王甦民
- 作品数：131 被引量：1,056H指数：18
- 供职机构：北京结核病控制研究所更多>>
- 发文基金：首都医学发展科研基金国家科技重大专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学机械工程更多>>
- 北京地区对卷曲霉素和阿米卡星耐药结核分枝杆菌的rrs和tlyA基因突变研究被引量：6
- 2015年
- 目的探讨北京地区结核分枝杆菌卷曲霉素（Cm）和阿米卡星（Am）耐药与rrs基因和ayA基因突变相关性。方法采用比例法对保存的临床菌株进行Cm和Am药敏试验测定，并对其中的临床菌株rrs基因和tlyA基因进行PCR、测序分析。筛选得到了10株Am耐药菌株、25株Cm耐药菌株、15株Am和Cm交叉耐药菌株，并选择了30株敏感菌株作为对照分析。数据采用SPSS17．0进行统计分析，组间率的比较采用Fisher精确概率法检验，P〈0．05为差异有统计学意义。结果tlyA基因突变结果显示，Cm耐药菌株有6株突变（24．0％，6／25），与敏感菌株相比差异有统计学意义（P〈0．05），Am耐药菌株、Am和Cm交叉耐药菌株与敏感菌株相比差异无统计学意义（P〉0．05）；在rrs基因检测中，Am耐药、Cm耐药、Am和Cm交叉耐药突变率分别有30．0％（3／10）、8．0％（2／25）和26．7％（4／15），敏感菌株中也有10．0％（3／30）突变株，3组耐药菌株与敏感菌株比较，差异均无统计学意义（F=2．353、0．06、1．161，P值均〉0．05）。在3组中，rrs基因A1401G突变位点突变比例分别是10．0％（1／10）、8．0％（2／25）和13．3％（2／15），1株在Am和Cm交叉耐药双位点突变，共计6株A1401G位点突变菌株，与敏感菌株比较无统计学意义（P〉0．05）。另一突变位点C1402T在Am、Am和Cm交叉耐药中各1株。结论结核分枝杆菌tlyA基因可能与Cm耐药相关，与Am耐药不相关；rrs基因A1401G和C1402T突变可能与Am和Cm交叉耐药有关。
- 孙勇邢青张治国易俊莉王甦民李传友
- 关键词：结核分枝杆菌卷曲霉素丁胺卡那霉素细菌蛋白质类突变
- 结核分枝杆菌毒力相关基因的研究 结核分枝杆菌DNA指纹技术及其应用研究
- 王甦民
- 关键词：结核病毒力基因结核分枝杆菌
- 反相斑点杂交快速检测结核分枝杆菌rpoB基因突变被引量：13
- 2005年
- 目的建立以聚合酶链反应(PCR)为基础的寡核甘酸探针反相斑点杂交方法快速检测对利福平耐药的结核菌相关的rpoB基因突变,并评价其临床应用价值。方法应用PCR反相斑点杂交方法对利福平耐药的62株结核菌和对其敏感的40株结核菌进行检测,所得结果与传统药敏试验结果以及102株结核菌的直接测序结果进行比较。结果62株对利福平耐药的菌株中,54株碱基突变被准确鉴定,灵敏度为87.1%(54/62),阳性预测值为100%;40株对利福平敏感的菌株均被准确鉴定,特异性为100%,阴性预测值为83.3%(40/48);准确度为92.2%(94/102)。与测序法结果符合率为99%。结论以PCR为基础的反相斑点杂交方法其敏感度和特异性均高,无假阳性结果,因此适用于大批量结核菌对利福平耐药性的初筛。
- 刘洋王甦民郭艳玲姜广路刘宇红付育红毕志强赵丽萍李云絮
- 关键词：RPOB基因突变结核分枝杆菌利福平耐药阳性预测值阴性预测值直接测序
- 158株结核分枝杆菌北京基因型的耐药特征研究被引量：1
- 2009年
- 我国是结核病高耐药国家，而高耐药率给结核病患者的治疗带来很大困难，并对其流行产生严重影响。本研究同时采用IS6110-RFLP、Spoligotyping对结核分枝杆菌进行基因分型，探讨不同地区不同基因型的耐药特点及北京基因型与4种药物[利福平（RFP）、异烟肼（INH）、链霉素（SM）、乙胺丁醇（EMB）]耐药的关系。
- 郭艳玲刘洋王甦民李传友宋长兴
- 关键词：结核北京基因型耐药
- 人类白细胞抗原DRB1基因与肺结核的相关性研究被引量：45
- 2001年
- 目的 探讨HLA DRB1基因多态性与肺结核 (PTB)的遗传关联性及其与临床表现的关系。方法 采用聚合酶链反应 序列特异性引物 (PCR SSP)方法 ,对 74例PTB患者及 90名正常人的HLA DRB1等位基因进行分型。结果 与对照组相比 ,PTB病例组的DRB1 15等位基因频率显著增高 (34 3%比 17 0 % ,Pc<0 0 5 ,RR =2 91) ,HLA DRB1 12基因频率高 (15 4%比 7 5 % ) ,但统计学上无显著性差异 (Pc>0 0 5 ) ;而DRB1 11基因频率显著低于对照组 (1 4%比 9 9% ,Pc <0 0 5 ,RR =0 12 )。HLA DRB1 15阳性患者中复治病例数和耐药病例数均显著高于HLA DRB1 15阴性组 (P <0 0 5 )。结论 HLA DRB1 15可能是PTB的易感基因 ,DRB1 11可能为保护基因 ,HLA DRB1 15基因与PTB临床特征有一定相关性。
- 王敬慧宋长兴王甦民胡秀玲刘忠泉
- 关键词：肺结核人类白细胞抗原聚合酶链反应序列特异性引物DRB1基因
