肖熙鸥
- 作品数：46 被引量：163H指数：8
- 供职机构：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学更多>>
- 马铃薯TCP基因家族全基因组鉴定与分析被引量：3
- 2018年
- TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)是植物特有的转录因子,在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界范围重要的粮食作物,有着重要的价值。为研究马铃薯StTCPs基因家族子在马铃薯基因组中的数量与分布,本研究利用生物信息学方法,对马铃薯St TCPs家族成员进行全基因组鉴定,并且对其基因结构,染色体定位以及进化关系进行预测和分析。研究结果表明,马铃薯StTCPs家族共包含43个成员,可以分为ClassⅠ和ClassⅡ两类。染色体定位结果表明,马铃薯StTCPs不均匀地分布于11条染色体上,其中3号染色体分布的成员最多,包含10个家族成员。蛋白结构分析表明,StTCPs包含一个b-HLH结构域。本研究系统的分析了马铃薯StTCPs基因家族成员,为其后续功能的研究提供了良好的基础。
- 肖熙鸥林文秋冯雪峰高晓敏邹华芬李可金辉
- 一种用于茄子种资源鉴定的SNP组合标记
- 本发明提供了一种用于茄子种资源鉴定的SNP组合标记，所述茄子SNP组合标记采用如序列表SEQ NO.ID 1‑144所示引物序列进行鉴定。本发明一种茄子SNP组合标记在品种资源分类、品种资源真实性或品种身份鉴定、品种指纹...
- 肖熙鸥欧雄常吴彩玉林文秋冯恩友
- 茄子种质资源主要性状评价及其相关性分析被引量：13
- 2016年
- 为筛选出高产、耐高低温、适合华南地区种植的紫红长茄,从国内收集茄子种质资源15份,对株高、熟性、果色、单果重、单株产量和果形等主要性状进行描述和相关性分析,并进行单性结实性鉴定。茄子资源主要性状的相关性分析结果显示,单株产量与果实纵径、单果重呈极显著正相关,相关系数(r)分别为0.910和0.880;株高与果形指数呈极显著正相关(r=0.740);熟性与花冠色呈显著正相关,即当花冠色较深时,熟性就较晚。综合来看,比对照显著高产的是‘庆丰二号’,但‘庆丰二号’主茎有刺,果萼也有少量刺,这给果实采摘带来不便;且‘庆丰二号’不具有单性结实能力。‘春秀’和‘公牛长茄’的单株产量与对照相当,但‘春秀’和‘公牛长茄’都具有单性结实能力,即使遭遇高低温障碍也能正常结果,而对照不具有单性结实能力。因此,‘春秀’和‘公牛长茄’优于对照,在华南地区具有一定的推广前景。
- 吕玲玲李威肖熙鸥
- 关键词：茄子种质资源单性结实
- 与茄子果实颜色紧密连锁的SNP分子标记及应用
- 本发明公开了与茄子果实颜色紧密连锁的SNP分子标记及应用，属于分子遗传育种技术领域，其技术方案要点是：SNP分子标记包括SNP分子标记Ⅰ和SNP分子标记Ⅱ；SNP分子标记Ⅰ包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，且S...
- 赵秋芳肖熙鸥马智玲马海洋魏长宾
- 利用SALF-seq简化基因组测序分析茄子种质资源遗传多样性被引量：1
- 2022年
- 为研究茄子种质资源的亲缘关系,本研究利用SLAF-seq (Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing)简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序,利用获得的SNP (Single nucleotide polymorphism)标记进行遗传结构分析。本研究共获得700 639个SLAF标签和1 248 593 SNPs。结果表明,SNP数量在每条染色体上和同一条染色上的不同位置差异较大,注释结果表明SNP和InDel主要发生在基因间隔区。利用获得的SNPs多样性可以将40份材料分为3个类群。SNP分类结果与根据青枯病抗性分类结果基本一致,而与根据果形果色分类结果不一致,通过筛选,获得了高质量的122个perfect SNPs。本研究结果为杂组合的选配提供了参考,同时所开发的SNP位点为KSAP高通量基因分型奠定了良好的基础。
- 冯恩友肖熙鸥林文秋莫定鸣冯晓赓马飞骏
- 关键词：茄子SNP位点
- 利用SRAP分子标记技术分析茄子遗传多样性被引量：4
- 2016年
