宋辉 作品数:11 被引量:65 H指数:3 供职机构: 兰州大学 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 政治法律 更多>>
蒺藜苜蓿全基因组中WRKY转录因子的鉴定与分析 被引量:22 2014年 WRKY基因家族是植物基因组内一类重要的转录因子,参与植物许多生理生化过程,如植物发育、代谢以及生物和非生物胁迫。目前,已在多种植物中鉴定出WRKY基因家族,但是关于蒺藜苜蓿(Medicago truncatula L.)WRKY基因家族的系统分析鲜有报道。文章利用生物信息学方法,从蒺藜苜蓿全基因组中共鉴定出93个WRKY基因,包括81个标准的WRKY基因(19个Ⅰ型基因,49个Ⅱ型基因以及13个Ⅲ型基因)和12个非标准类型的WRKY基因。对这些WRKY基因进行了基因重复、染色体定位、基因结构、保守基序和系统进化等方面的分析。蒺藜苜蓿WRKY基因家族中最近共发生了11次基因重复事件,共涉及24个基因,占全部WRKY基因的26%。染色体物理定位分析表明,蒺藜苜蓿WRKY基因在染色体上呈不均匀分布,存在6个基因簇。对WRKYⅢ型基因的进化分析表明,它们在长期的进化过程中受纯化选择压力。 宋辉 南志标关键词:WRKY 蒺藜苜蓿 基因重复 系统进化 环孢菌素T及其制备方法和应用 本发明公开了环孢菌素T,结构式如式(Ⅰ)所示,并提供了其制备方法和应用。本发明提供的环孢菌素T及其制备方法和应用,其有益效果为:(1)环孢菌素T对牲畜无毒,其来源Epichlo? bromicola是一种有益的内生真菌;... 宋秋艳 高坤 南志标 田沛 宋辉文献传递 环孢菌素T及其制备方法和应用 本发明公开了环孢菌素T,结构式如式(Ⅰ)所示,并提供了其制备方法和应用。本发明提供的环孢菌素T及其制备方法和应用,其有益效果为:(1)环孢菌素T对牲畜无毒,其来源<I>Epichloë </I><I>bromicola<... 宋秋艳 高坤 南志标 田沛 宋辉文献传递 野生花生全基因组抗病相关LOX基因的生物信息学分析 被引量:3 2015年 脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。 宋辉 赵术珍 侯蕾 乔善良 赵传志 李爱芹 王兴军关键词:野生花生 LOX 基因家族 抗病 海滨雀稗液泡膜H^+-PPase(PvVP1)5′端的克隆和序列分析 被引量:1 2014年 根据已公布液泡膜H+-PPase基因家族同源序列保守区设计简并引物,克隆出海滨雀稗中PvVP1基因的中间序列,然后用快速扩增cDNA末端(rapid amplification of cDNA end,RACE)方法,从海滨雀稗中克隆到PvVP15′cDNA序列。该序列ORF长1605bp,编码535个氨基酸,其编码序列、氨基酸序列与玉米相应基因的同源性分别为93%和99%。 宋辉 南志标 蔡小宁 钟小仙 顾洪如关键词:海滨雀稗 RACE 耐盐 中国西北地区披碱草属植物所带内生真菌的培养特征 被引量:2 2015年 内生真菌与植物所形成的共生体普遍存在于冷季禾草中,共生体有利于提高宿主植物的生物和非生物抗性。虽然目前研究者们已对禾草内生真菌做了大量的研究,但是尚未发现对分布于中国西北地区披碱草属植物无性世代Neotyphodium内生真菌培养特征的研究。本研究从中国西北地区分离出15株来自不同地理种群披碱草属植物无性世代Neotyphodium内生真菌。通过分离培养,测定了这15株无性世代Neotyphodium内生真菌的菌落生长速度,结果显示,这15株无性世代Neotyphodium内生真菌菌落的平均生长速度为(O.41~O.85)mm/d,且生长速度与海拔具有相关性。