- PCR-荧光探针法检测临床痰标本结核分枝杆菌的可靠性研究被引量：13
- 2012年
- 目的评价PCR-荧光探针法快速检测Mtb和非结核分枝杆菌(NTM)的临床应用价值。方法应用分枝杆菌核酸检测试剂对1015例痰标本和56株临床分离株进行检测,与Mtb核酸扩增(PCR)荧光(目前临床上认可惟一同类产品)检测结果进行比较。采用SPSS 11.5统计软件进行数据统计处理,采用χ2检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果PCR-荧光探针法检测痰标本分枝杆菌灵敏度50.3%(373/741),特异度98.9%(271/274);菌阳肺结核标本检测灵敏度97.0%(257/265),菌阴肺结核标本检测灵敏度24.4%(116/476);1015份痰标本中检测出11例非结核分枝杆菌(NTM)核酸阳性标本(占1.1%),经16SrDNA测序确认,准确率100.0%。随机数字量表法抽取138例标本重复进行第2次检测,符合率100.0%。对56株临床分离株(1株Mtb临床分离株,55株NTM临床分离株)检测,准确率100.0%。对临床需要的226份标本同时与达安公司试剂盒检测结果比较,总体符合率95.1%(215/226),经统计学分析,两者之间差异无统计学意义(χ2=2.98,P=0.226)。结论PCR-荧光探针法可快速检测和区分痰标本Mtb与NTM,具有临床推广应用价值。
- 梁建琴高华方李洪敏赵智贤张广宇王金河王甦民刘佳文
- 关键词：分枝杆菌属聚合酶链反应荧光染料
- 潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选被引量：4
- 2013年
- 目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因,应用SYFPEITHI生物信息学软件分析相关基因编码的多肽序列中可能存在的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位;利用T2细胞进行HLA-A2结合试验,检测候选表位肽的结合亲和性,以HLA-A2解离试验检测其结合稳定性,从而筛选出HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。结果从SYFPEITHI数据库预测到的表位肽中筛选出4条能够结合HLA-A*0201分子的表位肽,通过HLA-A2结合试验得到Rv0440-1(KLQER-LAKL)、Rv0440-9(TLLKGAKEV)、RV0350-6(VLKGEVKDV)与HLA-A*0201分子之间均有较高的亲和性(FR>1.5),通过HLA-A2解离试验得到候选表位肽Rv0440-1和Rv0440-9与HLA-A*0201分子的结合具有较高的稳定性(DC50>4h)。结论经生物信息学技术预测以及HLA-A2结合与解离试验初步筛选出的Rv0440-1(KLAGGVAVI)和Rv0440-9(TLLKGAKEV)是潜伏期结核分枝杆菌HLA-A*0201限制性CD8+CTL的优势表位,但有待进一步实验验证。
- 孙燕妮王一松王海霞平国玲王甦民张力平
- 关键词：H37RVCTL表位
- 结核分枝杆菌DNA分型技术及其应用
- 2006年
- 在结核分枝杆菌基因组插入序列中，IS6110是最有特点的插入序列，同时结核分枝杆菌基因组内除IS6110插入序列外。还有多个插入序列和重复元件。如IS1081、PGRS、VNTR、DR等等，利用这些插入序列或重复序列，通过扩增或酶切杂交获得象人体指纹一样的特异带型，即DNA指纹图谱，由此建立的方法就称为DNA指纹技术。
- 王甦民郭艳玲李传友刘洋
- 关键词：结核分枝杆菌DNA指纹图谱IS6110DNA指纹技术VNTR
- 结核分支杆菌基因组DNA指纹技术在结核病流行病学中的应用被引量：14
- 2001年
- 王甦民李卫民
- 关键词：结核病流行病学DNA指纹技术
- 北京市朝阳区肺结核病实验室痰涂片镜检室间质控结果分析
- 2009年
- 目的对2006-2008所辖范围内的12家肺结核病防治站和12家开展抗酸杆菌(AFB)镜检的二级以上综合医院结核病实验室的痰涂片AFB镜检的质控结果进行评估。方法按照《中国结核病防治规划-痰涂片镜检质量保证手册》(EQA)的要求,对结核病实验室进行现场评价和盲法复检。结果2006-2008年痰涂片盲法复检总涂片数1671份,复检定性符合率为95.2%、阳性定量符合率为70.2%,综合医院定性符合率95.6%、阳性定量符合率64.9%;肺结核防治站定性符合率为94.7%、阳性定量符合率为75.0%。痰涂片质量指标:痰细胞、大小、厚薄、染色、脱落合格率分别为93.4%、66.1%、75.4%、91.0%、97.1%。结论在现场评估中,肺结核病防治站痰检人员固定,经培训后上岗,肺结核病防治站在实验室面积、仪器设备优于综合医院。综合医院痰检人员的学历和职称高于肺结核防治站。肺结核防治站的涂阳患者检出率高于综合医院。
- 赵平张淑芳张秀芝朱建华王甦民丁北川
- 关键词：肺结核抗酸杆菌痰涂片室间质控
