赵琳
- 作品数：11 被引量：39H指数：4
- 供职机构：福建省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：福建省自然科学基金福建省医学创新课题国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 美国《Emerging Infectious Diseases》2015年第1期有关人兽共患病论文摘译被引量：1
- 2015年
- P16 1900-2012年美国人间鼠疫流行病学／／Ki-ersten.J．Kugeler，J．Erin Staples，Alison F．Hinck-ley，等 我们总结了自1900年首例记载鼠疫病例以来，美国113年出现的1006例人间鼠疫的特点。通过病例出现频率、发生性质以及地理分布来划分3个不同的时期。在1900-1925年期间，病例爆发比较常见，但局限于人口密集的港口城市。
- 赵琳张拥军
- 关键词：DISEASES人兽共患病论文摘译鼠疫流行病学人间鼠疫
- 一株达菲耐药的甲型H1N1流感病毒全基因特征分析被引量：9
- 2016年
- 目的分析1株甲型H1N1流感达菲耐药病毒株的全基因特征,为指导流感临床治疗与防控提供依据。方法采用鸡胚进行病毒分离,提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增其全基因组8个基因片段,测定核苷酸序列,利用生物信息软件拼接全基因组序列,绘制基因进化树并分析重要基因位点变异情况。结果 A/Fuzhou/SWL11609/2013(H1N1)流感毒株的8个节段基因均处于2013-2014年度进化簇中,且与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株高度同源,8个基因同源性均在97.4%以上;其HA和NA基因与A/Hubei-Wuchang/SWL1322/2013(H1N1)达菲耐药株同源性最高,分别为100.0%和99.6%;初步判断该毒株未发生重配现象,其重要致病性基因位点未发生变异;NA基因中具有H275Y典型达菲耐药位点特征,缺失一个糖基化位点(N386K),降低了基因结构的稳定性,同时在V241I和N369K的作用下降低了病毒的适应性。结论本次研究的甲型H1N1流感达菲耐药病毒株表现为低致病性流感病毒特征,但具备较好的人传人能力,需进一步加强监测,谨防耐药株的广泛流行。
- 谢剑锋张炎华赵琳修文琼陈宏彬翁育伟郑奎城
- 关键词：甲型H1N1流感病毒
- 2014-2016年福建省H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析被引量：3
- 2018年
- 目的了解2014—2016年福建省H3N2亚型流感病毒血凝素(HA)基因特征及其变异情况。方法随机选取44株病毒,对病毒的HA基因进行扩增和测序;然后利用生物信息学软件和在线分析网站对序列进行拼接、校对、相似性与差异性比较以及基因进化树构建等基因特征分析。结果44株H3N2亚型流感病毒HA基因核苷酸相似性在97.3%-100.0%之间,2014年、2015年与2016年流行株与对应疫苗株之间的平均基因差异分别为0.012、0.008和0.009。2014年流行株的基因型为3C.3a,与疫苗株3C.1不同,2015年与2016年流行株与疫苗株的基因型相同,但其抗原表位、受体结合位点和糖基化位点发生了变异。结论2014-2016年福建省H3N2亚型流感病毒逐年发生变异,显示出逃避疫苗免疫作用的能力,应加强流感监测,以及时发现变异情况,为流感防控提供科学依据。
- 张炎华陈宏彬赵琳修文琼谢剑锋翁育伟郑奎城
- 关键词：H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征
- 人感染H7N9禽流感病毒全基因组扩增与测序方法的建立被引量：4
- 2015年
- 目的为了解人感染H7N9禽流感病毒基因特征从而更有效地防控疫情,需建立获得人感染H7N9禽流感病毒全基因序列的扩增和测序方法。方法采用鸡胚分离H7N9禽流感病毒,提取标本和毒株病毒RNA,自行设计引物,通过一步法RT-PCR扩增其全基因组片段,纯化PCR产物后测定核苷酸序列,利用生物信息学软件拼接各节段序列并初步分析其特征。结果本研究中的引物能特异地扩增各基因的目的片段,通过序列拼接可以获得H7N9禽流感全基因组序列。经分析8个节段序列与近期国内流行的人感染H7N9禽流感病毒序列高度同源。结论该方法能有效地获得人感染H7N9禽流感病毒全基因组序列,可为进一步分析其基因特征奠定基础。
