王亚坤
- 作品数：37 被引量：29H指数：3
- 供职机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目广州市科技计划项目中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生生物学文化科学更多>>
- 线粒体COⅠ基因在观赏鱼中物种鉴定与分类应用被引量：5
- 2017年
- 观赏鱼种类繁多,形态各异,市场上多是以商品名命名,在物种鉴定分类上存在一定的难度。本研究基于线粒体COⅠ基因,探讨其在观赏鱼中物种鉴定与分类应用的可行性。通过PCR扩增,获取18种观赏鱼249个个体的COⅠ基因序列。基于Kimura双参数模型,利用MEGA软件计算18种观赏鱼种间和种内遗传距离,并构建系统进化树。结果显示,观赏鱼类的种间遗传距离明显大于种内遗传距离,线粒体COⅠ基因序列可以用于物种鉴定。在系统进化树中,系统进化关系跟传统分类方法所得数据一致性高。研究表明,观赏鱼线粒体COⅠ基因序列,在物种鉴定与进化分类上具有一定的应用价值。
- 公月月李伟赵建陈海港王亚坤朱新平
- 关键词：观赏鱼
- 中华鳖(Trionyx sinensis)微卫星标记与生长性状的相关分析被引量：8
- 2016年
- 利用筛选到的25个微卫星标记,以中华鳖极大、极小两个群体共120个个体为实验材料,分析这些微卫星标记与体重、背甲长、背甲宽、体高、腹甲长及腹甲宽之间的相关性。结果表明:有3个位点与生长性状的相关性达到显著或极显著水平(p<0.05或p<0.01),其中位点LTF1与体重、背甲长、背甲宽、腹甲长、腹甲宽、体高均极显著相关;位点LTR87与体重、背甲长、和腹甲宽显著相关;位点LT8与体重、体高、腹甲长、腹甲宽显著相关。将同一性状不同基因型之间进行多重比较,结果显示位点LTF1中的BE型,位点LTR87中的BB型,以及位点LT8中的CF型、BC型、AC型、CC型具有明显的生长优势,可作为辅助育种的参考标记。
- 李婷李伟赵建史燕洪孝友王亚坤朱新平
- 关键词：中华鳖微卫星生长性状
- 一种低温保存稚龟的方法
- 本发明公开了一种低温保存稚龟的方法，涉及龟类养殖技术领域。所述方法包括将孵化后的稚龟置于含有孵化基质的容器中，降温至8～12℃进行低温保存的步骤。本发明提供的低温保存稚龟的方法，能够保证多种类的稚龟安全过冬，特别是没有保...
- 刘晓莉朱新平王亚坤洪孝友李伟于凌云陈辰项旭东朱小玲
- 基于微卫星标记的鼋亲子鉴定技术被引量：3
- 2022年
- 为研究鼋(Pelochelys cantorii)保种群体的遗传信息,利用鼋转录组文库,筛选出了10对微卫星引物,以此建立了基于2组各含5个微卫星位点多重PCR体系的鼋亲子鉴定技术,并应用2组微卫星多重PCR体系,通过ABI3130遗传分析仪及PopGene3.2和CERVUS软件对56只子一代鼋进行个体基因型检测和群体遗传多样性分析,结果显示,鼋子一代群体的平均等位基因数为2.3,微卫星位点的平均多态信息含量为0.3829,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.6305和0.4767,处中高度水平。对子代进行亲子分析,10个微卫星位点的累积排除概率分别为73.14%(NE-1P)、90.98%(NE-2P)和98%(NE-3P),能够满足亲子鉴定的需要。且4只亲本在生殖选择中表现出差异。鼋多重PCR亲子鉴定技术的建立为群体遗传多样性分析、家系鉴定管理和选择育种提供了有效的技术手段。
- 谢敏敏王亚坤魏成清陈辰刘晓莉李伟洪孝友朱新平
- 关键词：微卫星繁殖力
- 基于转录组测序的中华鳖SSR和SNP特征分析及性别标记筛选被引量：1
- 2023年
