陈鹏
- 作品数：37 被引量：59H指数：6
- 供职机构：北京大学化学与分子工程学院化学生物学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学医药卫生化学工程更多>>
- 转化化学:医学驱动的化学前沿研究
- 2023年
- 本文围绕医学与化学的前沿交叉研究,基于第288期双清论坛的研讨内容,提出通过临床医学的问题和场景来启发化学的前沿研究,进而通过分子科学的创新推动医学问题的解决。这一研究思路有望推动“转化化学”的快速发展,促进化学和医学两个学科的协同创新。同时,本文还凝练了该领域的主要研究方向和若干关键科学问题,指出面临的技术瓶颈,思考未来5~10年的发展目标和资助重点。
- 陈鹏李劼樊新元邢曦雯杨俊林孟庆峰张艳
- 关键词：分子医学
- 基于非天然氨基酸的蛋白质生物正交标记被引量：7
- 2012年
- 生物正交化学反应正日益成为在活体内对生物大分子进行特异标记的一种有效方法.最近涌现出的一个突出的例子是将金属钯催化的碳碳偶联反应这一在有机合成领域具有里程碑意义的反应拓展到生物大分子的标记上.在活细胞上进行生物正交反应的一个先决条件是需要将参与这类反应的正交官能团特异地引入到目标生物大分子当中.遗传密码子拓展技术是将多种生物正交活性基团引入到蛋白质当中的一种先进的手段;最近发展出的基于吡咯赖氨酸氨酰合成酶和tRNA的体系能够将携带有生物正交官能团的非天然氨基酸有效地引入到原核生物、真核生物,甚至是动物体内的蛋白质上.在这一展望中,我们首先介绍在生物正交反应和遗传密码子拓展这两个领域内的研究前沿与进展.接着我们将讨论将这些新发展的研究工具,尤其是基于钯催化的生物正交反应和基于吡咯赖氨酸氨酰合成酶的遗传密码子拓展技术,应用于标记和修饰哺乳动物细胞蛋白质上的优势和诱人前景.生物相兼容性更好的正交反应和更为灵活的非天然氨基酸引入技术必将有力地增强和拓宽人们在活细胞环境下特异操纵蛋白质的能力.
- 李劼王杰陈鹏
- 关键词：钯催化非天然氨基酸
- 邻近标记方法表征细胞-细胞相互作用被引量：2
- 2020年
- 细胞-细胞相互作用在多种生理过程中有重要意义,针对这些相互作用的研究是化学与生命科学交叉领域的前沿热点.基于对酶的功能改造、定向进化和精准的时空调控,酶介导的邻近标记方法在分析细胞-细胞相互作用方面具有广泛的应用前景.本文重点描述了现有邻近标记方法的原理、效果、优缺点及潜在应用.
- 马维绎刘士博陈鹏
- 基于蛋白质工程的活细胞内自由基成像
- 活性氧化合物(ROS)是一系列化学性质高度活泼的含氧原子化合物和自由基的总称，这些化合物在生物体内的寿命非常短暂，且各类活性氧的性质极其相似，如何实时地、高特异性地识别一类特定的活性氧，以便进行活细胞体内成像，是该领域备...
- 赵博譞陈鹏
- 基于化学小分子探针的信号转导过程研究进展被引量：1
- 2017年
- 本文综述了国家自然科学基金委员会"基于化学小分子探针的信号转导过程研究"重大研究计划的系统研究成果。重点涵盖了在"针对信号转导过程的新型分子探针的开发与制备"、"探测信号转导过程的化学生物学方法与前沿技术"、"信号转导分子机制的深入研究"和"基于信号转导途径的药物靶标与先导化合物发掘"等4个方面所取得的突破性创新进展。简要展望了化学生物学发展态势与前景,特别是应当继续发挥学科交叉的优势,在工具发展和技术革新上实现新飞跃,开辟生命科学研究前沿新方向。
- 陈鹏杨财广张艳蒋华良张礼和
- 关键词：化学生物学药物靶标
- 生物正交标记反应研究进展被引量：14
- 2015年
- 对活体生物大分子进行特异性标记是一项具有挑战性的工作,它要求这类化学反应能够在生理条件下高效特异地进行,不会与生物体系中存在的各种活性物质发生副反应.最近十几年开发的生物正交反应能够比较好地满足这些要求,它们在生物分子标记方面的应用拓展了我们对细胞内生物体系的理解.主要介绍那些应用广泛且可以用于活体细胞标记的生物正交反应.重点介绍通过位点特异性引入生物正交官能团来进行选择性标记细胞内目标蛋白质的策略.同时,我们根据使用催化剂类型对这些生物正交反应进行分类,并且列表比较它们的差异,以便于研究者挑选合适的反应.最后对生物正交反应的开发和进一步应用进行了展望.
