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许喆

作品数：10 被引量：20H指数：2
供职机构：首都医科大学附属北京天坛医院更多>>
发文基金：国家自然科学基金北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目首都卫生发展科研专项更多>>
相关领域：医药卫生文化科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 10篇医药卫生
  • 2篇文化科学

主题

  • 5篇卒中
  • 4篇基因
  • 4篇基因组
  • 3篇基因组学
  • 2篇血管
  • 2篇血管病
  • 2篇血性
  • 2篇遗传学
  • 2篇缺血
  • 2篇缺血性卒中
  • 2篇文献计量学
  • 2篇脑血
  • 2篇脑血管
  • 2篇脑血管病
  • 2篇计量学
  • 2篇测序
  • 1篇代谢
  • 1篇单细胞
  • 1篇多态
  • 1篇多态性

机构

  • 10篇首都医科大学...
  • 2篇首都医科大学

作者

  • 10篇许喆
  • 6篇李昊
  • 6篇刘阳
  • 3篇王雅杰
  • 2篇李昊文
  • 2篇姜勇
  • 2篇孟霞
  • 2篇王拥军
  • 2篇董成亚
  • 1篇黄泽玉
  • 1篇李子孝
  • 1篇林金嬉
  • 1篇陈燕
  • 1篇贺文艳
  • 1篇刘丽

