梅寒
- 作品数：11 被引量：23H指数：3
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目四川省科技支撑计划四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 泸宁鸡MyoG基因的克隆及组织表达差异分析被引量：4
- 2015年
- 为了研究MyoG基因在鸡生长发育与肉质形成中的作用,试验以泸宁鸡为研究对象,采用RT-PCR技术克隆MyoG基因序列,并利用生物信息学的方法对其理化性质、氨基酸同源性等进行预测和分析,同时采用半定量方法检测MyoG基因在泸宁鸡不同组织中的表达水平。结果表明：泸宁鸡MyoG基因序列长度为741bp,其中开放阅读框（ORF）长度为684 bp,编码227个氨基酸,具有碱性螺旋-环-螺旋结构（bHLH）,与哺乳动物的同源性为70%~71%,与原鸡、火鸡、绿头鸭、游隼的同源性为91%~99%。组织表达谱结果表明,MyoG基因在泸宁鸡腿肌、胸肌、肝脏、肾脏、脑、脾脏、心脏中均有表达,在腿肌、胸肌、心脏中表达水平较高,在肝脏、肾脏和脑中表达水平较低,说明Myo G基因的表达主要集中于肌肉组织。
- 梅寒徐亚欧吕明张明刘红丽左斌石浩聂晓庆林亚秋
- 关键词：MYOG基因基因克隆
- 藏鸡垂体GH基因克隆、时序表达及与屠宰性能的关联研究被引量：1
- 2018年
- 【目的】为研究垂体GH基因对藏鸡屠宰性能的影响。【方法】以藏鸡为研究对象,利用RT-PCR技术克隆藏鸡GH基因,并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR检测GH基因在藏鸡不同发育阶段脑垂体中的表达谱,并与119日龄藏鸡屠宰性能进行关联分析。【结果】藏鸡GH基因长1029 bp,开放阅读框651 bp,编码216个氨基酸。与原鸡比较,核苷酸同源性为99%,存在7个核苷酸突变位点,不存在氨基酸变异;与火鸡比较,核苷酸同源性为94%,存在25个核苷酸突变位点,有7个氨基酸的差异,且在物种间进化上具有较高的保守性。GH基因在藏鸡81、119、154、210 d 4个发育时期的脑垂体中均存在表达,在81 d时表达量最高,极显著高于其他发育时期(P <0. 01),其余3个时期之间无显著差异,且不存在明显的性别差异。相关分析发现,垂体GH基因的表达与119日龄公藏鸡的活体重、屠体重、半净膛、全净膛等性状均呈正相关,其中与屠体重和半净膛的相关性达到了显著水平(P <0. 05),与腿肌重、腿肌率及胸肌率均呈负相关;与119日龄母藏鸡活体重、屠体重、半净膛、全净膛等屠宰性状均呈正相关,与屠宰率、半净膛率、胸肌率及腿肌率均呈负相关。【结论】本研究结果表明垂体GH基因的表达水平可能直接影响藏鸡早期生长发育。
- 王英明梅寒王志敏徐珑洋徐亚欧
- 关键词：屠宰性能
- 泸宁鸡肌肉硫胺素沉积规律研究被引量：2
- 2015年
- 以四川省优质地方鸡种泸宁鸡为素材,分别从不同时期(81、119、154、210日龄)的200只鸡中随机选取8公8母,采用高效液相色谱法测定不同组织、日龄、性别肌肉中硫胺素的含量。结果显示,公母鸡腿肌硫胺素含量极显著高于胸肌(P<0.01);公母鸡胸肌、腿肌硫胺素含量均在119日龄达到最高;随着日龄的增加,胸肌与腿肌硫胺素含量先上升后下降;胸肌硫胺素含量119日龄与81日龄、210日龄差异显著(P<0.05),其余各日龄间差异不显著(P>0.05);腿肌硫胺素含量各日龄间差异均显著(P<0.05)。硫胺素含量与屠宰性状相关性分析结果显示,119日龄胸肌硫胺素含量与胸肌重呈极显著相关(P<0.01),腿肌硫胺素含量与腹脂重呈极显著相关(P<0.01)、与腿肌重呈显著相关(P<0.05)。
- 聂晓庆徐亚欧阳明华陆岩冰王培王海梅寒刘红丽左斌石浩林亚秋
- 关键词：屠宰性状相关系数
- 米易鸡ADSL基因第2和第9外显子多态性与肌苷酸含量的关联被引量：6
- 2015年
