吴小翠
- 作品数：10 被引量：35H指数：4
- 供职机构：上海市肺科医院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 上海市某结核病定点医院非结核分枝杆菌肺病的诊断时间及影响因素分析被引量：1
- 2023年
- 目的分析上海市某结核病定点医院2020—2021年非结核分枝杆菌(NTM)肺病患者的病原学特征、诊断所需时间及其影响因素,为进一步提高NTM肺病诊断效率,精准制定治疗方案提供依据。方法依托上海市肺科医院结核病专病数据库,获取2020年1月至2021年12月在本院结核科诊断的NTM病患者及其人口学、临床特征和细菌学数据开展回顾性研究。采用卡方检验、配对样本非参数检验以及logistic回归模型等方法,分析影响NTM肺病细菌学诊断时间的相关因素。结果研究共纳入294例细菌学诊断的NTM肺病患者,男147例,女147例,年龄中位数为61(46,69)岁。其中227例(77.2%)患者合并有支气管扩张。细菌学检测结果显示,鸟-胞内分枝杆菌复合群是NTM肺病的主要致病菌(56.1%),其次为堪萨斯(19.0%)和脓肿分枝杆菌(15.3%),而蟾蜍、玛尔摩等分枝杆菌合计占比仅3.1%。对标本类型分析发现,痰液、肺泡灌洗液和穿刺液标本培养阳性率分别为87.4%、80.3%、61.5%。按同一患者配对分析发现,痰液培养的阳性率明显高于涂片检查(87.1%比48.4%,P<0.01);而痰液和肺泡灌洗液标本NTM培养阳性率的差异无统计学意义(78.7%比77.3%,P>0.05)。有咳嗽或咳痰症状患者,痰液培养阳性的可能性分别提高了4.04(95%CI 1.80~9.05)和2.95(95%CI 1.34~6.52)倍;而女性或合并支气管扩张的患者,肺泡灌洗液培养阳性的可能性分别提高了2.82(95%CI 1.16~6.88)和2.38(95%CI 1.01~5.63)倍。NTM肺病诊断时间的中位数为32(26,42)d。多因素分析结果显示,有咳痰症状(aOR=0.48,95%CI:0.29~0.80)的患者,相较于无咳痰症状患者诊断所需时间更短。以鸟-胞内分枝杆菌肺病作为参照,脓肿分枝杆菌肺病诊断所需时间较短(aOR=0.43,95%CI 0.21~0.88),而少见NTM菌种诊断时间则相对较长(aOR=8.31,95%CI 1.01~68.6)。结论上海市某结核病定点医院诊断NTM肺病的主要致病菌为鸟-胞内分枝杆菌复合群,性别、�
- 郑旭彬何亦凡王丽孙勤申晓娜吴小翠杨景卉姚岚崔海燕徐飚余方友沙巍
- 关键词：分枝杆菌感染肺疾病
- 结核分枝杆菌Rv1787基因编码蛋白PPE25的原核表达及生物信息学分析被引量：7
- 2019年
- 目的构建结核分枝杆菌Rv1787基因的原核表达质粒进行体外表达,运用生物学信息分析方法分析Rv1787基因编码蛋白PPE25的生物学特征。 方法以结核分枝杆菌H37Rv基因组DNA为模板,PCR法扩增Rv1787基因,并与表达载体pET-32a构建重组质粒。原核表达重组质粒,SDS-PAGE分析表达产物并利用亲和层析的方法进行纯化。利用生物信息学软件ProtParam分析PPE25蛋白的理化性质,TMPRED和SignalP4.1Service预测蛋白的跨膜区和信号肽,NPS@SOPMA和Swissmodel分别预测蛋白的二级结构和三级结构,Bepipred 1.0bserver和DNAStar综合预测蛋白的B细胞抗原表位,综合运用SYFPEITHI、BIMAS、NetCTL、RANKPEP、NetMHCⅡPAN 4.0server预测蛋白的CTL细胞表位,综合运用SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHCⅡpan 3.2server预测蛋白的Th细胞表位。 结果pET-32a-Rv1787重组质粒测序结果与目的基因完全一致;SDS-PAGE分析表明,该融合蛋白以包涵体形式存在,相对分子质量为56×10^3,与预期大小相符。生物信息学分析结果显示,PPE25蛋白为疏水性蛋白,含多个跨膜结构域,无信号肽。二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,结构比较松散。综合多种表位预测软件分析结果,筛选出3个优势B细胞抗原表位,7个CTL优势抗原表位和9个Th优势抗原表位。 结论成功构建结核分枝杆菌PPE25蛋白编码基因Rv1787重组原核表达质粒,并利用生物信息学筛选出多个优势抗原表位,为进一步研究PPE25蛋白在结核病发生发展中的作用奠定了基础。