- 杨麦云陈鹏
- 关键词：活体细胞位点特异性非天然氨基酸
- 逆电子需求的狄尔斯-阿尔德反应在生物正交化学领域的发展与应用被引量：3
- 2020年
- 逆电子需求的狄尔斯-阿尔德(IEDDA)反应由于其生物兼容性好、反应专一性高、反应速率快等优点逐渐成为最受关注的生物正交化学反应.因此,研究者围绕IEDDA反应,从包括反应机理、底物合成、效率优化以及反应应用等多个角度进行了深入研究与探索,开发了分别用于生物正交偶联和生物正交断键的IEDDA反应.本文首先从反应的发展和优化角度对IEDDA反应进行了介绍,随后归纳总结了IEDDA分别作为偶联反应和断键反应在生物大分子标记、药物运输、药物动力学研究、蛋白质调控与功能激活、前药释放、siRNA激活以及RNA固相纯化等领域的生物应用.最后,对IEDDA反应的进一步研究与应用进行了展望,期待通过对更优反应对的开发以及更广泛生物应用的探索,将生物正交化学的发展与应用推进到一个新的高度.
- 张贤睿罗惠鑫樊新元陈鹏
- 位点特异、拓扑结构明确的蛋白质-聚氨基酸偶联物的简洁合成
- 2016年
- 发展位点特异且具有明确拓扑结构的蛋白质-高分子偶联物是高分子和化学生物学领域共同面对的挑战之一.在聚合物末端精确引入一个或多个具有特殊反应活性的生物正交官能团是实现"位点特异"生物偶联的关键前提.这一过程通常比较低效、需要多步骤的官能团转化、聚合后修饰以及保护脱保护,费时且繁琐.最近,通过在聚合过程中原位生成官能团,以一锅-两步的过程得到可直接用于蛋白质偶联的异遥爪聚合物,从而实现了多种不同拓扑结构的蛋白质-聚氨基酸偶联物的快速构筑.这一简洁的合成路线实现了以前尚未获得的头-尾相接的环状偶联物的制备,使这些偶联物表现出了很强的体外酶稳定性以及热稳定性.该工作是蛋白质-高分子偶联化学的一次创新的尝试;同时,利用该方法所制备的偶联物在蛋白质药物领域具有广阔的应用前景.
- 陈鹏
- 利用蛋白质激活策略研究MAPK通路的信号传递过程
- 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路是感应环境中的各种刺激信号,如生长因子、热刺激、细胞因子等,并直接与细胞的生长、分裂、分化、凋亡等生理过程相关,是细胞内非常重要的一条信号通路。到目前为止,通过各种手段人为操纵信号通...
- 郑斯齐陈鹏
- 关键词：MAPK信号通路
- 文献传递
- 钯介导的生物正交断键反应的开发及应用
- 利用化学小分子调节细胞内生物大分子的活性，一直是化学生物学家努力的方向之一。我们的策略是将酶的关键残基位点插入带保护基的非天然氨基酸，使其丧失活性。通过发展生物正交消除反应，利用小分子将这种保护基脱去，将活性位点的残基恢...
- 王杰陈鹏
- 关键词：非天然氨基酸钯催化蛋白酶激活
