袁久云
- 作品数：2 被引量：11H指数：1
- 供职机构：军事医学科学院疾病预防控制所更多>>
- 发文基金：北京市科技新星计划国家自然科学基金北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于RNA-Seq的羊种布鲁氏菌新转录本与非编码RNA鉴定被引量：10
- 2015年
- 目的对羊种布鲁氏菌的转录本进行测序,鉴定基因组中新的转录本和非编码RNA。方法提取羊布鲁氏菌的总RNA,去除rRNA后连接接头逆转录成cDNA,PCR扩增后进行测序,以羊布鲁氏菌16M的基因组序列为参照对测序得到的reads进行比对作图,通过生物信息学方法进行新转录本和非编码RNA的鉴定。结果测序数据分析显示,reads在基因组上覆盖度较好。与现有注释基因相比,有773个基因的5′或3′端在基因组的原有位置基础上发生了延伸,并发现了16个新的转录本。根据测序结果,共鉴定出241条候选的非编码RNA(sRNA),进一步的RT-PCR验证结果显示,预测的sRNA在体外条件下有表达。结论布鲁氏菌基因组中存在除了预测以外的新的转录本,布鲁氏菌中存在非编码RNA且在不同条件下有差异表达。
- 郭英飞王玉飞龚春丽杨明娟袁久云庄妤冰柯跃华杜昕颖汪舟佳陈泽良
- 关键词：布鲁氏菌RNA-SEQSRNA
- 非编码小RNA BSR0602在布鲁菌环境适应能力中的调控作用被引量：1
- 2015年
- BSR0602是位于布鲁菌染色体上的非编码小RNA,在前期研究中我们发现,BSR0602与布鲁菌的胞内生存能力相关.为了进一步研究BSR0602对布鲁菌胞内环境适应能力的调控作用,采用双向电泳技术对布鲁菌野生株16M和BSR0602过表达株的全菌蛋白质谱进行比较分析.结果显示,BSR0602过表达后,布鲁菌转运代谢蛋白和压力适应蛋白的表达发生变化.qRT-PCR和HIS表位标记实验结果进一步证实,BSR0602在转录和翻译水平均影响氧压力适应蛋白Sod A的表达.相关表型实验结果显示,BSR0602过表达株对氧压力更为敏感,证实了BSR0602在布鲁菌适应氧压力中的作用.结果表明,非编码小RNA BSR0602作为布鲁菌的转录后调控因子,可通过调控压力适应蛋白的表达来影响布鲁菌的压力适应能力和胞内生存.
- 袁久云龚春丽庄妤冰雷霜霜陈泽良黄克和王玉飞
- 关键词：布鲁菌双向凝胶电泳转录调控