- 刘田万李周勇段佳熙管茶香吴小翠万康林
- 关键词：结核分枝杆菌原核表达生物信息学
- PCR-反向点杂交法检测复治涂阳患者结核分枝杆菌耐药性的价值被引量：2
- 2021年
- 目的评估PCR-反向点杂交法检测复治涂阳患者痰标本中MTB耐药性的价值。方法收集2015年6月至2019年1月上海市肺科医院诊治的400例复治涂阳肺结核患者的痰标本,每份标本量均不少于2ml;每例患者采用同一标本进行PCR-反向点杂交法MTB耐药基因检测、GeneXpert MTB/RIF检测和BACTEC MGIT960液体培养、菌种鉴定、微孔板法药物敏感性试验(简称"药敏试验"),最终纳入357例(株)为研究对象。以微孔板法药敏试验结果为参考标准,评价PCR-反向点杂交法的检测效能。结果以微孔板法药敏试验结果为参考标准,PCR-反向点杂交法检测MTB对利福平耐药性的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率和Kappa值分别为97.5%(115/118)、97.1%(232/239)、94.3%(115/122)、98.7%(232/235)、97.2%(347/357)和0.937,对异烟肼耐药性的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率和Kappa值分别为82.5%(113/137)、99.1%(218/220)、98.3%(113/115)、90.1%(218/242)、92.7%(331/357)和0.841,对链霉素耐药性的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率和Kappa值分别为86.5%(115/133)、99.1%(222/224)、98.3%(115/117)、92.5%(222/240)、94.4%(337/357)和0.877,对乙胺丁醇耐药性的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率和Kappa值分别为60.7%(37/61)、98.6%(292/296)、90.2%(37/41)、92.4%(292/316)、92.2%(329/357)和0.682。结论 PCR-反向点杂交法检测复治涂阳患者痰标本中MTB耐药性有较好的效能。
- 刘轾彬吴敏吴小翠韩敏肖和平张青
- 关键词：微生物敏感性试验双杂交系统技术
- 上海新华医院崇明分院2015年临床常见细菌耐药性监测被引量：7
- 2017年
- 目的分析全国细菌耐药监测网CARSS崇明区唯一一所入网医院上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院2015年临床常见细菌对抗菌药物的敏感性和耐药性,为合理使用抗菌药物及临床抗感染治疗提供参考。方法采用MicroScan Walkway96型全自动细菌鉴定仪、纸片扩散法对临床常见分离菌进行鉴定及药敏试验。结果 2015年收集临床分离菌共1 815株,革兰阴性菌、革兰阳性菌所占比例分别为73.2%、26.8%;前3位分离菌分别为大肠埃希菌﹑肺炎克雷伯菌﹑铜绿假单胞菌。大肠埃希菌、克雷伯菌属(肺炎克雷伯菌和产酸克雷伯菌)和奇异变形杆菌中超广谱β内酰胺酶(ESBL)的检出率分别为36.3%、12.6%、28.0%;耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌(CRE)的检出率为0.69%;耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS)检出率分别是各自菌种的29.1%和61.4%。肠杆菌科细菌对碳青霉烯类药物耐药率<15%,铜绿假单胞菌和不动杆菌属菌株对碳青霉烯类药物耐药率<20%;未发现对万古霉素和利奈唑胺耐药的肠球菌和葡萄球菌属。结论细菌耐药性对临床抗感染治疗构成严重威胁,应引起高度重视,需合理规范使用抗菌药物。
- 钱敏健宛宝山张莉吴小翠陈晋
- 关键词：细菌鉴定细菌耐药性监测耐万古霉素肠球菌
- 间隔区寡核苷酸分型技术用于结核分枝杆菌多重感染的初步研究被引量：2
- 2015年
