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高通量测序技术在肠道微生物宏基因组学研究中的应用被引量：45: 2016年; 人是一种由自身细胞和肠道菌群组成的"超级生物体"。人体肠道菌群编码的基因组可被视为"人的第2基因组",它们参与人体的营养、代谢和免疫过程,是影响人体健康最重要的因素之一。由此对肠道微生物宏基因组学的研究成为当今的热点。高通量测序技术具有诸多优越性,使研究者不仅能够深入分析肠道菌群结构和多样性,还能结合其它"组学"技术进一步了解肠道微生物的基因功能和代谢途径。本文综述了高通量测序技术在肠道微生物宏基因组学中应用的现状和发展趋势,提出以肠道微生物为靶点,利用肠道微生物宏基因组学结合其它"组学"的方法,通过饮食结构的调整和生物制剂的摄入干预和治疗相关疾病的理念,这将成为生命科学和食品科学研究领域的一个重要探索方向。; 叶雷闫亚丽陈庆森赵林森龄南庞广昌; 关键词：肠道微生物宏基因组学高通量测序技术

酪蛋白糖巨肽对小鼠腹腔吞噬细胞及肠黏膜免疫细胞的影响被引量：3: 2014年; 目的:由于酪蛋白糖巨肽(casein glycomacropeptide,CGMP)具有许多生理活性功能和独特营养特性,研究CGMP对小鼠腹腔免疫细胞以及肠黏膜屏障的影响可为其应用于保健食品和医药品提供科学依据。方法:以96只健康昆明雌性小鼠为实验动物,利用流式细胞仪、HE染色和免疫荧光标记技术,分别检测分析了灌胃不同剂量的CGM P(30μg/d和120μg/d)对实验小鼠腹腔吞噬细胞吞噬活性以及肠上皮内淋巴细胞(intraepithellal lymphocytes,IEL)和固有层IgA+浆细胞数量的影响,探讨CGMP改善小鼠腹腔吞噬细胞和肠黏膜屏障功能的作用。结果:CGMP能够显著增加小鼠腹腔吞噬细胞的吞噬能力,灌胃时间越长,作用效果越明显;其中灌胃CGMP的剂量为120μg/d的作用效果优于30μg/d剂量组。且与对照组相比,灌胃CGMP组小鼠十二指肠上皮内淋巴细胞数和固有层IgA+浆细胞数量显著增加(P<0.01)。结论:CGMP可以增强小鼠腹腔吞噬细胞吞噬功能,诱导肠道黏膜免疫应答,增强肠黏膜免疫屏障功能,有望开发为抑制肠道炎症的功能性食品添加剂。; 叶雷陈庆森李伟阎亚丽赵培庞广昌胡志和; 关键词：酪蛋白糖巨肽肠黏膜屏障吞噬细胞肠上皮内淋巴细胞

瑞士乳杆菌TS206对小鼠血脂及粪便胆汁酸水平的调控影响被引量：2: 2017年; 探讨瑞士乳杆菌TS206(Lactobacillus helveticus TS206)对小鼠血脂水平的影响。以健康BABL/c小鼠为对象,设置实验组和对照组,分别以L.helveticus TS206菌悬液和生理盐水(0.2 m L/d)连续灌胃7周,监测小鼠体质量和血脂(总胆固醇(total serum cholesterol,TC)、甘油三酯(triglycerides,TG)水平、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C))以及粪便总胆汁酸(total bile acid,TBA)水平的变化。灌胃L.helveticus TS206后,小鼠体质量增量显著高于对照组(P<0.05,P<0.01);血清中TC、TG和LDL-C水平均显著降低(P<0.05),灌胃停止1周后基本恢复到对照组水平;L.helveticus TS206菌悬液和生理盐水小鼠血清中HDL-C含量均无显著性变化;TBA水平呈先下降后上升趋势,且3周后TBA水平显著低于对照组(P<0.05)。研究结果表明,L.helveticus TS206能促进健康小鼠体质量增加,并有效调控其血脂水平,提示口服L.helveticus TS206菌剂可能会降低患心脑血管疾病的风险。; 王泳叶雷贾彦庞广昌赵培闫亚丽陈庆森; 关键词：血脂总胆汁酸心脑血管疾病

流式细胞术快速检测直投式发酵剂菌体活力被引量：11: 2014年; 利用荧光染料标记直投式发酵剂菌体细胞并结合流式细胞术快速检测和分析菌体细胞的活力以及生存状态,对科学地评价各种微生物发酵剂的品质具有现实意义。研究选用保加利亚乳杆菌(Lactobacillus bulgaricus)和嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus)两种直投式发酵剂以及制备的新鲜菌体细胞和热处理菌体细胞作为分析检测对象,利用流式细胞术结合羧基荧光素双乙酸酯(5-(6)-carboxyfluoresceindiacetate,5(6)-cFDA)和碘化丙啶(两种荧光染料检测了这些菌体的细胞活力。研究结果表明,5(6)-cFDA和PI双染色方法适合检测L.bulgaricus直投式发酵剂中菌体的存活力,该发酵剂中菌体存活率仅为4.7%,活力较低;而利用5(6)-cFDA单染色方法检测S.thermophilus直投式发酵剂中菌体存活力的效果较好,其菌体存活力接近于90%,活力较强;同时,发酵活力验证也得到了相同的结果;另外,研究证实了PI不能很好地区分S.thermophilus的死活细胞。因此,流式细胞术可作为直投式发酵剂生产行业快速检测评价产品质量的可靠方法。; 叶雷陈庆森阎亚丽赵林森葛春美赵培刘芳董宇坤; 关键词：荧光染料流式细胞术直投式发酵剂存活力