- 为了检测米易鸡ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性并分析该多态性与胸肌肌苷酸含量的关联性,以四川省优质地方鸡种米易鸡为研究对象,采用高效液相色谱测定米易鸡胸肌肌肉肌苷酸的含量,并运用测序技术测定了ADSL基因第2、第9外显子的单核苷酸多态性。结果表明:ADSL基因在外显子2(A3713G、C3797T),外显子9(C10191T)处出现3个SNP位点,变异引起相应的氨基酸均为同义变异,第2外显子A3713G位点的基因型为AA、GG、AG型;C3797T位点的基因型为CC、CT、TT型;第9外显子的C10191T位点的基因型为CC、CT型。经独立性检验,ADSL基因A3713G、C10191T位点变异处于Hardy-Weinberg平衡状态;应用最小二乘法对基因型与肌苷酸含量进行分析,说明ADSL第9外显子C10191T SNP位点与IMP含量存在显著相关性(P<0.05),CT型个体的胸肌肌苷酸含量高于CC型个体,初步推测米易鸡中ADSL基因第9外显子C10151T SNP位点CT型为优势基因型。
- 石浩徐亚欧梅寒王海刘红丽左斌聂晓庆胡卫民
- 关键词：肉质风味外显子2
- 藏鸡POU1F1基因的克隆测序及生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 为研究青藏高原特有鸡种,藏鸡的生物学特性,从藏鸡垂体组织的RNA中克隆POU1F1基因,并利用生物信息学对其进行分析.结果显示,藏鸡POU1F1基因开放阅读框(ORF)长为984bp,编码327个氨基酸.编码序列中有13个丝氨酸(Ser)、2个酪氨酸(Tyr)、6个苏氨酸(Thr)磷酸化位点;1个N糖基化位点;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;藏鸡POU1F1氨基酸序列与红色原鸡POU1F1氨基酸序列的亲缘关系最近.藏鸡POU1F1基因氨基酸序列可能与藏鸡生长速度慢的特性相关.这一研究结果为今后的藏鸡育种工作提供重要的靶点和参考.
- 徐亚欧梅寒徐珑洋王志敏王英明
- 关键词：藏鸡POU1F1基因生物信息学分析
- 藏山羊PID1基因克隆及组织表达分析
- 2016年
- 研究旨在获得藏山羊磷酸酪氨酸互作结构域(phosphotyrosine interaction domain containing l,PID1)基因序列,并进一步分析该基因的生物学特性以及揭示其组织表达规律。以藏山羊为材料,利用RT-PCR技术克隆PID1基因,利用荧光定量PCR检测其组织表达特性。结果表明,藏山羊PID1基因CDS区为654bp,编码217个氨基酸,为无跨膜结构的酸性不溶类蛋白。同源性分析表明,藏山羊与山羊的同源性较高为99%,且处在进化树的同一个分支上。PID1在藏山羊的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织中均检测到表达,但在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01)。研究获得了藏山羊PID1基因序列,其在脂肪组织中的表达水平最高。
- 吕明林森朱江江王永梅寒廖红海李倩林亚秋
- 关键词：藏山羊基因克隆
- 藏鸡、泸宁鸡POU1F1基因外显子2多态性与生长性能的关联研究被引量：1
- 2018年
- 为研究POU1F1基因的多态性对鸡生长发育的影响,试验以藏鸡和泸宁鸡为研究对象,采用PCR-SSCP及测序方法对POU1F1基因的外显子2的多态性进行检测,并与其生长性能进行关联分析。结果表明：在藏鸡和泸宁鸡POU1F1基因外显子2处检测到1个多态位点（C/T）变异,呈现出CC、CT、TT三种基因型,其中C基因为优势基因,CC基因型为优势基因型;两个鸡群在该位点基因杂合度均较低,PIC〈0.25,属低度多态性;经卡方检验,在该位点藏鸡不处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〈0.05）;泸宁鸡则处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）;泸宁鸡6周龄时,CC基因型个体体重显著高于CT型（P〈0.05）,其他周龄之间无显著差异;藏鸡和泸宁鸡均表现出CT基因型的生长态势较纯合子好;泸宁鸡6~7周龄和10~11周龄CT型个体极显著高于CC基因型个体的周增重率（P〈0.01）;9~10周龄CT基因型个体的周增重率显著高于CC型个体（P〈0.05）;藏鸡和泸宁鸡POU1F1基因外显子2多态位点（C/T）中,C基因为优势基因,而CT基因型是控制泸宁鸡早期生长速度的优势基因型。说明POU1F1基因的多态性是鸡早期生长速度的一个潜在分子标记。