- 利用SRAP技术对36份茄子栽培种进行遗传多样性分析。结果表明：22对引物对36份茄子DNA进行PCR扩增,经过染色后共获得292条多态性条带,平均每个引物组合扩增出13.27条多态性条带。36份茄子品种间遗传相似系数在0.568-0.870,平均遗传相似系数为0.757,这表明该群体的遗传背景相对狭窄。利用UPGMA法对36份茄子资源进行聚类分析,结果显示,在相似系数为0.690处,可将36份茄子资源划分为5个组。
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- 关键词：茄子SRAP
- 茄子调控抗青枯病反应信号基因的筛选和鉴定被引量：8
- 2016年
- 以抗青枯病茄子自交系‘E-31’为材料,利用病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)技术沉默抗病材料中调控抗病相关的信号基因,研究其在茄子抗青枯病反应中的作用。q RT-PCR结果表明,与对照植株相比,VIGS诱导基因沉默植株,目的基因的表达量均下降。MAPK级联途径相关基因MKK2和MAPK6,SA途径中的信号基因PAD4、NPR1、SGT1、TGA和Glu A,以及WRRY转录因子基因WRKY70沉默,接种青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)后植株出现不同程度的枯萎,而对照植株无变化。MAPK级联途径相关基因MAPK3和MAPK4,SA途径中的信号基因NDR1,ET途径中的信号基因EIN2和EIL1,JA途径信号基因JAR1沉默后,植株均未出现萎蔫症状。研究结果表明,MKK2、MAPK6、PAD4、NPR1、SGT1、TGA、Glu A和WRKY70等基因在茄子调控抗青枯病反应中起正调控作用,而MAPK3、MAPK4、NDR1、EIL1、EIN2和JAR1等基因可能未参与或起负调作用,推断茄子‘E-31’调控青枯病信号途径可能主要依赖于SA途径。
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- 关键词：茄子青枯病SAVIGS
- EDS1正调控茄子抗青枯病反应被引量：4
- 2018年
- EDS1(Enhanced Disease Susceptibility 1)在植物抗病过程中起着关键的作用。为进一步研究其在调控茄子抗青枯病中的作用,根据茄子基因组序列设计引物克隆了EDS1,将其命名为SmEDS1。生物信息学分析表明SmEDS1最大开放阅读框包含1 809 bp,编码602个氨基酸残基。其包含该基因家族典型的LP结构域和EP结构域。为了进一步验证其功能,通过VIGS技术沉默茄子抗青枯病材料SmEDS1后接种青枯病病原菌,7 d后植株枯萎,结果表明EDS1正调控茄子抗青枯病。半定量结果表明,SmEDS1沉默后对其他信号基因的表达量有着显著影响,其中MAPK6、RAR1的表达量上调,而MAPK3、SIPK、PAD4、SGT1、TGA、EDR1、NPR1、ICS1、GLUA、EIL1和HSP90等基因的表达量下调,EBF2和ACO5的表达量不受SmEDS1的调控。此结果表明EDS1在调控茄子抗青枯病中起着重要的作用。
- 李可肖熙鸥林文秋李威吕玲玲曹必好
- 关键词：茄子青枯病
- 利用EMS进行茄子种质资源创新被引量：4
- 2016年
- 【目的】利用EMS诱变进行茄子种质资源创新,为茄子新品种选育及其相关基因功能研究提供良好材料。【方法】在25℃下利用不同浓度(0、0.5%、1.0%、1.5%和2.0%)的EMS溶液诱变处理茄子种子,筛选出适宜的EMS诱变浓度;然后以适宜浓度的EMS诱变液处理茄子种子,经过催芽后播种、定植,在植株的整个生育期进行相关性状调查。【结果】以1.0%EMS诱变处理18 h后,茄子种子的发芽率可达80%,适宜构建茄子突变体库。20 g茄子种子经1.0%EMS诱变处理18 h后催芽播种,最终获得984份M1代突变材料,且这些突变材料在长势、叶片形状、叶片颜色、分枝数、果实长度、果实颜色及雄性不育等方面表现出丰富的变异。【结论】经EMS诱变处理获得的M1代茄子表现出丰富的变异,可为其新品种选育及基因功能研究提供良好材料。
- 肖熙鸥林文秋李威刘国强张晓虹吕玲玲
- 关键词：茄子EMS诱变种质资源
- 一种与茄子果实长度QTL紧密连锁的SNP分子标记及应用
- 本发明涉及分子遗传学技术领域，具体公开了一种与茄子果实长度QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用，本发明首先将果实长度QTL定位在6号染色体上的关联区间内，关联区间内筛选到一个SNP分子标记位于茄子6号染色体的第7995...
- 聂珩肖熙鸥林文秋欧雄常
