王秋锦
- 作品数:7 被引量:51H指数:4
- 供职机构:北京农学院生物技术学院更多>>
- 发文基金:北京市自然科学基金农业部园艺作物遗传改良重点开放实验室项目更多>>
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- 用基于反转录转座子的分子标记IRAP分析茄子品种的遗传多样性
- 2009年
- IRAP(Inter Retrotransposon Amplified Polymorphism)是一种基于反转录转座子的分子标记技术。本文应用几种Copia类型的反转录转座子进行引物设计,封35份茄子栽培品种进行了基于IRAP的遗传多样性分析。根据Tnt1,Tto1,Tnd-1和Bare-1设计的6个引物共扩增出195条带,多态性带179条,多态性比率平均为91.8%,每个引物检测到多态性带25.33条,平均为29.8条。Nei’s遗传相似系数在0.3540-0.7752之间,平均相似系数为0.5901。多维尺度分析从分子水平将供试品种分为4个类群。
- 王利英赵福宽王秋锦孙请鹏杨爱珍
- 关键词:反转录转座子IRAP茄子
- 茄子IRAP和REMAP分子标记的开发被引量:20
- 2008年
- 根据烟草和大麦中反转录转座子Bare-1和Tto1的LTR保守区域设计引物,对14份茄子材料进行PCR扩增,分别采用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增产物,建立了茄子IRAP(inter-retrotransposon amplifiedpolym orphism)和REMAP(retrotransposon-microsatellite amplified polymorphism)分子标记技术体系。两种方法均得到了多态性丰富的指纹图谱,为茄子品种鉴定和指纹图谱构建提供了新途径。
- 王利英杜永臣张斌石瑶王秋锦赵福宽
- 关键词:茄子分子标记反转录转座子IRAPREMAP
- 茄子种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析
- 茄子(Solanum melongena)起源于亚洲南部热带地区,古印度为其最早的驯化地,中国栽培茄子的历史也很悠久,是茄子的第二起源地,拥有丰富的茄子种质资源。对茄子种质资源分类和进行遗传多样性的研究,有利于茄子种质资...
- 王秋锦
- 关键词:茄子种质资源聚类分析
- 文献传递
- 茄子品种遗传多样性的RAPD检测与聚类分析被引量:20
- 2007年
- 用RAPD分子标记的方法对来自不同国家的34份茄子品种进行遗传多样性分析,从120条RAPD引物中筛选出有效的22条引物分别对34份茄子品种进行扩增,共检测出232个等位基因位点,每条引物平均检测出10.5个,其中192个为多态位点,多态位点比率为82.76%。POPGENE结果分析表明,Nei's基因多样性H为0.2756,Shannon指数为0.4145,显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331~0.805,根据Jaccard相似系数和组内连接法建立的系统聚类图,34份茄子大致可分为两大类型:圆茄类型和长茄类型,这与经典的形态学分类基本上相符,从而从分子水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。
- 王秋锦高杰孙清鹏杨爱珍赵福宽
- 关键词:RAPD茄子聚类分析
- 茄子IRAP分子标记体系的建立与优化被引量:9
- 2008年
- 为确保茄子IRAP反应结果的稳定性和重复性,进而为茄子遗传多样性分析和品种鉴定提供可靠的新方法,按照已报道的马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计IRAP引物,以茄子品系HL-01为试材,对影响茄子IRAP反应的重要因素进行了初步研究,建立并优化了茄子IRAP分子标记技术体系。优化的茄子IRAP分子标记体系为:20(l反应液中,10×反应buffer(100mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,80mmol/L(NH4)2SO4,pH9.0,NP-40)2μl,2mmol/L MgCl2,0.2mmol/L dNTPs,Taq-l.0U,0.4μmol/L引物,DNA模板50ng。PCR反应程序为:94℃预变性4min,然后按94℃变性30s,45℃退火30s,72℃延伸2min,进行32个循环,最后72℃延伸10min。
- 赵海艳王秋锦孙清鹏杨爱珍赵福宽
- 关键词:茄子分子标记IRAP
- 茄子种子资源遗传多样性的RAPD和SSR分析
- 王秋锦
- 关键词:茄子RAPDSSR聚类分析
- IRAP分子标记在茄子种质资源亲缘关系分析中的应用被引量:14
- 2008年
- 参考马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计引物,对34份茄子材料进行PCR扩增,得到了多态性丰富的指纹图谱。聚类分析将34份茄子材料分为三大类群,表明IRAP分子标记适合于茄子种质资源的亲缘关系分析。
- 赵海艳赵纯杨爱珍王秋锦孙清鹏赵福宽
- 关键词:茄子种质资源分子标记IRAP