以近缘种OPN的cDNA序列为参考设计引物,通过RT-PCR得到黑线姬鼠OPN部分序列,并将得到的cDNA序列翻译成氨基酸序列,注册到GenBank(登陆号:HM626723).利用该序列构建系统进化树,同时对其编码的蛋白质进行一级结构分析及二级结构预测.结果表明:克隆得到的209 bp OPN的序列,包括部分外显子4,全部的外显子5及部分外显子6;该段序列从第二个碱基开始翻译,共编码69个氨基酸;其一级结构中包括了一个由10个连续天冬氨酸组成的高度酸性区域,它对骨桥蛋白与羟基磷灰石之间的联系具有重要意义;二级结构中大部分为α螺旋,且具有亲水性;利用所得OPN序列构建的系统进化树显示黑线姬鼠与大鼠、小鼠亲缘关系最近,与鸡、鹌鹑亲缘关系最远,此结果与物种的进化关系相一致,本研究所得到的OPN序列将有助于对骨桥蛋白的作用机制研究及系统进行分析.