- 目的初步评价间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术在鉴定结核分枝杆菌多重感染中的应用。方法选取结核分枝杆菌临床分离株,5μm孔径滤膜过滤法制备单个细菌菌悬液,平板接种37℃培养,选取生长良好的单个菌落培养增菌,提取基因组DNA,Spoligotyping进行基因分型鉴定,比较临床分离株与相应的单克隆分离株的分型结果。结果共选取32株结核分枝杆菌临床分离株,获得306个单克隆分离株。Spoligotyping分型鉴定结果显示30株结核分枝杆菌临床分离株与相应的单克隆分离株的分型结果一致,2株临床分离株的单克隆分离株呈现了多种基因型,多重感染率为6.25%。结论 Spoligotyping可用于快速,有效地区分结核分枝杆菌多重感染。
- 吴小翠王晓樱魏剑浩刘海灿赵秀芹夏远志楼永良吕建新万康林
- 关键词：结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型
- 四种结核抗原用于结核病血清学诊断的初步评价被引量：9
- 2014年
- 目的对MPT63、Ag85A、RV2031c和融合蛋白CFP10-ESAT6四种结核分枝杆菌抗原进行诊断效能评价,优选出最佳的抗原组合,分析其应用价值。方法基于酶联免疫吸附试验,分别用MPT63、Ag85A、RV2031c和融合蛋白CFP10-ESAT6四种重组结核抗原,对199份血清（含94份结核病患者血清和105份健康者血清）进行检测。结合受试者工作特征曲线法计算不同抗原的最佳临界值（cut-off value）并以此确立各抗原组合的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值和诊断效率,对它们的诊断效能和应用价值进行综合评价。结果 11种组合中Rv2031c与CFP10-ESAT6的组合诊断效能最好,灵敏度为63.8%,特异度为82.9%,阳性预测值为76.9%,阴性预测值为71.9%,诊断效率为73.9%。其余组合的灵敏度的范围30.9%～66%,特异度范围76.2%～90.5%。结论 Rv2031c和CFP10-ESAT6组合后的诊断效能最佳,有一定的临床应用价值。
- 林楠吴小翠赵平余琴庞慧万康林
- 关键词：酶联免疫吸附试验受试者工作特征曲线
- 分子药物敏感性试验对复治涂阳肺结核患者化疗的指导及效果分析被引量：3
- 2021年
- 目的评价分子药物敏感性试验(简称"药敏试验")对复治涂阳肺结核患者化疗的指导及效果。方法采用前瞻性随机对照的方法,选取2016年3月至2020年1月上海市肺科医院诊治的400例复治涂阳肺结核患者作为研究对象,收集患者的痰液或支气管肺泡灌洗液行分枝杆菌培养,培养阳性且鉴定为MTB的分离株采用微孔板法进行表型药敏试验;按就诊时间顺序依随机数字表法对其中200例患者的同一份标本采用PCR-反向点杂交法进行分子药敏试验,检测异烟肼和利福平耐药相关基因。微孔板法结果回报前,PCR-反向点杂交法检测为异烟肼和(或)利福平耐药的患者予异烟肼和(或)利福平耐药化疗方案,其余患者予异烟肼、利福平敏感复治化疗方案;微孔板法结果回报后,以微孔板法结果为标准调整化疗方案。比较微孔板法确诊的利福平耐药患者中行PCR-反向点杂交法者与未行PCR-反向点杂交法者在微孔板法结果回报时的痰涂片抗酸杆菌阴转率和痰涂片阳性标本荷菌量,以及在应用耐药方案治疗3、6、9、12个月末的痰菌阴转率。结果在微孔板法确诊的利福平耐药患者中,行PCR-反向点杂交法与未行PCR-反向点杂交法的患者在微孔板法结果回报时的痰涂片抗酸杆菌阴转率分别为18.9%(10/53)和5.9%(3/51),差异有统计学意义(χ^(2)=4.007,P=0.045);行PCR-反向点杂交法患者痰涂片阳性标本抗酸杆菌分级计数"+、++、+++、++++"分别占48.8%(21/43)、25.6%(11/43)、16.3%(7/43)、9.3%(4/43),未行PCR-反向点杂交法患者分级计数分别占16.7%(8/48)、35.4%(17/48)、33.3%(16/48)、14.6%(7/48),差异有统计学意义(χ^(2)=11.212,P=0.011),前者痰标本荷菌量更少。行PCR-反向点杂交法的患者治疗3、6、9、12个月末的痰菌阴转率分别为64.0%(32/50)、84.8%(39/46)、82.9%(34/41)、84.2%(32/38),高于未行PCR-反向点杂交法的患者治疗3、6、9、12个月末的痰菌阴转率[分别�
- 刘轾彬吴敏吴小翠韩敏张青沙巍
- 关键词：结核微生物敏感性试验药物疗法疗效比较研究
- 结核分枝杆菌九种蛋白抗原克隆表达纯化及多重感染研究
- 结核病(Tuberculosis，TB)仍然是仅次于艾滋病(acquired immune deficiencysyndrome，AIDS)，在全球范围内由单一传染病病原体引起的危害人类健康的最大杀手。我国是22个结核病...
