陈东戎
- 作品数：11 被引量：6H指数：1
- 供职机构：复旦大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国博士后科学基金上海市博士后基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 核开关aac及其在制备抗生素中的应用
- 本发明属于生物技术领域，涉及一种新型抗生素药物筛选靶点。更具体地，本发明涉及aac核开关的序列和制备方法，以及其作为新型抗生素筛选靶点的应用。本发明提供了一种核开关，其DNA序列如SEQ IN NO 1所示；其中，N是A...
- 贾旭张静何维志陈东戎阿拉斯太尔·马歇尔
- 文献传递
- 一种冠状病毒SARS-CoV-2锤头型核酶变体反义核酶链RNA
- 本发明属生物技术领域，具体涉及一种冠状病毒SARS‑CoV‑2病毒的靶点序列及其潜在应用。本发明的药物靶点，其为锤头型核酶变体序列(Hammerhead Ribozyme‑like Sequences)，其序列片段选自S...
- 刘格彤陈东戎阿拉斯泰尔·莫奇
- 石蒜碱对裂殖酵母生长的抑制作用被引量：1
- 2010年
- 目的研究石蒜碱对裂殖酵母生长周期的影响,分析石蒜碱的抗肿瘤机制,推测用裂殖酵母作为模型筛选抗肿瘤药物的可行性。方法在不同浓度石蒜碱条件下培养裂殖酵母,测量生长曲线;流式细胞术检测细胞周期分布;光学显微镜观察形态,DAPI及Calcofluor染色观察细胞核、细胞间隔变化;Real-time PCR检测细胞周期相关基因的表达。结果在试验条件下,石蒜碱显著抑制裂殖酵母生长,并呈现时间浓度依赖性,作用20.5 h后IC50值为212μmol/L;酵母细胞变长、细胞核及细胞间隔增多,G2/M期细胞比例增加,部分细胞周期相关基因在mRNA水平有所变化。结论石蒜碱对裂殖酵母生长具有明显抑制作用,可引起细胞表型变化,影响部分细胞周期相关基因的表达。
- 汪洋王哲沈妍陈东戎
- 关键词：裂殖酵母细胞周期石蒜碱抗肿瘤
- 组蛋白去乙酰化酶抑制剂对裂殖酵母核基因SRK1和线粒体基因转录的影响
- 2011年
- 目的研究组蛋白去乙酰化酶抑制剂(histone deacetylase inhibitors)丙戊酸(valproic acid,VPA)对裂殖酵母体内应激激酶核基因SRK1和线粒体基因转录的影响。方法在裂殖酵母972细胞中加入梯度稀释的VPA测定细胞生长曲线并计算半数抑菌浓度(IC50)。检测分别加入1和5μmol/L VPA处理6h后,核基因SRK1的转录水平;检测同等处理条件下裂殖酵母体内线粒体基因的转录水平。结果 VPA对972细胞的IC50为7.57μmol/L。1μmol/L VPA处理的细胞中核基因SRK1转录水平上调5.5倍,外加5μmol/L VPA处理的细胞中SRK1基因转录水平上调4.2倍;经1μmol/L VPA处理后,线粒体基因COB,SPMIT2,SPMIT3上调倍数分别为3、4.59和6.31倍,其他基因变化不大,经5μmol/L VPA处理后,线粒体基因转录水平全部上调,上调范围2.63～7.02倍。结论在裂殖酵母体内,VPA能通过抑制细胞内去乙酰化酶而调节细胞核基因和线粒体基因的转录水平,加入IC50水平的VPA引起与应激相关核基因SRK1的转录水平显著上升,且线粒体内大部分基因转录水平也随之升高,说明细胞受到刺激后核基因和线粒体基因均能通过调节转录水平来阻挡外界刺激对细胞的影响。
- 王莉陈东戎
- 关键词：丙戊酸裂殖酵母基因转录应激反应
- 人类线粒体转录因子B1和B2与裂殖酵母线粒体转录聚合酶Rpo41相互作用的初步研究
- 2011年
- 由L02型人肝脏细胞cDNA通过PCR技术获取到线粒体转录因子B1和B2的ORF片段(NM_022366和NM_016020);构建表达质粒pGEX-4t-1/GST-mtTFB1及pMAL-c-2X/MBP-mtTFB2,并转化到大肠杆菌BL21(DE3)中表达,经亲和层析,分子筛和阳离子交换柱得到纯度较高的蛋白.利用体外pull-down实验证实TFB1和TFB2均与来源于裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的线粒体RNA聚合酶(Rpo41)存在分子间相互作用.在裂殖酵母中过表达h-TFB1和h-TFB2,利用实时荧光定量PCR检测,2个蛋白在酵母体内均对线粒体基因转录产生影响.
