戢茜
- 作品数：4 被引量：36H指数：3
- 供职机构：上海大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会重点学科基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 拟南芥、水稻和杨树ACTIN家族全基因组分析被引量：19
- 2009年
- 鉴定了覆盖拟南芥、水稻和杨树3种模式植物全基因组的20个拟南芥、18个水稻、22个杨树ACTIN蛋白基因,对其染色体定位、基因结构、基因复制等进行了综合分析.并在系统进化分析基础上,将ACTIN基因家族分为12个亚家族,有助于揭示植物ACTIN基因家族的进化历史,为后续ACTIN基因家族的功能提供线索,对研究植物ACTIN基因家族功能和进化上的多样性提供理论基础.
- 郭景康陈青云戢茜张亮生王健
- 关键词：拟南芥水稻杨树
- 基于SNP实验流程的信息管理系统被引量：8
- 2007年
- 针对研究单核苷酸多态性(SNP)分子生物实验的特点和需求,利用Java技术开发一套基于SNP实验流程的,并且集成TaqMan、Sequencing、Illumina 3个实验平台数据的实验室信息管理系统。系统为B/S体系,采用基于MVC(Model-View-Con- troller)模式的J2EE架构,层次清晰、界面友好、使用方便、支持多用户同时在线操作,且可跨操作系统平台(Windows/Linux/ Unix)运行。本文简要介绍系统的设计思路、体系架构、实现过程和主要功能。本系统实现了实验室数据的收集、存储、整合、查询,提高实验室的工作效率和管理水平,可为今后分子生物学、化学、医学以及其他实验学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。
- 李罡黄懿戢茜袁一吴坚王超郭景康王健
- 关键词：实验室信息管理系统单核苷酸多态性JAVA
- 水稻、拟南芥和杨树基因组HSF及bZIP转录因子超家族生物信息学研究
- 热激转录因子(HSF)是生物体内调节热激反应应答的主要的转录因子。被子植物的两种模式生物水稻和拟南芥的基因组全序列已经测序完成，这些序列数据提供了极有价值的进行比较基因组分析的资源。对这两个物种中的热激转录因子转录因子家...
- 戢茜
- 关键词：超家族生物信息
- 文献传递
- 拟南芥和水稻SET结构域基因家族全基因组鉴定、分类和表达被引量：9
- 2009年
- SET(Su(var),Enhancer of zeste(E(z)),and Trithorax)结构域基因家族是一组含有保守SET结构域的蛋白的统称,它们参与蛋白甲基化,影响染色体结构,并且调控基因表达,在植物发育中起着重要的作用。分析拟南芥和水稻中SET结构域基因家族进化关系,对研究这一基因家族中各成员的功能有着重要的意义。我们系统地鉴定了47个拟南芥(Arabidopsis thaliana)和43个水稻(Orysa sativa japonica cultivar Nipponbare)的SET结构域基因,染色体定位和基因复制分析表明SET结构域基因扩增是由片段复制和反转录引起的,根据这些结构域差异和系统发育分析把拟南芥和水稻的SET结构域基因划分成5个亚家族。通过分析SET结构域基因家族在拟南芥和水稻各个发育阶段的表达谱,发现SET结构域基因绝大部分至少在一个组织中表达;大部分在花和花粉中高表达;一些SET结构域基因在某些组织中有特异的表达模式,表明与组织发育有密切的关系。在拟南芥和水稻中分别找到了4个差异表达基因。拟南芥4个差异基因都在花粉管高表达,水稻4个差异基因有3个在雄性花蕊中高表达,另一个在幼穗中高表达。
- 张亮生马成荣戢茜王翼飞
- 关键词：拟南芥水稻进化分析
