申鹏
- 作品数:5 被引量:37H指数:4
- 供职机构:甘肃农业大学农学院更多>>
- 发文基金:甘肃省科技支撑计划国家现代农业产业技术体系建设项目甘肃省干旱生境作物学重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 拟南芥转录因子CBF2的克隆与生物信息学分析被引量:7
- 2014年
- 本研究旨在克隆转录因子CBF2并对其进行生物信息学分析得到该基因相关信息。试验以拟南芥基因组DNA为模板,根据GenBank中拟南芥转录因子CBF2(FJ491243.1)已知序列设计引物,回收扩增的目的片段与T-easy载体连接后转入大肠杆菌(E.coli DH5α),经蓝白斑筛选后提取重组体的质粒,经滞后筛选、PCR、酶切鉴定无误后进行测序。经生物信息学分析,该基因全长651 bp,其中编码区长648 bp,编码216个氨基酸,其蛋白的分子式为C1056H1623N293O333S16,相对分子质量为24.26 kDa,等电点为5.00,该蛋白为亲水性非分泌型蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。肽链可能含有9处丝氨酸磷酸化位点,6处苏氨酸磷酸化位点,以及2处酪氨酸磷酸化位点。本研究通过对CBF2基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗逆过程中有重要的作用。
- 申鹏毛娟刘爱平陈佰鸿
- 关键词:拟南芥转录因子克隆生物信息学
- 半干旱雨养农业区集雨补灌对马铃薯田水分运移的影响被引量:14
- 2011年
- 采用大田试验方法,研究集雨补灌对旱作马铃薯田水分运移规律和产量的影响。结果表明,对马铃薯有效的土壤水分主要分布在80 cm以上土层,苗期补灌45 mm处理水分利用效率(WUE)最高,且收获后不同土层中滞留的水分较少;在此基础上再增加补灌量,马铃薯产量增加不显著,WUE显著降低。集雨补灌增加了马铃薯棵间蒸发量(E)和植株蒸腾量(T),90 mm高额补灌处理在前、中期棵间蒸发量较高,收获后80 cm以下深层贮水量显著高于45 mm及45 mm以下补灌处理。45 mm与90 mm补灌处理植株蒸腾量差异不显著,马铃薯生长后期,苗期补灌与薯块膨大期补灌植株蒸腾量差异亦不显著;苗期45 mm补灌处理蒸腾量与蒸发量比率(T/E)比较高,其综合用水效率较高。
- 秦舒浩张俊莲王蒂刘震申鹏
- 关键词:旱作马铃薯集雨补灌蒸腾量
- 葡萄不同生育期总RNA提取及SSH建立
- 通过抑制性消减杂交(SSH)技术可以筛选出具有差异表达的抗寒基因,并进一步克隆相关抗寒基因,已成为目前科研工作者在如何提高植物抗寒性方面研究的切入点。本试验选取山葡萄和红地球葡萄两种具有抗寒性差异的葡萄品种作为试验材料,...
- 申鹏
- 关键词:葡萄RNA提取多酚SSH
- 文献传递
- 葡萄枝条RNA的提取方法
- 本发明公开了葡萄枝条RNA的提取方法,包括以下步骤:称取样品加入聚乙烯吡咯烷酮以液氮研磨,加入CTAB提取液和β-巯基乙醇,金属浴后混匀;混匀后放在冰上加入醋酸钾溶液和2-丁氧乙醇,混匀静置;再加入CHCl<Sub>3<...
- 毛娟陈佰鸿申鹏马宗桓米宝琴
- 文献传递
- 山葡萄‘通化-3’抗寒相关基因SSH文库的构建及分析被引量:12
- 2015年
- 【目的】克隆山葡萄抗寒相关基因和分析葡萄的抗寒机理。【方法】利用抑制性消减杂交技术(SSH),选用抗寒性强的山葡萄株系‘通化-3’和抗寒性弱的欧洲葡萄品种‘红地球’分别作Driver和Tester,建立了ASSH(山葡萄)与SSSH(‘红地球’)2个c DNA表达文库。【结果】差异表达克隆测序后经DNAMAN比对,从657个克隆中筛选出了70个Unigenes;通过BLAST比对分析,发现在ASSH文库中含有与山葡萄相关的r RNA基因内含子编码的归巢核酸内切酶、衰老相关蛋白质、细胞色素P450、抗冻蛋白、防御素样蛋白、热休克蛋白等相关的EST序列;SSSH文库中含有与‘红地球’相关的衰老蛋白。此外还发现了14个未知蛋白的ESTs序列。【结论】筛选出了与山葡萄抗寒性相关的AFPs、Haps、防御素样蛋白、细胞色素P450加单氧酶等多个相关的ESTs,以及14个未知蛋白序列,也可能参与山葡萄的抗寒代谢。
- 米宝琴毛娟申鹏陈佰鸿郝燕杨瑞
- 关键词:山葡萄SSH