分布在海拔低于3000m的无性世代Neotyphodium内生真菌的菌落生长速度比生长于海拔高于3000m菌落的生长速度快。观察菌落发现,分布在海拔高于3000m的菌落正面特征较为一致,而分布在海拔低于3000m的菌落正面特征出现不同。另外,通过多基因联合建树发现,分布在海拔高于3000m的无性世代Neotyphodium内生真菌聚在一个分支,而分布在海拔低于3000m的无性世代Neotyphodium内生真菌呈现星状分布。由于目前尚未对中国西北地区披碱草属植物无性世代Neotyphodiurn内生真菌命名。因此,希望本研究结果能为该菌的命名提供理论依据。 宋辉 南志标 田沛关键词:内生真菌 披碱草 菌落 多样性 系统发育 九种披碱草属植物及其Epichloё内生真菌的系统进化 披碱草属植物(Elymus L.)多为优良牧草,我国北方地区约有12种。在草地畜牧业生产及生态环境改善中发挥着重要作用。已知某些披碱草属植物带有香柱菌属Epichloe内生真菌。但对二者之间的演化关系尚未详细研究。本研究... 宋辉关键词:披碱草属 大麦属 内生真菌 系统发育 宿主特异性 进化 基于act序列中国西部披碱草属植物所带内生真菌的系统演化 被引量:3 2015年 【目的】研究中国西部披碱草属植物(Elymus spp.)所带无性世代内生真菌的系统进化关系。【方法】克隆15条分离于中国西部披碱草属植物无性世代内生真菌肌动蛋白基因(act)序列,并与下载自GenBank中内生真菌的act序列共同构建系统进化树和网络结构拓扑图。【结果】供试无性世代内生真菌act序列均为单拷贝基因。系统进化关系表明,它们与分离于北美洲披碱草属植物的有性世代内生真菌Epichloe elymi存在不同的起源,而与分离于北美洲直芒草(Achnatherum eminens)的无性世代内生真菌Neotyphodium chisosum具有较近的亲缘关系。进一步研究发现,由北美洲直芒草无性世代内生真菌N.chisosum形成的单元型Hap 8与本研究菌株所组成的单元型Hap 3之间可能存在基因流。 宋辉 李秀璋 鲍根生 宋秋艳 田沛 南志标关键词:内生真菌 肌动蛋白 系统发育 茄腐镰孢(Fusarium solani)线粒体基因组密码子偏好性分析 被引量:10 2015年 密码子使用偏好性作为功能基因组重要的进化特征而被广泛报道,但是有关真菌线粒体基因组密码子使用偏好性的研究相对较少。本试验以茄腐镰孢线粒体基因组为研究对象,运用Codon W软件及RSCU在线软件对所筛选到的22条编码基因密码子3个位置上的GC含量、有效密码子数、同义密码子使用频率和最优密码子进行了分析。同时,确定了茄腐镰孢线粒体基因组的最优密码子,并探讨了影响密码子偏性形成的相关因素。分析结果表明,茄腐镰孢线粒体密码子3位的GC含量为GC1(32.7%)>GC2(28.0%)>GC3(19.7%),第3位GC含量明显小于第1、2位,表现出对以A或者T结尾的密码子发生较强烈的偏向使用;且确定的21个最优密码子中有20个以A或者T结尾。通过中性绘图及ENC分析得出茄腐镰孢线粒体基因组密码子的使用偏好受到选择作用和突变压力的共同影响,选择作用为主要影响因素。 李秀璋 宋辉 李春杰关键词:真菌 线粒体基因组 密码子偏好性 山西某公司申请公示催告及其票据纠纷的案例分析 随着市场经济的不断发展,票据作为商业活动的载体之一,正发挥着越来越重要的作用,并日益被人们认识和广泛使用。但是因为票据是流通性证券,在票据的持有和流转过程中,难免会出现票据丧失,虽然这只是票据流通过程中的非正常情况,但却... 宋辉关键词:票据 公示催告 失票救济 文献传递