陈敏
- 作品数:5 被引量:9H指数:2
- 供职机构:重庆邮电大学生物信息学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金重庆市自然科学基金四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 基于18S rRNA基因序列的毛茛科及近缘植物的分子进化关系研究被引量:1
- 2010年
- 基于18S rRNA基因序列以近缘植物Paeonia suffruticosa和Mahonia bealei为外类群,采用邻接法(Neighbor-joining methods,NJ)和最大简约法(Maximum parsimony,MP)对毛茛科Ranunculaceae 6属12种植物的系统发育关系进行了分析.结果表明,18S rRNA基因序列长度范围在1807~1810bp之间,系统树显示耧斗菜属Aquilegia与唐松草属Thalictrum,升麻属Cimicifuga与乌头属Aconitum都互为姐妹群,显示他们具有较近的亲缘关系;本研究结论支持成立升麻亚科,也支持将芍药属独立为科的观点,为含木兰花碱生物碱及毛茛甙毛茛科植物以及毛茛科近缘植物的鉴别与亲缘关系提供了初步的分子依据.
- 高运玲陈敏李生伟蔡应繁何晓红刘毅江明锋
- 关键词:毛茛科RRNA分子系统学
- 麦洼牦牛初乳期乳腺中2个特异表达EST片段的克隆与分析被引量:3
- 2009年
- 为研究牦牛初乳期乳腺特异表达的基因,采用抑制消减杂交和斑点杂交法对麦洼牦牛初乳期(产犊后2 d)和常乳期(产犊后18 d)特异表达的基因进行了分离鉴定。结果发现2个在初乳期间特异表达的EST片段,并命名为LAO和COL1α1。测序结果LAO片段长698 bp,GenBank比对,其核苷酸序列与西藏黄牛(Bos taurus)、小家鼠(Mus musculus)、家犬(Canis familiaris)等的L-氨基酸氧化酶基因有较高的序列相似性,其序列一致性分别达到96%、73%、72%;COL1α1片段长337 bp,比对结果,其序列与Bos taurus、马鹿(Cervus elaphus)、家犬(Canis lupus fa-miliaris)等的Ⅰ型胶原蛋白α1有较高的序列相似性,其序列一致性分别为100%、100%、99%。2个序列与牛基因组的Blast分析表明,LAO片段定位于3号染色体LOC782545区,该区域编码1个L-氨基酸氧化酶基因;另一片段定位于19号染色体LOC615867区,该区域编码1个Ⅰ型胶原α1基因。研究表明,L-氨基酸氧化酶基因和Ⅰ型胶原蛋白α1基因是牦牛初乳期乳腺特异表达蛋白,这2个基因在牦牛初乳期乳腺组织中较高的表达水平可能与初乳期乳腺特殊的生理状态有关。
- 江明锋刘勇涛李生伟陈艳叶煜辉陈敏
- 关键词:麦洼牦牛乳腺组织L-氨基酸氧化酶
- 棉花半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因的克隆、表达与活性研究被引量:2
- 2010年
- 通过从已构建好的突变体湘棉-18的cDNA文库中筛选分离出一个半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因的全长cDNA序列,经测序和序列分析,发现该片段包含一个完整的开放阅读框,长378个碱基,编码125个氨基酸,氨基酸序列中包含了一个半胱氨酸蛋白酶抑制剂家族的保守区段Gln-Val-Val-Ala-Gly;信号肽预测发现该序列包含一个N端信号肽,保守区分析该基因编码的氨基酸包含一个半胱氨酸蛋白酶抑制剂相似区域.半胱氨酸蛋白酶抑制剂在大肠杆菌中表达重组蛋白,在条件为30℃,IPTG 5mmol/L,时间24~36h时,CPI实现最优表达,Western Blotting分析表明表达的蛋白正确.通过木瓜蛋白酶活性抑制实验,结果表明该重组CPI具有一定的酶活抑制作用.
- 潘正李生伟陈敏蔡应繁江怀仲孙全何晓红高运玲杨建平江明锋
- 关键词:陆地棉半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因克隆原核表达免疫印迹
- MUC1基因遗传多态性与密码子偏好性的生物信息学分析被引量:3
- 2009年
- 为分析MUC1基因在物种间的遗传多态性和密码子偏好性,本文运用生物信息学方法对来自普通牛、印度牛、冈比亚按蚊、褐家鼠、野猪、人这6个物种的32条MUC1完全编码区域序列进行分析.结果表明,MUC1基因具有丰富的遗传多态性,且它的遗传多态性在种间大于种内;MUC1基因在GCT等27个密码子的使用上具有偏好性,尤其在GGC、CCA、TGA上偏好性较强.
- 沈庆航江明锋钟金城王利陈敏
- 关键词:MUC1基因遗传多态性密码子偏好性
- 陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱
- 2010年
- 为了解棉花腺体形成时期相关基因的表达谱,分别抽提陆地棉湘棉-18和N5在腺体形成时期的RNA,采用Affymetrix芯片,扫描采集数据后进行分析。结果显示,在腺体形成时期有明显差异表达的基因共有514条,包括209条上调基因和305条下调基因;在514条差异表达基因中有275条(53.5%)与GenBank中已知的基因具有较高的相似性,这些基因主要涉及防御反应及异戊二烯生物合成等,有239条(46.5%)在GenBank中无任何注释。KOBAS分析结果显示,这些差异基因在KEGG数据库上涉及19条生化途径。说明,腺体形成过程是一个复杂的基因网络调控过程,涉及多条萜类化合物生物合成途径及其他与防御基因相关的途径。
- 陈敏江明锋蔡应繁孙全何晓红江怀仲谢永芳莫剑川高运玲潘正陈珺伍婷玉王玲朱小燕张锐袁友禄石玉真
- 关键词:棉酚基因芯片表达谱