传媒

  • 7篇中国卒中杂志
  • 2篇标记免疫分析...
  • 1篇继续医学教育

年份

  • 4篇2023
  • 3篇2022
  • 2篇2015
  • 1篇2014
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基因组学技术在卒中研究中的应用进展
2023年
卒中作为典型的复杂疾病,具有病因多样、累及器官多、遗传架构复杂等特点,对我国国民健康造成严重威胁[1]。基因组作为调控个体性状的蓝本,包含全部遗传物质,是研究卒中病因、揭示人群易感性和卒中分子机制的重要对象[2]。随着人类基因组计划的完成[3-4],各种基因组学技术蓬勃发展,为卒中研究提供了新的工具,产出的研究成果深化了对卒中的认识[5]。
许喆程丝李昊
关键词：卒中基因组学测序技术
基因组时代卒中遗传学研究的文献计量学及可视化分析
2023年
目的对人类基因组工作草图公布以来卒中遗传学、基因组学领域已发表的论文进行文献计量学研究,分析该领域的研究现状、热点及发展趋势。方法以一代测序(2000—2007年)、全基因组分型芯片(2008—2015年)和二代测序(2016年至今)为代表性技术,将2000年至今划分为3个阶段。在WebofScience核心合集检索脑血管病领域发表的遗传学、基因组学方面的英文文献,对文献的发表时间、地区、研究机构等信息进行汇总,使用VOSviewer 1.6.18进行统计分析并对结果进行可视化。使用H指数评估论文产出数量与论文水平。结果共纳入8833篇英文文献。美国是卒中遗传学、基因组学领域文献的最主要贡献者,发文量高达3291篇,H指数为182,发文量和H指数在所有国家/地区中均居首位。中国发文1765篇,H指数为66,分别排名第2位和第10位。国际卒中遗传学联盟是该研究领域的重要参与者,联盟和主要负责人的发文量居所有作者的前20名。卒中遗传学、基因组学的研究热点从早期的关联分析和荟萃分析,逐步过渡到近几年兴起的孟德尔随机化研究。结论在卒中遗传学、基因组学领域,我国虽然起步较晚,但在发文总量上有赶超的趋势。我国卒中相关的临床和科研人员应积极参与国内和国际学术合作,进一步提升我国在该领域的影响力。
许喆程丝刘阳石延枫孟霞姜勇李昊
关键词：卒中脑血管病遗传学基因组学文献计量学
举办实验室技术原理及实践培训班的思考及分析
2015年
为满足科研人员常规实验技能的需要,举办了继续教育课程"常用实验室技术原理及实践培训班"。对近3年举办的4期培训班课程进行总结,通过对培训课程安排、参加培训学员的基本情况及学员反馈,分析了培训中遇到的问题,为今后举办类似的实验室基础操作技能培训班提供了参考和经验。
李昊文董成亚许喆贺文艳王雅杰
关键词：继续教育培训班实验室
缺血性卒中领域孟德尔随机化研究的文献计量学与可视化分析
2023年
目的 探讨缺血性卒中领域孟德尔随机化研究的现状及热点,为该领域未来研究方向、药物靶点挖掘方向和探索机制提供参考。方法 在WebofScience核心合集中检索截至2022年9月应用孟德尔随机化研究缺血性卒中的相关英文文献,用CiteSpace进行发表文献的合作网络分析(国家、机构、学者)、文献共被引情况分析、关键词共现和聚类分析。利用PharmSnap全球新药数据库查询经孟德尔随机化确定与缺血性卒中具有因果关系的生物标志物的药物研发情况。结果 检索到文献200篇,相关研究2018年进入快速发展阶段。英国发文量为80篇、中介中心性为0.37、存在合作的国家有27个,美国发文量为63篇、中介中心性为0.10、存在合作的国家有21个,以上数据均位列所有国家的前3位,使英国和美国成为研究中心;中国发文量达到106篇,但仅与16个国家存在合作,相对较少;德国学者Rainer Malik发文20篇、文献共被引次数552次、合作学者25人,均位列第一。关键词聚类图中,IL-6是关键词聚类图中唯一被定义为聚类标签的生物因子,且炎症因素是关键词共现图中近3年研究第二多的缺血性卒中风险因素。应用孟德尔随机化确定的缺血性卒中生物标志物共12个,其中凝血因子Ⅺ和载脂蛋白α是更具潜力的药物靶点且已有相关药物进入临床研究阶段。结论 缺血性卒中领域的孟德尔随机化研究主要在以英国为代表的欧洲国家、美国和中国开展。IL-6等炎症因素是主要研究热点,且相关研究为凝血因子Ⅺ和载脂蛋白α等生物标志物作为药物靶点提供证据。
李兰欣许喆许喆石延枫刘阳赵曼曼刘阳程丝
关键词：缺血性卒中文献计量学可视化分析生物标志物
生化分析仪交叉污染发现和消除方法探索被引量：8
2015年
目的介绍一种发现生化分析仪交叉污染及消除/减少交叉污染的方法。方法使用Hitachi 7600型全自动生化分析仪,对所有生化检测项目(36项)进行交叉污染筛查,之后进行交叉污染的确认实验,并在确认的基础上利用增加水洗、碱洗、酸洗、调整检测顺序等办法消除或减少交叉污染。结果发现具有交叉污染的项目39对,在采取增加水洗、碱洗和酸洗措施后改善了26对,66.7%有交叉污染的项目对被改善,剩下的13对改善效果不明显。之后在检测顺序上调整,调整后交叉污染现象均改善。结论交叉污染所产生的结果干扰,是生化检验中非常重要且易被忽略的问题,单纯依靠经验性观察和重复检查发现问题容易造成疏漏,建议使用开放试剂的生化实验室,在仪器启用或更换试剂时,进行交叉污染筛查和确认,并采取措施,以更好地提高检测结果准确性、为临床服务。
陈燕黄泽玉许喆王雅杰
关键词：交叉污染生化分析仪
脑血管病基因组学数据分析流程建设被引量：2
2022年
目的建立并优化适合于脑血管病基因组学数据分析的生物信息流程,促进脑血管病多组学和精准医学研究的开展。方法调研和梳理临床科研需求,参考脑血管病以及群体遗传领域基因组学、遗传学研究,总结常用分析方法。按照研究目标和分析内容的不同,对生物信息学流程进行模块化设计。依托中国国家卒中登记Ⅲ(China national stroke registry-Ⅲ,CNSR-Ⅲ)研究产生的基因组学数据,在高性能运算集群(浮点运算能力375万亿次/秒)进行分析流程的搭建、测试和优化。结果本研究搭建的生物信息学分析流程,包括数据质控、关联分析、连锁分析、遗传变异注释、跨组学分析等多个模块。通过使用相应模块对上万例CNSR-Ⅲ样本的基因组学数据进行质控和分析,最终确认10241例数据质控合格、无3度以内亲缘关系的全基因组测序样本用于全基因组关联分析。结论结合脑血管病的特点,优化生物信息学分析流程,可以为脑血管病多组学研究提供数据保障,提升研究效率,为脑血管病风险评估、诊断与个体化治疗提供依据。
