基于中药分子机理的生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine,BATMAN-TCM)挖掘浙贝母-瓜蒌治疗慢性阻塞性肺病的分子作用机制。应用BATMAN-TCM预测浙贝母-瓜蒌的潜在靶点,GeneCards数据库检索慢性阻塞性肺病的靶点;应用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-疾病-靶点相互作用网络、蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的生物通路富集分析。结果筛选得到浙贝母-瓜蒌中21种活性成分,基于STRING构建的浙贝母-瓜蒌靶点PPI网络包含131个节点和236条相互作用关系,关键节点包括ANXA1、EDN1、HDAC1、RXRA、ADRA2A、OXT、RXRB等。GO富集分析途径主要涉及离子门控通道活性、底物特异性通道活性、被动跨膜转运活性、细胞外配体门控离子通道活性、神经递质受体活性、配体门控离子通道活性等。KEGG通道分析主要涉及神经活动配体-受体相互作用、cAMP信号通路、钙离子信使通路、类胆碱能突触、逆行内源性大麻素信号传导、5-羟色胺能突触、多巴胺能突触等途径。研究结果提示浙贝母-瓜蒌关键的作用靶点包括ANXA1、HDAC1等,信号通路方面涉及类胆碱能、5-羟色胺、多巴胺等神经受体相关通路,体现了中药复方的整体性特点,为进一步研究浙贝母-瓜蒌的分子作用机制提供了新思路。
基于网络药理学挖掘扶正调理液的分子作用机制,应用BATMAN-TCM在线分析平台预测扶正调理液潜在靶点并构建化合物-靶点-通路-疾病相互作用网络图;应用STRING数据库构建关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,基于基因本体(gene ontology,GO)、Reactome、京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)进行生物通路富集分析;研究扶正调理液对S180荷瘤小鼠体重、进食的影响,计算肿瘤抑制率、胸腺和脾脏指数。结果表明:扶正调理液的靶点网络主要涉及癌症(非特异性)、疼痛、乳腺癌、心血管疾病、炎症反应、前列腺癌、抑郁等疾病;涉及关键靶点如OPRK1、NR3C1、NR3C2、ADORA1、ESR1等;GO富集分析涉及细胞溶质、细胞质膜、氧化还原酶活性、跨膜转运蛋白活性、细胞氨基酸等小分子代谢过程;Reactome通路富集分析涉及神经元系统、跨化学突触的传递、神经递质受体和突触后信号传递等;KEGG通路富集分析涉及神经活动配体-受体相互作用、钙信号通路、血清素能突触、味觉转导、氨基酸代谢、唾液分泌等。动物实验结果显示:低、高剂量组小鼠的进食量、精神状态和被毛的光泽度优于阳性组及阴性组;高剂量组28 d体质量增长率显著高;低剂量、高剂量及阳性组的肿瘤抑制率分别为8.73%、19.54%、47.89%;低剂量组和高剂量组的胸腺指数低于阳性组但显著高于阴性组;高剂量组的脾脏指数显著低于阳性组。本研究提示扶正调理液可能通过影响关键靶点基因的表达,介导神经活动配体-受体相互作用、钙信号通路、血清素能突触、味觉转导、氨基酸代谢、唾液分泌等信号通路,改善焦虑、抑郁等负面心理状态,提高睡眠质量,减轻疲劳,改善食欲和营养状况,增强免疫功能,改善脾脏肿大和胸腺萎缩的状态,增强荷瘤小鼠免疫功能,抑制肿瘤的进展,体现中药复方的