- 吴小翠
- 关键词：结核分枝杆菌病菌分离基因克隆蛋白纯化
- 结核病药效评价用结核分枝杆菌参考菌株的筛选被引量：4
- 2015年
- 目的筛选结核病(tuberculosis,TB)药效评价用结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)国家参考菌株。方法取169株MTB临床分离株,采用结核杆菌生长指示管(mycobacterial growth indicator tube,MGIT)960液体培养基,对4种一线抗TB药物[链霉素(streptomycin,STR)、异烟肼(isoniazid,INH)、利福平(rifampin,RFP)和乙胺丁醇(ethambutol,EMB)]进行药敏试验,并对耐INH和/或耐RFP的菌株的相关耐药基因位点进行测序,确认突变位点;用间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)对所有菌株进行基因分型,多位点可变数量串联重复序列分型方法(mutiple loci VNTR analysis,MLVA)对北京家族MTB临床分离株进行基因分型。结果 169株MTB临床分离株中耐STR 118株,INH 143株,RFP 129株,EMB 95株,耐多药(至少对NIH和RFP耐药)120株,单耐INH 5株,单耐RFP7株,四种抗TB药均敏感共11株。143株INH耐药菌株中,kat G基因突变菌株占76.9%,inh A基因突变菌株占27.3%,aph C基因突变菌株占25.2%,至少2个基因发生突变的菌株有31株;129株RFP耐药菌株中,rpo B基因531位点发生突变,占67.4%,526位发生突变,占17.8%,516位点发生突变,占16.3%,至少2个位点发生突变的菌株有10株。169株MTB临床分离株分为北京家族和非北京家族,北京家族111株;非北京家族58株,主要有CAS家族2株,EAI家族7株,H家族11株,LAM家族6株,MANU家族6株,T家族7株,U家族1株,X3家族3株,还有15株在数据库中未表现的新基因型。111株北京家族MTB临床分离株分为4大群,其中Ⅱ群分布最广,占68.5%,代表性最好。筛选出耐多药菌株27株,敏感菌株5株,单耐异烟肼2株,单耐利福平3株。结论成功筛选出敏感菌株、单耐药菌株、MDR菌株作为候选菌株。
- 邓海清陈保文杨蕾张婷卢锦标吴小翠万康林黄长江王国治
- 关键词：结核分枝杆菌药敏实验基因测序基因分型菌株筛选
- 莫西沙星和氧氟沙星耐药结核分枝杆菌的分子特征研究
- 2024年
- 目的利用全基因组测序技术分析上海地区莫西沙星和氧氟沙星同时耐药的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)分子特征,为Mtb感染患者的临床诊疗提供科学依据。方法收集同济大学附属上海市肺科医院保存的142株莫西沙星和氧氟沙星同时耐药的Mtb临床分离株。使用Sensititre®MYCOTB plate进行微孔板法药敏试验;Illumina平台对142株Mtb进行测序;TB-Profiler确定其谱系和耐药相关基因的突变位点;Snippy进行细菌核心基因组系统发育分析。结果表型药敏结果显示142株莫西沙星和氧氟沙星耐药的Mtb分离株对异烟肼和利福平的耐药率分别为33.80%(48/142)和22.54%(32/142);76.06%(108/142)的分离株检测到14种氟喹诺酮耐药基因相关突变,其中以gyrA基因Asp94Gly(21.83%,31/142)、Ala90Val(15.49%,22/142)和Asp94Tyr(9.15%,13/142)突变为主。异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、阿米卡星、乙硫异烟胺和卡那霉素的常见耐药突变类型分别为katG Ser513Thr(68.75%,33/48)、rpoB Ser450Leu(53.13%,17/32)、embB Met306Val(44.44%,8/18)、rpsL Lys43Arg(77.50%,31/40)、rrs 1401A→G(100.00%)、fabG1-15C→T(50.00%,4/8)、rrs 1401A→G(100.00%)。142株Mtb分为2个谱系,分别为L2谱系(92.25%,131/142)和L4谱系(7.75%,11/142);其中L2谱系以L2.2.1亚型(80.28%,114/142)为主,L4谱系以L4.5亚型(5.63%,8/142)为主。系统发育分析和单核苷酸多态性分析显示多株L2谱系菌株可能存在流行病学联系。结论本地区莫西沙星和氧氟沙星耐药的Mtb主要流行基因型为L2型,应加强耐药结核病的防控工作。
- 肖阳华吴小翠杨景卉郭银娟余方友
- 关键词：结核分枝杆菌莫西沙星氧氟沙星全基因组测序耐药基因