- 赵俊容陈东戎
- 关键词：裂殖酵母
- 等温滴定量热法研究核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的相互作用被引量：5
- 2015年
- 核糖开关(riboswitch)是位于m RNA非编码区域的RNA元件,可与小分子配体结合导致结构转变,进而调控下游基因的表达。核糖开关aac能够特异性结合氨基糖苷类抗生素,从而调控氨基糖苷类抗生素抗性基因的表达。目前,核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素相互作用的位点和机制尚不清楚。作者利用等温滴定量热法对核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的结合亲和力及结合热力学性质进行了研究,并初步探讨了点突变对相互作用的影响。结果发现,西索米星、庆大霉素、G418、奈替霉素和巴龙霉素能够特异性结合核糖开关aac,而阿米卡星、卡那霉素A、链霉素、链丝菌素、新霉胺、新霉素及核糖霉素与核糖开关aac无特异性相互作用;核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素的结合热力学性质表明二者通过氢键和范德华力发生相互作用。西索米星滴定核糖开关aac突变体的结果表明,U68和A18位点很可能与氨基糖苷类抗生素形成氢键,A13和A44位点对于相互作用也有影响。这些结果对进一步研究核糖开关aac与氨基糖苷类抗生素相互作用的位点和机制具有重要的参考价值。
- 石会刚陈东戎
- 关键词：核糖开关氨基糖苷类抗生素热力学
- 核开关aac及其在制备抗生素中的应用
- 本发明属于生物技术领域，涉及一种新型抗生素药物筛选靶点。更具体地，本发明涉及aac核开关的序列和制备方法，以及其作为新型抗生素筛选靶点的应用。本发明提供了一种核开关，其DNA序列如SEQ？IN？NO？1所示；其中，N是A...
- 贾旭张静何维志陈东戎阿拉斯太尔·马歇尔
- 文献传递
- 那西肽耐药型核糖体RNA甲基转移酶、其制备方法及应用
- 本发明属于生物技术领域，涉及一种新型抗生素耐药型甲基转移酶。更具体地，本发明涉及那西肽耐药型核糖体RNA甲基转移酶的基因克隆，蛋白制备，以及其作为新型抗生素筛选靶点的应用。本发明提供了一种细菌核糖体RNA甲基转移酶，它包...
- 王哲阿拉斯太尔·马歇尔陈东戎沈妍
- 文献传递
- 介导含硫多肽类抗生素耐药的23S rRNA甲基转移酶NHR的生化功能
- 2011年
- 目的研究23S rRNA甲基转移酶-硫链丝菌肽抗药性RNA甲基转移酶(thiostrepton-resistance-RNA methyltransferase,TSR)和23S rRNA甲基转移酶-那西肽抗药性RNA甲基转移酶(nosiheptide-resistance-RNA methyltransferase,NHR)的生化功能,探讨细菌对含硫多肽类抗生素产生耐药性的分子机制。方法构建克隆,体外表达并纯化TSR和NHR蛋白;利用T7聚合酶体外转录系统体外转录生成23S rRNA底物片段;构建RNA甲基转移酶活性的体外检测体系,在14C-SAM存在的情况下,利用液体闪烁计数仪测定相应底物RNA被甲基化的程度;通过Gel shift方法观察RNA底物与TSR或NHR蛋白的体外相互结合作用。结果得到体外表达的纯化TSR、NHR蛋白及RNA底物;TSR蛋白和NHR蛋白均能将RNA底物甲基化,且NHR甲基转移酶的活性更强;TSR和NHR蛋白与RNA底物均有结合,结合强度均随蛋白浓度增加而增强。结论 TSR和NHR蛋白都能将23S rRNA的特异位点1067A甲基化,并能诱导细菌的抗生素耐药性。
- 沈妍王哲陈东戎
- 关键词：抗生素耐药性那西肽
- 一种线粒体RNA聚合酶附属转录因子、其聚合酶-转录因子复合体及应用
- 本发明属于生物技术领域，涉及一种线粒体RNA聚合酶转录因子Mtf1和聚合酶-转录因子组合物。本发明提供了一种线粒体RNA聚合酶附属转录因子Mtf1，它的氨基酸序列包括序列表SEQ ID NO：3中的1-366位。RNA聚...
- 阿拉斯太尔·马歇尔王哲陈东戎孙文夏蒋恒义张静
- 文献传递