- 谢剑锋赵琳张炎华翁育伟陈炜王金章何文祥吴冰珊黄萌黄枝妙朱颖郑奎城严延生
- 关键词：全基因组
- 福建省1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的全基因组特征分析被引量：3
- 2017年
- 目的了解1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的生物学特性和变异情况,为临床治疗与疫情防控提供依据。方法利用MDCK细胞分离不明原因肺炎病例中的甲型H1N1流感病毒,分离的毒株经全基因组测序后分析其抗原性、致病性和耐药性等特征。结果从该病例的咽拭子标本中分离得到1株甲型H1N1流感病毒并命名为A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1),其8个节段的核苷酸和氨基酸序列与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株的相似性分别为96.9%~98.9%和96.7%~99.5%。氨基酸序列分析显示HA蛋白共有18个位点发生突变,其中K163Q、S185T、S203T和D222N变异涉及到3个不同的抗原位点,提示病毒发生抗原漂移;与受体结合位点相关的D222N突变还提示病毒感染下呼吸道的能力增强。耐药性分析显示该病毒对金刚烷胺耐药,对达菲仍然敏感。结论本次研究的甲型H1N1流感病毒具有抗原漂移现象,且具备引发重症肺炎的分子特征,应进一步加强监测,为疫情防控奠定基础。
- 张炎华翁育伟张建明修文琼陈宏彬赵琳何文祥朱颖谢剑锋郑奎城
- 关键词：不明原因肺炎甲型H1N1流感
- 2010-2015年福建省乙型流感病毒血凝素基因特征分析被引量：4
- 2017年
- 目的 了解2010-2015年福建省乙型流感病毒血凝素（HA）基因特征,明确流行株对疫苗的匹配情况.方法 从2010-2015年福建省流感网络实验室保存的乙型流感毒株中随机抽取BVictoria系和Yamagata系流感病毒,通过RT-PCR方法扩增HA基因,测序获得其全长序列,然后利用生物信息学软件分析HA基因特性.结果 与疫苗株相比,2010-2015年B Yamagata系流感病毒HA基因变异程度较大,主要有116、150、165、196和202这5个涉及抗原决定簇的氨基酸位点变异,且随时间的推移变异位点逐渐增多,尤以2010年、2014年和2015年变异较为明显;然而,Victoria系流感病毒HA基因的变异较小,且没有明显随时间累积的趋势.2010年和2015年两个年份WHO推荐的Yamagata系疫苗株对福建省的乙型流感保护效果不佳,其余年份的Yamagata系疫苗株对人群保护作用尚可,而Victoria系疫苗株仍具有较好的保护效果.结论 随着时间的推移,乙型流感病毒已经逐渐发生变异,部分年份的Yamagata系毒株与疫苗株的匹配效果不佳,且出现了抗原漂移现象.今后需进一步加强流感病毒基因监测,以及时发现新的变异株,为流感防控提供依据.
- 林丽华谢剑锋翁育伟张炎华赵琳郑奎城
- 关键词：乙型流感病毒血凝素基因特征进化树
- 福建省人感染H5N6禽流感病毒与外环境禽流感病毒相关性分析被引量：8
- 2018年
- 目的分析福建省外环境H5亚型禽流感病毒分布情况及与人感染H5N6禽流感的关系,为人感染禽流感的科学防治提供依据。方法收集2013-2017年福建省外环境常规监测标本信息,进行统计分析。从数据库下载相关禽流感病毒基因序列,进行基因同源性比对和系统进化分析。结果外环境监测结果统计分析显示:2013-2017年共采集样本4 903份,H5亚型阳性率为4.24%,且不同的网络实验室(χ~2=101.033)、监测场所(χ~2=45.526)、标本类型(χ~2=31.751)和季节(χ~2=48.174)阳性率均存在统计学差异(P<0.05)。福建省首例人感染H5N6禽流感(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)病毒全基因序列与6株福建省外环境H5N6病毒的同源性在85.1%~98.5%,与病家院中采集的1株加强监测外环境标本的HA和NA基因同源性分别为100.0%和99.9%。系统进化分析显示:福建省人感染H5N6病毒HA基因与加强监测的外环境H5N6病毒的进化距离最近,与其余6株距离较远,处在不同的进化分枝中,其基因源于H5N8病毒;而NA基因则与7株外环境H5N6病毒的进化距离较近,源于H5N6病毒。结论福建省冬春季外环境中禽流感活动较为活跃,应加强活禽交易市场的卫生管理工作。福建省发现的首例人感染H5N6禽流感与外环境禽流感病毒的重配可能存在一定的相关性。
