刘文平
- 作品数：13 被引量：7H指数：2
- 供职机构：华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 采用分子动力学模拟探究VWF-A1突变体G561S的亲和力变化机制被引量：3
- 2015年
- 目的探究血管性血友病因子(von Willebrand factor,VWF)突变体G561S下调VWF-A1与其配体亲和力的分子机制。方法分别构建2M型突变体G561S-A1(功能减弱型)、WT-A1(野生型)和2B型突变体R543Q-A1(功能增强型)3个分子系统。G561S-A1突变体采用将野生型A1结构的Gly561替换为Ser561的方式构建,WT-A1与R543Q-A1晶体结构取自蛋白质数据库(protein data bank,PDB)。利用自由分子动力学模拟方法对比分析WT-A1、G561S-A1、R543Q-A1三者构象的改变、柔性的变化以及氢键/盐桥的形成与演化。结果 G561S突变通过降低A1结构域α2螺旋的柔性,并增强N末端与body区的相互作用从而减弱其与配体GPIbα的亲和力,R543Q功能增强型突变体则启动了一条相反的调节路径。结论局部动力学性质的改变是A1亲和力调控的潜在机制,研究结果有助于针对激活的A1结构域的变构药物设计以及相关抗血栓药物的研发。
- 李红刘文平刘广建吴建华方颖
- 关键词：血管性血友病因子分子动力学
- 整合素αvβ3与纤连蛋白FN复合物的解离动力学模拟
- 整合素αvβ3(integrinαvβ3)与纤连蛋白FN(fibronectin)之间的相互作用,在多种肿瘤细胞的恶性转移过程中起到至关重要的作用。αvβ3和FN的键合和解离,受到血流剪应力环境的调制。揭示其中的力-化学...
- 李趣欢方颖刘广建刘文平吴建华
- 采用分子动力学模拟研究胶原激活VWF机制
- 目的:在阻止血液从受损部位渗漏到血栓形成这一级联反应过程中,胶原蛋白诱导的血浆VWF(von Wille-brandfactor,VWF)激活是血小板发挥其正常功能的一个关键事件,受到血管壁面剪应力的调控。这一力和配体协...
- 宁志龙刘文平代春月吴建华方颖
- 力学信号介导的ERM蛋白激活
- 目的:PSGL-1近膜端与ERM蛋白以及细胞骨架的结合被发现在白细胞的捕获和滚动稳定性中发挥着重要的作用。ERM蛋白由ezrin、radixin和moesin构成,并且相互之间有很高的同源性(5%的序列相似性)。作为细胞...
- 刘文平方颖吴建华
- 整合素αvβ3与纤连蛋白FN复合物的解离动力学模拟
- <正>整合素αvβ3(integrinαvβ3)与纤连蛋白FN(fibronectin)之间的相互作用,在多种肿瘤细胞的恶性转移过程中起到至关重要的作用。αvβ3和FN的键合和解离,受到血流剪应力环境的调制。揭示其中的力...
- 李趣欢方颖刘广建刘文平吴建华
- 文献传递
- 采用分子动力学模拟方法探究Ca2+对VWF-A2结构域稳定性的影响被引量：4
- 2018年
- 目的探究Ca^2＋对VWF-A2结构域稳定性的影响。方法 A2和A2/Ca^2＋的晶体结构取自PDB数据库。通过恒力拉伸分子动力学模拟,比较分析Ca^2＋结合引起的构象变化、解折叠路径的差异以及酶切位点的暴露程度。结果 A2结构域的解折叠路径和酶切位点的暴露过程是力依赖的。Ca^2＋结合不影响A2结构域的前期解折叠,但由于α3β4-环链局部构象重排所致柔性降低,约束了β1-β4-β5片层的运动,导致进一步解折叠受阻而停留在中间稳态,影响酶切位点的充分暴露。结论力可诱导A2结构域中β5片层的解折叠使酶切位点暴露,而Ca^2＋的结合则通过稳定疏水核心结构,阻碍酶切位点的暴露,最终降低ADAMTS13的酶切效率。研究结果有助于加深对ADAMTS13酶切VWF-A2结构域进而调控VWF止血能力过程的理解,并为相关抗血栓药物设计提供指导。
- 谢旭斌刘文平吴建华方颖
- 关键词：血管性血友病因子分子动力学模拟解折叠
- 力学信号介导的ERM蛋白激活
- 刘文平方颖吴建华
- IL-8介导的CXCR1激活机制的研究
- 目的:揭示趋化因子CXCL8(亦称白细胞介素IL-8)诱导的跨膜蛋白CXCR1的激活这一在免疫调节中起着非常重要作用的尚不明晰的事件,阐明其动力学机制与结构基础,深化白细胞炎症反应的理解。方法:采用分子动力学模拟技术,基...
- 代春月刘文平方颖吴建华
- 力学信号经由PSGL-1介导ERM蛋白类ITAM序列上磷酸化位点的暴露
- 目的:炎症反应初始阶段,选择素通过与配体PSGL-1(P-selectin glycoprotein ligand 1)的结合介导了白细胞在内皮细胞上的初始拴缚和快速滚动。在这个过程中,选择素与PSGL-1的结合会引起胞...
- 邝晓敏刘文平方颖吴建华
- 整合素αvβ3与纤连蛋白FN复合物的解离动力学模拟
- 整合素αvβ3（integrinαvβ3）与纤连蛋白FN（fibronectin）之间的相互作用,在多种肿瘤细胞的恶性转移过程中起到至关重要的作用。αvβ3和FN的键合和解离,受到血流剪应力环境的调制[1]。揭示其中的力...
- 李趣欢方颖刘广建刘文平吴建华
- 关键词：整合素肿瘤细胞转移解离过程
- 文献传递
