 2020年; 运用ADME/T预测进行首轮筛选中药数据库TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)中的化学成分,然后分别以(刺突糖蛋白,Spike glycoprotein,简称S蛋白)和ACE2蛋白(血管紧张素转化酶2,Angiotensin Converting Enzyme 2,ACE2)为靶点,采用YASARA和AutoDock VINA进行第二轮虚拟筛选,最后基于靶点与药物相互作用位点对候选药物分子进行相互作用分析.从TCMSP数据库中筛选出425个候选中药成分,以S蛋白为靶点,筛选出中药成分有12个,包含在青蒿、丹参、黄芩、半夏、甘草、柴胡等;以ACE2为靶点,筛选出中药成分有77个,包含在丹参、甘草、黄芩、麻黄、杏仁、柴胡等,并最终找到潜在的抑制剂分子鼠尾草酚酮和二氢丹参内酯.; 宋新强张玉代二琴余亚军王磊杜宏涛; 关键词：分子对接新型冠状病毒 S蛋白

一个新的茶树黄酮醇合酶基因的克隆和表达分析被引量：6: 2009年; Cs-COR113(GenBank登录号:FE942098)为一受冷诱导的茶树黄酮醇合酶基因的cDNA片段,采用RACE技术克隆了这一基因的全长cDNA,命名为CsFLS(GenBank登录号:FJ577509)。CsFLS cDNA序列全长为1303bp,5'-UTR和3'-UTR分别长91bp和175bp,包含一个编码336个氨基酸的完整开放阅读框。序列分析显示,CsFLS与烟草、矮牵牛、欧芹、拟南芥的黄酮醇合酶的同源性分别为74%、75%、75%和63%,含有2-酮戊二酸依赖性双加氧酶家族2个保守的基序,以及与黄酮醇合酶正确折叠有关的2个保守的甘氨酸残基。CsFLS的表达受低温诱导,但不受ABA诱导。; 谢素霞张媛郭凯琳王磊袁红雨; 关键词：茶树基因表达

大豆GmHAT5的克隆及其转基因百脉根的抗盐分析被引量：12: 2017年; 【目的】从大豆盐胁迫基因表达谱中筛选并克隆得到同源异型域亮氨酸拉链蛋白(HD-Zip)家族基因GmHAT5,将其转化豆科模式植物百脉根并进一步探究其抗盐调控机制。【方法】使用多种生物信息学软件对GmHAT5的开放读码框(ORF)、编码蛋白的分子量、等电点、序列结构和蛋白定位等进行预测,同时将大豆GmHAT5蛋白与其他10个物种的同源蛋白进行比对分析,并对GmHAT5在大豆不同器官及盐胁迫下的表达特性进行分析。此外,构建GmHAT5的植物超表达载体,通过对发根农杆菌LBA1334的转化,得到"复合体"百脉根植株,并在盐胁迫条件下对其进行抗盐表型分析;通过对根癌农杆菌EHA105的转化,获得百脉根的稳定转化株系,并对其进行抗盐表型分析及相关生理指标检测。【结果】多种生物信息学软件分析表明,该片段包含1个1 038 bp的ORF,编码345个氨基酸。GmHAT5的理论分子量和等电点分别为39.17 k D和4.63。GmHAT5蛋白定位于细胞核,与其他HD-Zip家族蛋白一样,属于典型的核蛋白。序列分析表明,GmHAT5包含一个同源异型结构域和一个亮氨酸拉链结构域,属于第I类同源异型域亮氨酸拉链蛋白。同源蛋白比对表明其与野生大豆GsHAT5同源性最高。基因表达特性分析表明,GmHAT5在大豆植株的各个不同器官中均有表达,是一个受盐诱导上调表达的HD-Zip类转录因子。发状根转化的结果表明,使用200 mmol·L^(-1) NaCl处理植株7 d后,"复合体"植株生长状态良好,对照组植株叶片明显萎蔫、失绿;不同NaCl浓度处理离体转基因发状根14 d后,对照组较试验组发状根明显干枯、生长受到抑制。稳定转化结果显示,不同盐浓度处理14 d后,转GmHAT5百脉根与两组对照植株相比生长状态更好。相关生理指标检测结果显示,与两组对照相比,转基因百脉根植株中丙二醛含量和相对质膜透性明显降低(P<0.05),而叶绿素含量和根系活力则�; 柯丹霞李祥永王磊程琳刘永辉李小艳王慧芳; 关键词：大豆转录因子百脉根耐盐性

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