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彭丰斌
作品数:
26
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深圳先进技术研究院
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相关领域:
理学
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合作作者
魏彦杰
深圳先进技术研究院
孟金涛
深圳先进技术研究院
冯圣中
深圳先进技术研究院
张慧琳
深圳先进技术研究院
张慧玲
深圳先进技术研究院
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基于混合并行方式的蛋白质热力学分析高效随机模拟方法
本发明涉及生物信息分析技术领域,提供了一种基于混合并行方式的蛋白质热力学分析高效随机模拟方法,包括:步骤A:确定蛋白质能量模型和能量区间;步骤B:确定所述蛋白质能量区间的分段方式;步骤C:模拟及计算蛋白质系统态密度。采用...
彭丰斌
魏彦杰
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弓英瑛
基于随机模拟的折叠病致病机理的分析方法
本发明公开了一种基于随机模拟的折叠病致病机理的分析方法。该方法应用ABEEMσπ浮动电荷力场能量模型进行研究,模拟及计算蛋白质系统的态密度的主从模式采用MPI并行程序算法进行计算;所述主从模式是指在N个分进程中,其中分进...
彭丰斌
魏彦杰
张慧玲
刘永春
文献传递
Smac蛋白二聚拟合物及其鉴定方法
本发明涉及生物化学技术领域,特别涉及一种Smac蛋白二聚拟合物及其鉴定方法与应用。本发明的Smac蛋白二聚拟合物以AT-406为骨架,用连接基团将两个AT-406单体分子连接,在保持AT-406优良的生物活性和药理、毒理...
魏彦杰
张慧琳
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
文献传递
基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统
本发明涉及生物信息学技术领域,特别涉及一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统。本发明的方法基于圆周统计对蛋白质折叠进行表征,高效、准确,即可以更快研究蛋白质的折叠,也可以更准确描述蛋白质动态变化,从而研究相关神经退...
魏彦杰
张慧玲
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
双向多步De Bruijn图的重复双向边识别与去除方法
本发明公开一种双向多步De Bruijn图的重复双向边识别与去除方法,包括步骤:S1.读取测序数据源文件,并构造双向多步De Bruijn图;S2.判断出度为3的顶点u是否指向的同一个顶点v的同一方向或者同一端,指向相同...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的双向边扩展方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对交...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
文献传递
基于蒙特卡洛模拟的蛋白质热力学分析方法
本发明涉及生物计算与蒙特卡洛模拟技术领域,具体公开一种基于蒙特卡洛模拟的蛋白质热力学分析方法,包括步骤A:确定蛋白质能量模型;步骤B:模拟及计算蛋白质系统态密度。采用本发明提供的方法,可以高效地分析和研究蛋白质折叠的整个...
彭丰斌
魏彦杰
张慧玲
文献传递
双向多步De Bruijn图的错误双向边识别与去除方法
本发明公开一种双向多步De Bruijn图的错误双向边识别与去除方法,包括步骤,S1、读取测序数据源文件,并构造双向多步De Bruijn图;S2、统计整个所述双向多步De Bruijn图的所有双向边的加权平均覆盖度W;...
孟金涛
张慧琳
彭丰斌
魏彦杰
冯圣中
基于体外共培养激活Notch-1信号通路的方法
本发明公开了一种基于体外共培养激活Notch-1信号通路的方法,属于生物信息学技术领域。该方法将乳腺癌细胞和稳定表达Notch-1配体的间质细胞分别在含体积分数10%小牛血清的DMEM培养基中培养后用PBS缓冲液清洗并收...
魏彦杰
张慧玲
彭丰斌
孟金涛
冯圣中
文献传递
基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法
本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对分...
孟金涛
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