盛新颖
- 作品数:6 被引量:33H指数:4
- 供职机构:安徽农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:安徽高校省级自然科学研究基金安徽省高等学校优秀青年人才基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 利用SSR分子标记鉴定“梅桥”大豆种质纯度被引量:5
- 2010年
- "梅桥"大豆是安徽省淮北地区农家菜用大豆品种,长年的连续种植导致纯度比较混杂,产量明显下降,利用SSR分子标记技术对92单株"梅桥"大豆种质纯度进行鉴定,以期为梅桥大豆的提纯复壮提供理论依据。结果表明:采用改良的CTAB方法,可以提取高质量的大豆基因组DNA;在优化SSR-PCR反应体系的基础上,筛选出8对SSR引物,平均每个引物得到条带数10.6个,条带的多态性频率为70.9%,梅桥大豆的种质纯度为38.04%。
- 盛新颖詹少华樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词:SSR标记大豆DNA提取
- 利用SSR和EST-SSR标记鉴定“梅桥”大豆种质纯度
- “梅桥”大豆以其籽粒饱满、色泽鲜绿、味道鲜美而不腻等优点,成为安徽省淮北地区传统栽培的农家菜用大豆名优品种,由于常年的连续种植,使品种退化、纯度降低、产量和经济效益明显下降。因此,鉴定“梅桥”大豆的种质纯度,将为“梅桥”...
- 盛新颖
- 关键词:大豆分子标记纯度鉴定
- Excel平台的EST-SSR分析方法被引量:2
- 2010年
- 科学工作者在分析EST-SSR特性时需要许多手工操作,这是一个耗时而又容易出错的工作。本文介绍了以Excel平台来计算核苷酸数目、计算特定碱基数量和比例、合并SSR重复基元、筛选基元的重复记录、统计基元的总重复数、计算基元在SSR中最大或最小重复数、截取特定核苷酸序列等方法,这样可以提高分析的效率和准确性,同时对其他DNA或蛋白质序列分析有借鉴作用。
- 詹少华盛新颖蔡永萍樊洪泓林毅
- 关键词:EXCEL表EST-SSREXCEL函数
- 大豆EST序列长度与SSR特性的关系被引量:13
- 2009年
- 为了分析大豆EST-SSR的特征和比较其不同长度EST序列中的SSR特性,从NCBI下载了大豆EST序列,应用SSRIT搜索SSR,分析了20183个无冗余的EST序列,发现了1747个EST序列(8.66%)含有SSR,长度超过400bp的EST序列含SSR的比例为10.05%,而长度在400bp以下的EST序列SSR的比例为4.74%。二核苷酸和三核苷酸SSR是大豆EST-SSR的主要类型,分别的60.45%和37.04%,最常见的SSR基元是:AT、AG、AAT、AC、AAG、ACG。在1798个EST-SSR中,51.45%的长度大于12bp,13.35%长度大于20bp。推断NCBI大豆EST数据库中含有123527个SSR,大豆EST-SSR可用于大豆分子标记,具有重要的开发价值,为有针对性设计EST-SSR引物奠定基础。
- 詹少华盛新颖樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词:大豆表达序列标签
- 大豆二核苷酸SSR侧翼序列保守性分析被引量:4
- 2010年
- 从NCBI下载了大豆的EST和GSS序列,以SSR两侧序列各100 nt的片段作为分析材料,统计SSR数目、计算侧翼序列碱基组成,对SSR侧翼序列进行了序列比对和数据库blast搜索。结果表明:大豆SSR分布频率为1/6.67kb,侧翼序列GC含量为37.83%,二核苷重复是SSR的主要类型(65.7%),同一种重复基元的SSR存在多类型侧翼序列,同一类型的侧翼序列高度保守,不同类型的侧翼序列之间相似性较小,尤其是非SSR区域可以存在与SSR侧翼序列相同的序列。由上述结果推断SSR引物可能扩增出不含SSR的产物,易位可以产生形成新类型SSR。这一分析结果有助于提高SSR引物设计效率和进一步阐明SSR的形成机理。
- 詹少华盛新颖樊洪泓蔡永萍林毅
- 关键词:SSR引物序列保守性二核苷酸大豆侧翼序列NCBI
- 灌溉方式对草莓光合特性和根系生长的影响被引量:9
- 2009年
- 以草莓丰香为材料,探讨三种灌溉方式(沟灌、滴灌、滴灌+半基质)对粘性土壤条件下草莓产量、光合生理指标和根系生长的影响。结果表明:与沟灌相比,滴灌+半基质方式和滴灌方式均能促进草莓的生长和增加其产量,单株产量分别增加36.89%和29.30%,开花期草莓叶片光合速率提高了41.56%和34.46%;在结果期,水分利用率提高了28.69%和24.65%,根冠比提高了51.78%和29.28%;滴灌+半基质方式和滴灌方式更有利于根系生长,开花期根体积提高了164.25%和78.72%、根鲜重提高了117.18%和84.07%、结果期根系活力提高了70.98%和48.38%;滴灌+半基质栽培灌溉方式是一种适宜粘性土壤草莓的灌溉方式。
- 钱小琴聂凡蔡永萍盛新颖聂敬全洪萨丽
- 关键词:灌溉模式光合特性水分利用率