孙朝霞 作品数:47 被引量:140 H指数:7 供职机构: 山西农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山西省青年科技研究基金 山西省回国留学人员科研经费资助项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 理学 更多>>
苦荞ARF基因家族的鉴定及生长素诱导下的表达模式 被引量:4 2020年 【目的】全基因组水平鉴定苦荞ARF家族基因,并对其家族基因结构、保守结构域、系统进化、组织表达差异及外源生长素处理下基因表达水平进行分析,为苦荞ARF的功能研究和利用奠定基础。【方法】通过转录组数据和ARF保守结构域(PF06507)分析,筛选苦荞ARF家族成员,利用TBtools软件绘制基因结构图,利用NCBI及MEME在线预测苦荞ARF蛋白保守结构域和保守基序,利用MEGA X构建苦荞和拟南芥、水稻、甜荞、甜菜、大豆ARF蛋白系统进化树。使用根、茎、叶、花、未成熟和成熟籽粒6个组织转录组数据的FPKM值,通过TBtools HeatMap绘制FtARFs基因表达热图,分析FtARFs的组织表达特异性。使用PlantCARE在线网站预测茎秆特异表达的FtARFs启动子的顺式作用元件。以0.5 mg·L-1 IAA处理2份高秆(ZNQ189和PI673849)与2份矮秆(PI658429和PI647612)苦荞材料,观察苦荞下胚轴伸长的特征,于生长素处理不同时间段(0、0.5、1、6、12、24和48 h)取样,qRT-PCR检测FtARFs基因在不同苦荞下胚轴中的表达差异;同时,对生长7 d的4份材料进行石蜡切片,番红固绿染色后显微镜下观察下胚轴细胞大小。【结果】系统分析鉴定了26个苦荞ARF家族基因,染色体定位分析显示,除第4染色体外,FtARFs在其余染色体均有分布。理化性质分析表明,氨基酸残基数目范围为331—1083 aa,理论等电点为5.34—8.63。保守基序分析表明,不同组间Motif组成有一定的差异。基因结构分析显示,苦荞ARF基因外显子数量为2—15,变异较大。系统进化将其分成4组(GroupⅠ—GroupⅣ),且苦荞FtARFs在4个类群中均有分布。组织特异性分析显示,在各组织中,FtARFs基因FPKM值差异明显,在根、茎、花中,分别检测到7个、9个和4个基因表达量较高,在叶、未成熟籽粒和成熟籽粒中,表达值均较低。外源生长素处理4份苦荞材料,下胚轴伸长趋势不一,与其细胞大小变化相一致。qRT-PCR� 郝彦蓉 杜伟 侯思宇 王东航 冯红梅 韩渊怀 周美亮 张凯旋 刘龙龙 王俊珍 李红英 孙朝霞关键词:苦荞 生长素 株高 基因表达 甜荞高效离体再生与GUS基因瞬时表达分析 被引量:2 2015年 以晋荞1号叶片为外植体,研究了不同类型(2,4-D,6-BA和NAA)及不同剂量的生长调节剂对愈伤组织诱导、幼苗分化及植株再生的影响;利用Ca MV35S启动子驱动GUS基因PBI121质粒转化EHA105农杆菌侵染愈伤组织,进行GUS染色鉴定。结果表明,愈伤组织诱导培养基中加入3.0 mg/L 2,4-D和1.0 mg/L 6-BA诱导愈伤组织的效果最好,出愈率达到69.5%;再分化培养基中加入1.0 mg/L的6-BA和1.0 mg/L的NAA分化率最高(47.0%);农杆菌侵染愈伤组织经过GUS染色鉴定证明为阳性。晋荞1号高效离体再生体系的建立为下一步转基因选育优良品种提供了理论依据和技术指导。 赵盖超 孙朝霞 令狐斌 韩渊怀 许冬梅 侯思宇关键词:植物激素 GUS 外源激素对小麦成熟种子体细胞胚发生的影响 被引量:1 2006年 研究了外源激素对不同小麦品种成熟种子体细胞胚发生的影响。结果表明:2,4-D明显促进小麦胚性愈伤组织的发生,其诱导效应表现出基因型间的差异。诱导体胚发生的最适宜浓度为2,4-D 2.0~4.0 mg·L^1,附加KT对胚状体的萌发有显著的促进作用。另外,及时调整培养基,适当的降低激素含量对体胚的诱导也非常重要。晋农211在2,4- D2.0 mg·L^1的MS培养基上,45 d后转移至2,4-D浓度1.0 mg·L^1+KT0.5 mg·L^1的培养基上胚状体诱导率较高。农大981胚性愈伤组织在2,4-D2.0 mg·L^1的MS培养基上,50 d降低2,4-D浓度至1.0mg·L^1+KT0.5 mg·L^1胚状体诱导率较高。 孙朝霞 贺岩 王玉国 侯思宇关键词:小麦 外源激素 体细胞胚 Study on the Effect of Osmosis-regulating Substances and Organic Appendices on Somatic Embryogenesis in Wheat 被引量:4 2008年 [Objective] The study aimed to reveal the effect of osmosis-regulating substances and organic appendices on somatic embryogenesis in wheat. [Method] The suitable concentration combination of appendices