陈莹莹
- 作品数：11 被引量：17H指数：3
- 供职机构：河北农业大学园艺学院中国枣研究中心更多>>
- 发文基金：河北省科技支撑计划项目国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 枣转录因子ERF 3′端序列克隆及生物信息学分析
- 2014年
- 以枣为试材,根据GenBank中登录的苹果、拟南芥等植物EFR保守序列设计引物,采用同源克隆法克隆出该基因3′端序列并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:该试验克隆获得1条长度为959bp的条带;经过序列分析,该序列包含典型的AP2/EREBP保守结构域,与桑树、欧洲山毛榉和欧洲栗ERF基因序列相似度分别为79%、78%、77%;系统进化树分析显示,枣的ZjERF与可可树、陆地棉和海岛棉的AP2/EREBP亲缘关系较近,属于ERF家族的B2亚群;此外,还用Swiss Model程序(http://au.expasy.org/tools/)预测了ZjERF基因编码蛋白的三维结构。
- 陈莹莹苑赞赵锦刘孟军
- 关键词：生物信息学分析
- 枣GDPD甘露糖焦磷酸化酶基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2015年
- GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-D-mannose pyrophosphorylase,GMP)是植物As A生物合成的第一个关键酶,至今未见该基因在枣中的相关报道。本研究根据Gen Bank中登录的苹果、桃和草莓等植物GMP保守序列设计引物,采用同源克隆法,从"骏枣"果实中克隆出该基因并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。该基因包含完整的开放阅读框为1086bp,编码361个氨基酸残基,预测蛋白分子量为39.588ku,理论p I值为7.12,命名为Zj GMP(登录号KJ934995);序列分析表明,枣GMP与桃、葡萄、草莓、苹果GMP的相似性分别为88%、87%、87%和87%。进化树分析表明,该基因与桃、苹果和草莓等植物的GMP亲缘关系较近。
- 陈莹莹赵智慧卜娇迪赵锦刘孟军
- 关键词：基因克隆生物信息学分析
- 响应面法优化超声提取真空冷冻干燥中华苦荬菜总黄酮工艺研究被引量：1
- 2014年
- 首次研究了真空冷冻干燥中华苦荬菜总黄酮提取工艺,为我国野生中华苦荬菜资源的利用提供一些依据。采用响应面法优化乙醇浓度A、超声时间B和料液C比3个因素,分析并建立数学模型。结果表明超声时间对总黄酮提取率达到极显著水平(P<0.01),料液比对总黄酮提取率达到显著水平(P<0.05)。在乙醇浓度为45%,超声时间30 min,料液比为1:20条件下,总黄酮提取率为最高,为3.62%。所得回归方程为Y=3.61+0.12A+0.26B+0.18C+0.037AB+0.11AC+0.21B C-0.61A2-0.4B2-0.4C2.
- 石同同陈莹莹王颉孙剑锋张玉芬郑乾魏
- 关键词：总黄酮超声提取响应面
- 枣甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆及表达分析被引量：4
- 2015年
- 以‘金丝小枣’为试材,根据GAPDH基因保守序列设计引物,采用同源克隆和RT-PCR法,克隆枣GAPDH基因并进行生物信息学及转录表达分析。结果表明:该基因包含完整的开放阅读框为1 020bp,编码339个氨基酸残基,预测分子量为36.904kDa,理论等电点为8.53,命名为ZjGAPDH(KP147910);该蛋白包含2个保守结构域,即Gp_dh_N superfamily和Gp_dh_C superfamily;系统进化树分析表明,ZjGAPDH与其它物种GAPDH蛋白的同源性相对较小,但均属于存在细胞质中参与糖酵解过程的蛋白;实时荧光定量分析表明,ZjGAPDH基因在枣果实不同发育时期中表达有显著差异,在幼果期和全红期果实中的表达丰度较高。
- 卜娇迪陈莹莹刘孟军赵锦
- 关键词：克隆
- 枣60S核糖体蛋白L8-3基因的克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2015年
- 核糖体是细胞进行蛋白质合成的重要场所。为了解枣60S核糖体蛋白L8-3基因的结构,以‘月光’枣为材料,根据GenBank中登录的苹果、桃和柑橘等植物60S核糖体蛋白保守序列设计引物,采用RT-PCR法,从枣叶片中克隆出该基因,并对其编码蛋白进行了生物信息学分析。生物信息学分析表明:该基因包含完整的开放阅读框为783bp,编码260个氨基酸残基,预测分子量为28.025kDa,理论等电点为10.83,命名为ZjRPL8-3(登录号:KM106202);保守结构域分析表明,该序列属于L2超家族蛋白;分子进化树显示,枣ZjRPL8-3与蔷薇科植物中该基因的蛋白序列亲缘关系最近,此结果一定程度上反应了物种间的亲缘关系。
- 卜娇迪陈莹莹刘孟军赵锦
- 关键词：核糖体蛋白克隆生物信息学分析
- 枣脱氢抗坏血酸还原酶基因的克隆及其表达分析
- 脱氢抗坏血酸还原酶(Dehydroascorbate reductase,DHAR)通过抗坏血酸—谷胱甘肽循环将氧化型抗坏血酸还原为还原型抗坏血酸,在循环利用抗坏血酸、保护细胞组分抵御氧化损伤中发挥着重要的作用。DHAR...