乳源酪蛋白糖巨肽对小鼠外周血T淋巴细胞亚群的影响被引量：3: 2014年; 目的:酪蛋白糖巨肽(caseino-glycomacropeptide,CGMP)是κ-酪蛋白经凝乳酶和胃蛋白酶酶解后形成的含有64个氨基酸的不同种类肽段,具有多种生物学活性和独特的营养特性,探讨CGMP对小鼠外周血T淋巴细胞亚群的影响。方法:以健康小鼠为实验动物,利用流式细胞仪分别检测长期和短期灌胃不同剂量的CGMP(30、60、120μg/d)后,小鼠外周血淋巴细胞亚群的变化。结果:乳源CGMP干预后的结果表明,在短期灌胃实验中,灌胃不同剂量后CD3+淋巴细胞数比例均显著降低,12h后恢复灌胃前水平;CD3+CD4+和CD3+CD8+淋巴细胞比例在灌胃30μg和120μg CGMP 4h后均显著降低,而60μg组则无明显变化;长期灌胃实验中,在第2天和第4天,外周血中CD3+淋巴细胞和CD3+CD4+比例与对照组相比显著升高(P<0.05);120μg/d剂量组的小鼠外周血中CD3+CD8+淋巴细胞比例与对照组相比显著升高(P<0.05),而30μg/d剂量组在2、4、6、8 d与对照组相比无显著变化(P>0.05);在第2天,30μg/d和120μg/d剂量组外周血中CD3+CD4+/CD3+CD8+比例与对照组相比显著升高(P<0.05)。结论:乳源CGMP能够引起正常小鼠的外周血淋巴细胞亚群发生变化,调节机体T淋巴细胞亚群的平衡,由此提示CGMP可作为功能性食品对外周血T淋巴细胞亚群的失衡有缓解作用。; 叶雷陈庆森李伟阎亚丽赵培庞广昌胡志和; 关键词：酪蛋白糖巨肽淋巴细胞亚群 CD4+细胞功能性食品

瑞士乳杆菌调控小鼠肠道菌群变化规律的研究被引量：10: 2018年; 为探究瑞士乳杆菌(Lactobacillus helveticus)TS206对小鼠肠道菌群的调控规律,更好地阐述益生菌维持肠道菌群稳态的机制,本研究以雄性BALB/c小鼠为实验对象,将其分为L.helveticus TS206组、对照组、空白组。L.helveticus TS206组和对照组分别每天灌胃L.helveticus TS206菌悬液和等量的生理盐水,连续灌胃7周,空白组不灌胃。每周采集小鼠新鲜粪便样品,通过试剂盒提取粪便细菌总DNA,利用Ion torrent个人化操作基因组测序平台测序技术对16S r RNA基因的V6区进行高通量测序,最后通过生物信息学和多变量统计学方法对测序数据进行分析。结果显示:所有测序序列在97%相似水平划分得到1 617个操作分类单位(operational taxonomic units,OTUs),被划分为8个门,硬壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为各组小鼠中的优势菌门,占总序列数的97.49%,且硬壁菌门丰度最高,超过70%;优势菌科主要为S24-7、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)和拟杆菌科(Bacteroidaceae),且与对照组相比L.helveticus TS206组肠杆菌科细菌数量较低并呈下降趋势。经LEf Se分析有53个关键OTUs与2组小鼠肠道粪便菌群结构显著相关,其中27个OTUs在对照组中富集,分属于肠杆菌科、瘤胃球菌科、毛螺菌科和梭菌目;26个OTUs在L.helveticus TS206组中富集,分属于梭菌目、毛螺菌科和拟杆菌属,其中与对照组相比,梭菌目丰度水平高。经主成分分析,两组样品完全分离,菌群的整体结构存在差异,且富集的OTUs之间呈负相关关系。综上所述,在实验阶段,灌胃雄性BALB/c小鼠一定剂量的L.helveticus TS206后,经扩增子测序分析获得的初步结论为L.helveticus TS206能改变肠道菌群整体结构的功效,表现出了抑制肠道有害微生物生长的作用,并通过促进部分有益菌的增殖来维持肠道菌群结构的稳态。; 臧凯丽贾彦崔文静马新颖王泳赵林森赵培叶雷阎亚丽陈庆森; 关键词：生物信息学

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叶雷

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