熊洋洋
- 作品数:2 被引量:7H指数:1
- 供职机构:南京农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国博士后科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 茶树中两个HSF转录因子基因分离与温度胁迫响应的比较分析被引量:1
- 2015年
- 以茶树品种‘迎霜’为实验材料,从中分离获得2个编码HSF转录因子的基因。进化分析显示,这2个转录因子分别属于HSF转录因子家族的A5和A4亚族,分别命名为CsHsfA5和CsHsfA4。序列分析显示,CsHsfA5和CsHsfA4的开放阅读框分别为1 440和1 224 bp,分别编码479和407个氨基酸,均含有HSF转录因子保守结合域。CsHsfA5和CsHsfA4均属于亲水性蛋白,具有3个α-螺旋和4个β-折叠的三级结构。实时定量PCR表明,CsHsfA5和CsHsfA4基因在不同温度胁迫下均能在3个不同茶树品种‘迎霜’、‘安吉白茶’和‘云南十里香’中诱导表达,且表达量呈现差异。
- 熊洋洋顾雅琦刘志薇李彤吴致君庄静
- 关键词:茶树温度胁迫
- 茶树转录因子基因CsDREB-A4的克隆与温度胁迫响应的分析被引量:6
- 2015年
- 基于本实验室茶树品种迎霜的转录组数据,通过PCR方法从迎霜的DNA中克隆得到Cs DREB-A4基因。分析显示,该基因含开放阅读框长708 bp,编码235个氨基酸,含有AP2/ERF家族转录因子典型的保守AP2结合域,并且与大豆、番茄、葡萄、拟南芥等的DREB转录因子有高度同源性。从进化树、亲/疏水性、无序化特性、二级和三级结构等方面进行预测与分析,结果表明,该转录因子属于AP2/ERF家族中的DREB亚族的A4组,大多数氨基酸属亲水性氨基酸,无序化特征比较明显,三级结构与At ERF1相似。利用实时荧光定量PCR分析表明,在迎霜、安吉白茶、云南十里香3个茶树品种中Cs DREB-A4基因均受高温、低温诱导表达。在4℃处理下,在上述3个茶树品种中Cs DREB-A4基因表达量均在24 h时达到最大值,分别为对照的23、4、43倍,并且Cs DREB-A4基因在迎霜和云南十里香中均比安吉白茶的基因表达上调时间更长,上调程度更大。在38℃处理下,Cs DREB-A4基因在迎霜和云南十里香中表达受抑制,均只在8 h时表达量高于对照,而在安吉白茶中表达量显著增加,在12 h时高达对照的2 720倍。
- 刘志薇熊洋洋李彤严雅君韩洪润吴致君庄静
- 关键词:茶树进化分析温度胁迫