目的分析北京MSM人群HIV序列特征，预测北京该人群中HIV流行趋势。方法汇总本实验室获得的北京MSM人群HIV序列，下载LosAlamos HIV Database中我国MSM人群及其他人群中流行的H1V序列，利用PhyML3．0、BEAST等软件重建北京MSM人群系统发育树、估算突变速率、推断tMRCA、重建群体流行动态参数、计算再生指数凡值，分析北京MSM人群与其他人群HIV流行的相关关系，推断进化和流行特征。结果北京MSM人群中流行的HIV-1亚型包括B、CRF01AE和CRF07BC。在全国H1V毒株ML进化树中，北京MSM簇（北京MSM人群所占比例≥40％）共有3簇，即B-1簇、CRF01AE-1簇、CRF01AE-2簇。B1簇毒株是由至少3次传人事件进入北京MSM人群的，传人时间分别为1991年3月（1984年7月至1997年2月）、1994年1月（1989年1月至1998年1月）、1991年4月（1984年8月至1996年8月）。CRF01AE毒株由2次传人事件进入北京MSM人群，传人时间分别为2000年12月（1998年3月至2003年1月）和2001年12月（2000年1月至2003年7月）。流行特征重塑分析显示，CRF01AE-1簇近年来增长速度较快、突变速率较高。结论北京MSM人群中存在多种HIV亚型毒株流行，其中B亚型毒株传人时间最早，但增长趋势趋于平稳；CRF01AE毒株传人时间较晚、但增长迅速，对HIV在北京地区的流行具有明显的推动作用，因此对CRF01AE毒株的防控有助于减少该地区HIV的流行。