- 徐珑洋梅寒王志敏王英明杨磊徐亚欧
- 关键词：藏鸡POU1F1基因PCR-SSCP
- 藏山羊FGF21基因克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- 为探讨藏山羊FGF21基因的分子结构特征,利用RT-PCR技术对该基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明：获得藏山羊FGF21基因序列650 bp,ORF长度为634 bp,编码209个氨基酸。氨基酸序列分析显示,藏山羊FGF21编码蛋白属于不稳定酸性蛋白,分子式为C1 022H1 596N276O296S5,分子质量为22.65 ku。预测该蛋白含有13个磷酸化位点,并与多种蛋白存在相互作用;无跨膜结构域,有信号肽结构。在47~164位氨基酸残基存在FGF结构域。亚细胞定位显示,FGF21蛋白大部分位于细胞质内。同源性分析指出山羊FGF21氨基酸序列保守性较高,与Gen Bank中藏羚羊、牛、印度水牛及猪等的同源性在90%~99%。本研究结果为阐明FGF21基因在藏山羊中的作用提供重要的基础数据。
- 沈阅林亚秋梅寒李想张小玉
- 关键词：藏山羊克隆生物信息学分析
- 藏鸡A-FABP基因和H-FABP基因的克隆及生物学信息分析
- 2015年
- 以藏鸡为研究对象,根据NCBI上登录的原鸡A-FABP和H-FABP基因序列设计引物,利用RT-PCR方法克隆藏鸡A-FABP和H-FABP基因的CDS区,并进行生物信息学分析.结果表明:藏鸡A-FABP和H-FABP基因的ORF分别为399 bp、402 bp,编码132、133个氨基酸;A-FABP和H-FABP分子量分别为14.91ku、14.84ku,等电点分别为6.34、5.92,均为亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构.磷酸化位点分别有9、6个,O糖基化位点分别有10、5个;藏鸡A-FABP和H-FABP的氨基酸序列与原鸡的同源性最高,分别为99%、100%,在鸟类动物中序列比较保守.
- 梅寒王强徐亚欧吕明左璐璐聂晓庆林亚秋
- 关键词：藏鸡A-FABP基因H-FABP基因克隆
- 肌细胞生成素基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联研究被引量：3
- 2015年
- 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联性。采用PCRSSCP和DNA测序技术,对泸宁鸡MyoG基因5′调控区的多态性进行检测。结果表明,泸宁鸡MyoG基因5′调控区存在4个多态位点(A153G、A267G、A446G和C612T)。在153bp处存在A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),其中AA基因型肝脏重显著高于AG、GG基因型(P<0.05)。在446bp处存在的A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),该位点GG基因型屠宰率显著高于AA、AG基因型(P<0.05),AG、GG基因型胸肌率显著高于AA基因型(P<0.05)。以上结果显示,MyoG基因5′调控区的多态性与泸宁鸡肝脏重、屠宰率、胸肌率有一定的关联性,可作为泸宁鸡相应生长性状的候选基因。
- 刘红丽徐亚欧熊斌胡卫民梅寒石浩左斌聂晓庆王海
- 关键词：MYOG基因PCR-SSCP生长性状