was optimized by adding different concentrations of osmosis-regulating substances including mannitol, sorbitol and organic appendices such as Gln, CH and LH, into the somatic embryogenesis in wheat. [Result] The mannitol or sorbitol lower than 40 g/L was helpful for improving somatic embryogenesis; there was no significant difference in the induction rate of somatic embryogenesis when 300-500 mg/L Gln、CH or LH was respectively added into the induced medium, while somatic embryogenesis could be enhanced dramatically in the presence of 500 mg/L Gln together with 300 mg/L CH. [Conclusion] Somatic embryogenesis could be improved to some extent by different concentrations of osmosis-regulating substances and organic appendices, which laid foundation for establishing a more perfect system of somatic embryogenesis in wheat. 孙朝霞 侯思宇 王玉国关键词:WHEAT SOMATIC EMBRYOGENESIS ORGANIC 苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析 被引量:14 2015年 通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg^2+1.5 mmol/L、DNA模板75ng、引物0.5μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值在0.66~0.95,每对引物组合扩增位点为7~13个,多态性比率平均值为81.6%,其中多态性信息量值为0.95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8。基于UPGMA法聚类(GS=0.78)可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征。 令狐斌 侯思宇 孙朝霞 黄可盛 路阳 韩渊怀 许冬梅关键词:苦荞 SRAP-PCR 正交试验设计 简易植物气耕育苗种植箱 本实用新型涉及一种简易植物气耕育苗种植箱,属于育种栽培技术领域,提供了一种结构简单,操作方便,便于育种、调节种植密度,成本较低的简易植物气耕育苗种植箱,所采用的技术方案为箱体上设置有箱盖,箱体和箱盖的外部均设置有黑色涂层... 侯思宇 孙朝霞文献传递 一种鉴定苦荞脱壳性状的SNP位点、KASP分子标记引物组及其应用 本发明属于生物技术领域,具体涉及一种鉴定苦荞脱壳性状的SNP位点、KASP分子标记引物组及其应用。本发明提供的SNP位点位于苦荞第1号染色体上第8250379bp,所述位点上存在G/A碱基突变,与苦荞脱壳性状具有显著的相... 孙朝霞 侯思宇 韩渊怀 王欣芳 杜伟文献传递 枣树RAPD分析体系优化研究 被引量:8 2008年 利用随机引物扩增多态性(RAPD)分子标记技术研究不同枣树品系之间遗传多态性,建立起一个基于PCR技术的分子遗传标记RAPD分析的优化体系。设置不同的浓度梯度,从dNTPs、随机引物、Taq酶、Mg2+、缓冲液Buffer的浓度及模板DNA的质量和用量方面考察,建立了枣树RAPD技术最优体系。结果表明:20μL反应体系组分含量为10×Taq酶Buffer 2μL,Mg2+浓度2.0 mmol/L,dNTPs浓度200μmol/L,引物浓度0.2μmol/L,TaqDNA聚合酶浓度0.06 U/μL,DNA模板浓度1.5 ng/μL。最佳扩增程序为94℃预变性4 min,94℃变性30 s,36℃退火40 s,72℃延伸1min,50个循环,最后72℃延伸8 min。 孙朝霞 王海燕 王玉国 侯思宇 张艳关键词:枣树 RAPD 褐斑伽蓝的组织培养与快速繁殖 被引量:1 2005年 赵娟 王玉国 孙朝霞 温银元关键词:6-BA IBA 褐斑 基本培养基 继代培养基 简易三维植物水培根系拍照装置 本实用新型涉及一种简易三维植物水培根系拍照装置,属于植物水培研究技术领域,提供了一种结构简单,使用方便,采用在不透光的箱体内进行连续拍照,成像效果好的简易三维植物水培根系拍照装置,所采用的技术方案为箱体和箱盖均为不透光材... 侯思宇 孙朝霞 韩渊怀文献传递