- 【目的】挖掘更多中华鳖(Pelodiscus sinensis)性别分子标记,为中华鳖保护、繁育以及遗传多样性的分子机制等研究提供基础。【方法】基于中华鳖转录组测序数据,利用MISA和GATK挖掘中华鳖转录本中SSR和SNP位点信息,开发与中华鳖性别紧密相关的SNP标记。【结果和结论】共组装获得341632条Unigenes,识别到14804个SSR位点,含有SSR位点的Unigenes序列数量为13904条,占总序列的4.1%。中华鳖转录组中SSR位点类型较为丰富,共识别到6种不同核苷酸重复类型,单核苷酸串联重复基元类型的含量最多(10981个),占总位点数的74.18%。SSR位点以重复11~15次为主(6173个),占总位点数的41.70%。转录组SSR的片段长度大部分集中在10~14 bp,占SSR总数的50.01%。搜索到32299个SNP位点,SNP的分布密度为1/1339 bp。SNP变异类型以转换类型为主,转换类型占70.05%,颠换类型占29.95%。SNP测序深度统计发现,在31~100范围内,SNP数目最多,占43.68%。初步筛选并鉴定出位于Ptpn11基因上与性别紧密关联的SNP位点(29144910),为中华鳖性别分子标记提供候选基因和标记。
- 雷骆祝骏贤陈辰王亚坤刘晓莉洪孝友于凌云魏成清李伟朱新平
- 关键词：中华鳖转录组SSRSNP
- 斑鳢基因组中微卫星分布特征及野生种群遗传结构分析被引量：6
- 2020年
- 斑鳢(Channa maculata)是华南地区的本土经济鱼类,也是杂交鳢的亲本之一。养殖个体逃逸可能会对野生种群产生影响,存在种质混杂的风险,亟须开展野生资源的遗传背景分析。该研究分析了斑鳢基因组中微卫星标记的分布特征,筛选获得20个多态性位点构建多重PCR体系,对广州、化州、江华、南宁、阳江和邵武6个野生群体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果显示,6个野生群体各位点的等位基因(Na)为3~28、有效等位基因(Ne)为1.28~14.88、观测杂合度(Ho)为0.10~1.00、期望杂合度(He)为0.14~0.95以及多态信息含量(PIC)为0.13~0.95。UPGAM系统进化树结果显示,化州和福建种群遗传关系最近,化州和江华种群遗传关系最远。该研究结果将为斑鳢的遗传监测和亲缘关系鉴定提供技术支持,为斑鳢种质资源养护及管理提供参考。
- 上官清陈昆慈刘海洋欧密罗青王亚坤徐晟云赵建
- 关键词：斑鳢微卫星标记野生种群
- 鉴别珍珠鳖性别的分子标记、引物对及其应用
- 本发明属于分子生物学方法鉴定动物性别的技术领域，具体涉及一种鉴别珍珠鳖性别的分子标记、引物对及其应用。基因组DNA包含如SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示序列的珍珠鳖，鉴别为雌性；基因组DNA包含如SEQ...
- 李伟祝骏贤朱新平雷骆陈辰王亚坤陈海港洪孝友刘晓莉于凌云刘毅辉魏成清
- 一种黄喉拟水龟卵巢细胞的分离培养方法
- 本发明公开了一种黄喉拟水龟卵巢细胞的分离培养方法，涉及水产动物细胞培养技术领域。该方法包括以下步骤：黄喉拟水龟卵巢组织依次经胶原蛋白酶Ⅰ型和胰蛋白酶消化后，终止消化反应，之后分离得到消化后细胞；所述消化后细胞在完全培养基...
- 刘晓莉朱新平徐红艳王亚坤李伟洪孝友于凌云陈辰徐昊旸
- 一种可用于微卫星检测的多重荧光PCR通用接头及检测方法和应用
- 本发明公开了一种可用于微卫星检测的多重荧光PCR通用接头，包括4条接头，分别为接头1、接头2、接头3和接头4，接头1～4的核苷酸序列如SEQ？ID：1～4中所示，该通用接头PCR扩增效率高，不互相干扰，也不会对待扩增微卫...
- 赵建朱新平李伟王亚坤文萍
- 文献传递
- 用于斑鳢性别鉴定的SNP位点及其检测方法
- 本发明公开了一种用于斑鳢性别鉴定的SNP位点及其检测方法，旨在提供一种简单快速且准确率较高的对斑鳢进行遗传性别鉴定的分子鉴别的位点及其方法。所述的碱基序列为：SEQIDNO：1或SEQIDNO：2；所述的SNP位点为SE...
- 赵建陈昆慈朱新平罗青王亚坤
- 文献传递