许喆程丝刘阳石延枫李昊
关键词：脑血管病基因组学遗传学生物信息学分析大数据
面向临床研究的基因测序项目的设计原则、管理流程与质量控制标准
2022年
目的 开发并搭建适用于临床研究的基因测序项目管理和数据质量控制流程,为基于队列的组学分析、疾病机制探索、药物靶标开发等提供技术保障。方法 基于生物医学研究中小样本的测序流程,参考国际大规模测序队列,形成面向临床研究的基因测序项目框架。从样本处理、测序数据生成、生物信息学分析、项目的质量保证、数据安全与生物样本安全等多个环节,进行管理流程的搭建和优化。结果 确定了面向临床研究的基因测序项目的设计原则,搭建了系统性管理流程。通过将此流程应用于中国国家卒中登记Ⅲ(China national stroke registry-Ⅲ,CNSR-Ⅲ)队列,建立了数据质控标准,包括DNA提取和文库制备质控、测序和遗传变异鉴定质控、样本临床信息推断质控和基因检测数据的相互验证等。结论 在临床研究中将基因检测纳入试验设计,并采用标准化的管理流程、数据分析方案和统一的质控标准,能够满足科学研究的可扩展性、可重复性、可溯源性的需求。本研究搭建的基因测序项目管理流程和质控标准已在CNSR-Ⅲ队列上验证成功,可以作为其他临床研究中此类项目的参考标准。
刘阳许喆程丝石延枫林金嬉孟霞姜勇李昊
关键词：基因检测全基因组测序质量管理
CRP基因rs3093068位点多态性与缺血性卒中危险因素及卒中结局的相关性研究
2022年
目的探索CRP基因rs3093068位点多态性与缺血性卒中相关危险因素和卒中结局的相关性。方法本研究基于中国国家卒中登记Ⅲ(China national stroke registry-Ⅲ,CNSR-Ⅲ)队列中的遗传亚组数据库,连续纳入2015年8月-2018年3月首次发生缺血性卒中或TIA的患者,收集人口学信息、病史、hs-CRP、LDL-C和卒中结局等相关临床资料。使用竞争性等位基因特异性PCR(kompetitive allele-specific PCR,KASP)技术检测rs3093068位点的基因型分布,采用ANOVA、Kruskal-Wallis、χ2检验或Fisher确切概率法分析不同基因型携带者已知危险因素的差异,采用logistic回归模型分析不同遗传模型下该位点基因多态性与1年随访卒中复发、联合血管事件以及不良功能结局(mRS≥3分)的相关性,并对卒中亚型进行分层分析。结果共纳入7773例符合入组和排除标准的患者,其中GG基因型5334例(68.62%),GC基因型2196例(28.25%),CC基因型243例(3.13%)。rs3093068位点GG、GC、CC基因型患者的hs-CRP中位水平分别为1.53(0.75~4.07)mg/L、2.04(1.00~5.14)mg/L、2.75(1.30~6.62)mg/L,不同基因型患者血液hs-CRP水平差异有统计学意义(P<0.001)。在校正年龄、性别、入院NIHSS和联合血管事件后,logistic回归分析显示该位点在加性和隐性模型下CC基因型与病因未明型卒中患者的不良功能结局相关(校正OR 2.19,95%CI 1.01~4.41;校正OR 2.29,95%CI 1.06~4.57);未发现该位点与其他危险因素及其他卒中亚型结局的相关性。结论CRP基因rs3093068位点CC基因型与患者的hs-CRP水平升高相关,并且与病因未明型缺血性卒中患者不良功能结局相关。
石延枫程丝许喆刘阳刘阳王拥军
关键词：C反应蛋白位点多态性
基于单细胞转录组的围产期卒中性别差异原因探究
2023年
目的通过对人脑胚胎发育中期的血管组成细胞进行分析,探索围产期卒中性别差异的可能原因。方法对公开发表的性别相关全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)结果和血管单细胞转录组进行联合分析,确定性别差异相关的细胞类型。通过基因差异表达分析和功能富集分析,确定性别对细胞功能的影响,分析围产期卒中性别差异产生的潜在原因。结果经过判定,在胚胎发育中期血管单细胞转录组数据集的7例样本中,有4例男性和3例女性。典型的周细胞(P=0.018)和处于分裂状态的壁细胞(P=0.011)的表达谱与生物学性别的GWAS关联基因显著相关,而平滑肌细胞、成纤维细胞和全部5种内皮细胞类型与性别GWAS关联基因无明显相关性。总计345个基因在男性周细胞中显著高表达、619个基因在女性周细胞中显著高表达,这些差异表达基因分别富集在独特的生物学通路中,也同时富集在细胞能量代谢相关通路中。结论周细胞具有很强的性别差异性,可能是围产期卒中性别差异产生的原因。
刘阳程丝吕天节王誉博王孟许喆许喆李子孝王拥军
关键词：性别差异周细胞细胞能量代谢
可调微量移液器良好操作规范探讨被引量：10
2014年
目的 探讨可调微量移液器的操作对实验结果的影响.方法 使用血清、水、异戊醇和无水乙醇四种液体,从移液器量程的选择、改变吸头的填充方式、调节量程方式、吸头是否提前浸润、浸入时间、角度、深度和移液速度等几方面,分析影响移液准确性的因素,探讨可调微量移液器的操作方法.结果 可调微量移液器使用过程中,选择量程合适的移液器;移液器垂直对准吸头插入并左右小幅旋转填充吸头;调节量程需顺时针旋转刻度旋钮至超过量程的刻度,再回调至设定体积;提前浸润2～3次;浸入时间保持3s;吸头垂直（角度90度）浸入液面;浸入深度不宜过浅;慢速移液;以上操作能够显著提高移液准确性.结论 遵循良好的移液器操作规范对于得到准确的移液体积具有重要意义.
刘丽董成亚李昊文许喆王雅杰
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