- 甲酰胺水溶液的分子动力学模拟被引量：8
- 2008年
- 为了解重要的生化模型甲酰胺在水溶液中的微观结构,采用全原子力场在全浓度范围内对甲酰胺溶液进行了分子动力学模拟,得到了溶液的径向分布函数,分析计算了溶质和溶剂分子间的相互作用,对甲酰胺和水分子的氢键缔合情况进行了分析.研究发现羰基侧的H原子与水分子能形成C—H…O弱相互作用.在作者早期的研究中发现,此相互作用对于阻碍甲酰胺的异构化具有重要意义,特别是当甲酰胺在溶液中含量增大时,此相互作用更加不能忽视.全浓度溶液的模拟表明,甲酰胺在稀浓度区可以促进水局部结构的增强,随FM浓度增加,由水的自身缔合转变为水与FM的交叉缔合,在FM高浓度区,两者的交叉缔合将逐渐被甲酰胺自身的线状缔合代替.
- 沈秋婵梁婉春胡兴邦李浩然
- 关键词：分子动力学模拟氢键径向分布函数甲酰胺
- 水在甘氨酰胺质子转移过程中的作用
- 甘氨酰胺由于中含有类似肽键的结构而经常被用作一些 N 端氨基酸的模型。本文采用量子化学计算对有水参与的甘氨酰胺的质子转移过程进行研究,发现当水处于不同位置时, 以及水分子个数不同时,其作用也是不完全相同的．单个水分子位于...
- 孙勇李浩然梁婉春
- 关键词：质子转移
- 文献传递
- 水对5-氟尿嘧啶质子转移影响规律的研究被引量：14
- 2005年
- 采用密度泛函理论(DFT)B3LYP方法,在6-311++G(d,p)基组上研究了由质子转移引起的5-氟尿嘧啶(5-FU)的异构化反应.共研究了38个含水与不含水的构型,其中包括15个过渡态结构.研究发现,在5-氟尿嘧啶周围存在两类不同的区域,在其中一类区域中,水分子能促进质子转移的发生;而在另一类区域中,水分子却能阻碍质子转移的发生.通过与尿嘧啶质子转移过程相比较,发现在各种情况下5-氟尿嘧啶异构化为烯醇式的几率均比尿嘧啶的大,在一定程度上解释了为什么5-氟尿嘧啶具有优良抗癌作用的同时具有一定的毒副作用.
- 胡兴邦李浩然梁婉春韩世钧
- 关键词：密度泛函理论5-氟尿嘧啶质子转移异构化
- 溶液环境中水对甲酰胺质子迁移影响的密度泛函研究(英文)被引量：2
- 2006年
- 甲酰胺酮式和烯醇式的互变异构(FM→FA)可被视为DNA中生物碱基点突变的一个模型.使用B3LYP密度范函的计算方法,在B3LYP/6-311++G**的基组条件下运用SCRF溶液模型研究了溶液环境对甲酰胺互变异构的影响.研究表明,从水分子对甲酰胺异构的作用进行划分,分子的周围有三个不同的区域,和气态计算结果一致,在一些区域中,水对异构起到了催化的作用;而在其它区域中,水分子却能阻碍反应的进行,保护酮式,同时溶液环境的存在也使两种作用得到了加强和削弱.溶液状态下的质子转移研究将会对水分子对中心分子的异构化研究提供参考,同时也部分解释了试验中酮式比例高于烯醇式的现象.
- 梁婉春李浩然胡兴邦韩世钧
- 关键词：甲酰胺异构化质子转移