- 陈莹莹赵锦刘孟军
- 关键词：脱氢抗坏血酸还原酶基因克隆
- 文献传递
- 枣L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶cDNA克隆及生物信息学分析
- 2014年
- 枣果是抗坏血酸含量最高的果实之一,而L-半乳糖-1-磷酸磷酸酶(L-galactose-1-phosphate phosphatase,GPP)基因是抗坏血酸合成中的一个重要基因,至今未见该基因在枣中的相关报道。本研究根据GenBank中登录的苹果、桃和拟南芥等植物GPP保守序列设计引物,采用RT-PCR法,从‘金丝小枣’(Ziziphus jujuba‘Jinsixiaozao’)叶片中克隆出该基因并对其编码的蛋白进行了生物信息学分析。该基因包含完整的开放阅读框为813bp,编码270个氨基酸残基,预测分子量为29.083kDa,理论pI值为5.28,命名为ZjGPP(登录号KJ739593);进一步的生物信息学分析表明,该序列具有典型的肌醇单磷酸化酶结合区域,属于FIG家族蛋白;其氨基酸与其他植物GPP基因具有较高的同源性。进化树分析表明,该基因与桃、苹果和刺梨等蔷薇科植物的GPP亲缘关系较近。
- 陈莹莹赵智慧卜娇迪赵锦刘孟军
- 关键词：克隆生物信息学分析
- 沧州金丝小枣种植生产中存在的问题及发展建议
- 金丝小枣栽培历史距今已有3000多年,已经成为当地农民的主要经济作物.但是沧州金丝小枣的种植生产中存在许多问题,本文分析了当前栽培生产中存在的栽植过密、盲目施肥、整形修剪方法不合理、农药滥用、保花保果措施不当、品种类型良...
- 陈莹莹李超赵锦刘孟军
- 关键词：金丝小枣合理施肥疾病预防
- 超声耦合丙醇—硫酸铵双水相体系提取中华苦荬菜多酚工艺研究
- 2014年
- 对50℃烘干的中华苦荬菜多酚进行了超声耦合丙醇-硫酸铵双水相系统提取工艺的研究,采用响应面法优化A丙醇浓度、B超声时间和C料液比三个因素,分析并建立数学模型。结果表明:A丙醇浓度、B超声时间、C料液比均对多酚得率达到极显著水平(P<0.01)。中华苦荬菜多酚提取的最佳方案为丙醇浓度60%,超声时间30min,料液比1∶20,在此工艺条件下,中华苦荬菜多酚得率的预测值为1.71%。所得回归方程为Y=1.71+0.12A+0.10B+0.052C+0.030AB+0.037AC+0.0130BC-0.14A2-0.13B2-0.12C2。
- 石同同陈莹莹王颉孙剑锋张玉芬
- 关键词：多酚超声双水相
- 超声波辅助提取中华苦荬菜多酚工艺优化及不同干燥方式对其得率的影响
- 2013年
- 文中对50℃烘干的中华苦荬菜多酚进行了超声提取工艺的研究,采用响应面法优化了乙醇浓度(A)、超声时间(B)和料液比(C)3个因素,分析并建立数学模型。结果表明:乙醇浓度对中华苦荬菜多酚得率有极显著影响(P<0.01),料液比具有显著影响(P<0.05)。在乙醇体积分数为60%,超声时间60 min,料液比为1∶20(g∶mL)条件下,多酚得率可达1.84%。在最佳提取条件下分别对真空冷冻干燥、红外干燥、自然阴干、烘干及自然晒干的中华苦荬菜进行提取并测定,试验结果表明:真空冷冻干燥的中华苦荬菜多酚得率高,为3.22%,自然晒干的中华苦荬菜多酚得率低,为1.23%,干燥效果依次为冻干>红外干燥>烘干>阴干>晒干。所得回归方程为Y=1.87+0.18A+0.056B+0.071C+0.067AB-0.013AC+0.030BC-0.36A2-0.057B2-0.18C2。
- 石同同陈莹莹王颉孙剑锋郑乾魏
- 关键词：多酚超声提取响应面
