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合成微生物群落的构建与应用被引量：12: 2021年; 自然界中微生物群落的生态网络结构非常复杂,并且难以进行可重复、可控的扰动实验.在实验室里通过“自下而上”的方式构建起来的合成群落具有适中的复杂度和较高的可控性,可以作为数学模型和复杂生态系统研究之间的桥梁.合成微生物群落的研究方法遵循“设计-构建-测试-学习”为核心的合成生物学理念,以人工设计和构建的群落为实验对象,结合定量模型和基因组测序等组学技术,探索微生物生态学的基本规律.在应用方面,基于合成群落的研究对于如何控制和改造复杂的微生物生态系统具有重要的指导意义,目标是通过构建具有可控功能和稳定性的微生物群落来解决人体健康、农业和工业生产、环境治理等重要问题.; 陈沫先韦中田亮谭扬黄建东黄建东; 关键词：数学模型高通量测序相互作用

工程菌在肿瘤治疗方面的应用进展被引量：1: 2023年; 肿瘤的细菌治疗最早可以追溯到19世纪,人们第一次利用链球菌(Streptococcus pyogenes)成功治疗了患有无法手术切除的肉瘤患者。此后,细菌在肿瘤治疗上的研究越来越多,并取得了令人期待的结果。与其他肿瘤治疗方法相比,细菌治疗肿瘤具有许多独特的优点。随着合成生物学的发展,人们对细菌进行改造后大大增强了其在肿瘤治疗中的运用。本文介绍了细菌改造策略和应用进展,特别是鼠伤寒沙门氏菌治疗肿瘤的研究。在动物模型中,工程菌可以选择性定植到肿瘤组织中并抑制肿瘤的生长。此外,介绍了工程菌治疗肿瘤的新策略——表达抗肿瘤分子来提高肿瘤治疗的效果。最后,讨论了工程菌治疗肿瘤运用于临床还有一些需要解决的问题,如何平衡细菌毒力和抗肿瘤能力是一个关键点,需要设计更精巧的基因线路来对细菌进行改造。在减弱细菌毒力的同时,还要增强细菌靶向到肿瘤组织的能力,以减少对其他正常组织的影响。细菌的遗传不稳定性也是一个潜在的问题,因为突变可能会产生无效或有害的表型。但是,随着合成生物学的发展,在不久的将来,上述问题将会得到解决,细菌治疗将会是一种具有巨大潜力的肿瘤治疗的方法。; 陈家文黄建东黄建东; 关键词：工程菌肿瘤

使用益生菌治疗癌症的方法和组合物: 本发明涉及益生菌组合物和使用益生菌组合物治疗肝细胞癌(HCC)的方法。益生菌组合物可抑制HCC的生长。益生菌组合物可减少HCC的风险。益生菌组合物包含3种细菌组合物的特定的组合：(a)热灭活的嗜酸乳杆菌(Moro)？Ha...; H.埃-内扎米李珮瑜黄建东宋颖如

经修饰的细菌和它们用于治疗癌症或肿瘤的用途: 本文提供了一种使用经修饰的细菌以及包含所述经修饰的细菌的治疗性或预防性组合物治疗癌症或肿瘤的方法。所述方法可与其它治疗相组合，例如化学疗法、放射疗法、基因疗法、外科手术或它们的组合。所述方法使经修饰的兼性厌氧性细菌成为条...; 黄建东于斌杨梅石蕾

小鼠模型与人类疾病被引量：15: 2001年; 小鼠是人类疾病理想的动物模型，不仅因为小鼠在生理上与人类极为相似而且小鼠的遗传资源非常丰富，其大量的遗传变异可作为研究人类疾病的借鉴。另外，高分辨率的小鼠遗传及物理连锁图谱已经建成，小鼠基因组的测序工作不久即将完成，而且修饰小鼠基因组的技术（包括建立转基因小鼠、基因敲除、以及改建小鼠染色体的技术）也已具备；分析复杂遗传病的方法也相继建立……。这些进展加速了对小鼠疾病基因位点的鉴定与克隆，同时也促进了新模型的建立。从而使得小鼠成为人类疾病动物模型的首选。 "小鼠遗传学分析的技术与资源"，将简要介绍用于建立人类疾病的动物模型的基本技术与方法，以及现有的小鼠遗传资源。在以后各部分中，将列举涉及多种人类疾病的 100多个小鼠模型。其中大多数的模型的变异，在小鼠与患者的表型极为相似；因而有助于人们理解人类疾病及寻找有效的预防、治疗方法。; 孔祥复黄建东; 关键词：小鼠模型人类疾病疾病动物模型

合成生物学在探索生物图案形成基本原理中的应用与展望: 2020年; 自然界中不同生物图案形成的背后是否存在普遍规律,是生物学最基本的科学问题之一。然而,生物系统的复杂性给归纳、理解和验证潜在的普遍规律带来了极大挑战。合成生物学采用自下而上的工程策略,利用功能明确的基因元件构建定量可控的合成体系,为解析生物图案形成的基本原理带来了新的契机。本文围绕合成生物学在生物图案形成研究中的应用,重点阐述了利用合成生物系统验证成形素浓度梯度模型和反应-扩散模型等现有生物图案形成理论的研究进展,并总结了合成生物学在探索生物图案尺寸调控、周期性生物图案形成和多细胞结构产生新机制中的重要贡献。最后提出对合成系统的研究与发育生物学的进一步交互有望拓展对自然生物图案形成的认知,并指出合成生物图案今后在生物材料制造、再生医学和组织工程等领域的应用价值和前景。; 周楠夏婷颖黄建东; 关键词：合成生物学

靶向引起病毒感染的SARS相关冠状病毒刺突蛋白上的关键位点的合成肽以及其使用方法: 本发明提供了，用于定位SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)的刺突蛋白(S蛋白)上的关键部分或位点的方法，所述部分或位点引起导致严重的急性呼吸综合征(SARS)的病毒感染。本发明还提供了靶向这种SARS-CoV的S蛋白...; 郑伯建管轶黄建东何明亮; 文献传递

靶向引起病毒感染的SARS相关冠状病毒刺突蛋白上的关键位点的合成肽以及其使用方法: 本发明提供了，用于定位SARS相关冠状病毒(SARS－CoV)的刺突蛋白(S蛋白)上的关键部分或位点的方法，所述部分或位点引起导致严重的急性呼吸综合征(SARS)的病毒感染。本发明还提供了靶向这种SARS－CoV的S蛋白...; 郑伯建管轶黄建东何明亮; 文献传递

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黄建东