- 陈平谢剑锋林琦赵琳张炎华陈宏彬翁育伟郑奎城
- 关键词：进化分析
- 2016年福建省人感染H7N9禽流感病毒全基因特征分析被引量：3
- 2017年
- 本文对2016年福建省7株人感染H7N9禽流感病毒的全基因序列进行分析,研究其遗传进化和基因特征,了解经历过3波流行后福建省人感染H7N9禽流感病毒分子特征变化。遗传进化分析结果显示:2016年福建省人感染H7N9禽流感病毒的HA、NA和M病毒表面基因均处在长三角进化簇中,而病毒的其他内部基因则分散在长三角和珠三角进化簇中。同源性分析结果显示:与疫苗株A/Anhui/1/2013(H7N9)比较,2016年福建的7株毒株核苷酸和氨基酸同源性分别在95.2%和97.4%以上。关键氨基酸位点分析结果显示:HA受体结合关键氨基酸位点均发生G186V和Q226L变异;部分毒株具有毒力增强位点的改变,如PB2基因的L89V、E627K和Q591K,M1基因的N30D和T215A,NS1基因的P42S;病毒虽具有金刚烷胺耐药特征的M2基因S31N变异,但未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点变异。以上结果表明:2016年福建7株人感染H7N9禽流感病毒的HA和NA片段源于长江三角洲的H7N9病毒,病毒具备对人的易感性,及时使用神经氨酸酶抑制剂是救治病例的关键。
- 黄婕莉谢剑锋赵琳张炎华林琦翁育伟郑奎城
- 关键词：进化树基因特征
- 福建省2013—2015年流感监测哨点医院工作质量评价被引量：2
- 2017年
- 目的评价福建省近年来流感监测哨点医院工作质量,进一步强化全省流感监测网络的管理工作。方法从中国流感监测信息系统导出2013年至2015年福建省21家哨点医院上报告的流感样病例(ILI)监测数据,联合应用逼近理想解排序法(TOPSIS)和秩和比法(RSR)分析5项评价指标,对监测质量排序,由高到低分为A、B、C和D档。结果评价表明,监测质量A、B、C、D档任意两个档次间的医院工作质量差异均有统计学意义(方差分析SNK法);3年来达到A、B档的医院由47.6%升至71.4%,连续保持A档的仅南平及厦门的部分哨点医院;大部分哨点医院的工作质量逐年提升,尤其是龙岩两家医院在2015年均达到A档;仍有个别哨点医院的监测质量下滑。结论福建省流感监测哨点医院工作质量整体在提升,仍有部分医院的监测管理与督导须进一步强化。
- 黄萌张炎华赵琳修文琼陈宏彬陈宏彬谢剑锋翁育伟
- 关键词：流感监测流感样病例
- 福建省首例人感染H5N6禽流感病例实验室诊断与病毒序列初步分析被引量：3
- 2018年
- 目的分析福建省首例人感染H5N6禽流感病例的实验室检测结果，为今后实验室检测和疫情防控提供依据。方法采集患者咽拭子和外环境标本，提取病毒RNA，采用Real-time PCR方法检测标本H5N6亚型流感病毒，对病毒HA和NA基因片段采用一步法RT-PCR进行扩增并测序，利用生物信息学软件初步分析病毒进化特征。结果病例咽拭子标本经实验室确诊为H5N6亚型流感病毒，命名为：A/Fujian-Sanyuan/21099/2017（H5N6）；不同时间先后5次采集患者咽拭子标本，前3次仍检出H5N6流感阳性；采集43份外环境标本，检测出16份H5阳性标本；同源性分析发现A/Fujian-Sanyuan/21099/2017（H5N6）病毒的HA和NA基因分别高度同源于A/Cygnus atratus/Hubei/2Z2-O/2016（H5N8）病毒和A/chicken/Hubei/ZYSJF16/2016（H5N6）病毒，同源性分别达99.6%和99.0%；氨基酸分析发现，病毒HA基因切割位点具有多个连续的碱性氨基酸，氨基酸序列为：PLREKRRKR﹡GLF。结论该患者为福建省首例人感染高致病性H5N6禽流感病毒病例，该病毒HA和NA基因分别与H5N8和H5N6病毒基因高度相似。
- 罗宏活林琦庄金凤杜琳琅张炎华陈宏彬赵琳翁育伟郑奎城谢剑锋
- 关键词：进化树
