姚攀锋
- 作品数：9 被引量：57H指数：4
- 供职机构：四川农业大学生命科学与理学院更多>>
- 发文基金：四川省教育厅青年基金四川省国际科技合作与交流研究计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 苦荞转录因子基因FtbHLH3的克隆及其非生物胁迫下的表达分析被引量：12
- 2016年
- 根据苦荞花期转录组数据,采用RT-PCR技术和PCR技术克隆得到一条新的b HLH类蛋白基因FtbHLH3(登录号:KU296217),并分析了逆境胁迫下该基因在芽期苦荞胚轴和子叶中的表达量。结果显示,Ftb HLH3基因cDNA全长1 273 bp,包含一个957 bp的开放阅读框,编码蛋白含318个氨基酸。蛋白结构域分析表明,FtbHLH3编码蛋白N-端和C-端分别含有一个bHLH家族典型的结构域。系统进化树分析表明,FtbHLH3与其它植物参与抗逆的bHLH蛋白聚为一簇。荧光定量PCR分析表明,UV-B处理苦荞后,胚轴中FtbHLH3相对表达量在6 h内缓慢增加至1.08,12 h后显著上升至48 h的2.96;而子叶中FtbHLH3相对表达量在3 h后就显著上升,至24 h达到最大值6.64后趋于稳定。4℃冷处理苦荞后,胚轴和子叶中FtbHLH3相对表达量均随时间持续上升,并在48 h后达到最大值,分别为3.22和10.27。可见,本研究克隆的Ftb HLH3基因可能参与了苦荞对UV-B和寒冷等非生物胁迫的应答反应。
- 姚攀锋赵学荣李茂菲王安虎吴琦
- 关键词：苦荞基因克隆非生物胁迫
- 苦荞转录因子基因FtMYC的克隆及其表达与花青素积累的相关性分析被引量：3
- 2019年
- 【目的】克隆苦荞FtMYC基因,分析非生物胁迫对FtMYC基因表达及花青素含量的影响。【方法】根据苦荞转录组数据克隆FtMYC基因,对其进行生物信息学分析;通过4℃和UV-B胁迫处理芽期苦荞,分析胁迫后苦荞胚轴和子叶中FtMYC基因表达量与花青素积累之间的相关性。【结果】苦荞FtMYC基因DNA全长1 309 bp,由1个外显子和1个内含子构成,符合GT-AG剪切原则;c DNA序列包括1个1 287 bp的开放阅读框,编码428个氨基酸;在进化树上它与参与花青素调控的其他MYC蛋白聚为一簇;UV-B逆境胁迫处理下,苦荞胚轴中FtMYC基因表达量与花青素含量变化显著性相关(r=0.798,P<0.05),在子叶中则极显著相关(r=0.887,P<0.01);在4℃冷胁迫处理下苦荞胚轴中FtMYC的表达量与花青素积累没有明显的相关性(r=0.744),但在子叶中FtMYC的基因表达与花青素积累显著性相关(r=0.814,P<0.05)。此外,对FtMYC基因启动子的序列分析结果显示,pFTMYC序列包含TATA-Box和CAAT-Box等启动子核心元件以及与光、低温和胁迫应答等相关的功能元件。【结论】FtMYC基因可通过参与花青素代谢调控来参与苦荞对UV-B和寒冷等非生物胁迫的应答和适应。
- 姚攀锋吕兵兵李琪董玘鑫王安虎吴琦
- 关键词：苦荞MYC转录因子基因克隆非生物胁迫
- 苦荞查尔酮合酶基因FtCHS1启动子的克隆及分析被引量：8
- 2017年
- 采用染色体步移技术,从苦荞(Fagopyrum tataricum Gaertn.)中克隆获得Ft CHS1基因5'端侧翼序列,共1038 bp,将其命名为PFt CHS1。生物信息学分析表明,PFt CHS1中A/T碱基含量为63.5%,含有4个可能的转录起始位点,分别位于起始密码子上游-684^-734、-692^-742、-920^-970、-929^-979 bp处,该序列包含TATA-Box和CAAT-Box等启动子核心元件以及与光、低温和激素应答等相关的功能元件。本研究进一步构建了PFt CHS1-p BI101植物表达载体,并瞬时转化拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)叶片,结果显示该序列可驱动GUS报告基因的表达。低温(4℃)和光照(UV-B)处理苦荞幼芽后,采用荧光定量PCR技术分析Ft CHS1基因的表达量,结果表明PFt CHS1可响应低温和紫外环境胁迫,从而引起Ft CHS1基因表达量发生变化。
- 赵学荣杨燕雒晓鹏姚攀锋王安虎赵海霞吴琦
- 关键词：苦荞查尔酮合酶基因启动子
- 茉莉酸甲酯对芽期苦荞黄酮积累及相关基因表达的影响被引量：25
- 2015年
- 茉莉酸甲酯(Me JA)是一种新型植物内源激素,该激素可以参与植物黄酮类物质的合成代谢途径。本实验用100μmol/L茉莉酸甲酯溶液对芽期苦荞进行叶面喷施处理,于0~12 h采样。采用Al Cl3法测定处理前后苦荞的总黄酮含量,利用半定量RT-PCR检测苦荞黄酮代谢相关的3个Ft JAZ蛋白基因、3个Ft MYB转录因子以及6个关键酶的基因表达量,并对基因表达量与总黄酮含量进行了相关性分析。结果表明,经茉莉酸甲酯处理后,苦荞芽菜叶片总黄酮含量有所升高,各基因表达模式有所不同,其中Ft JAZ1、Ft JAZ2、Ft JAZ3、Ft MYB2以及Ft PAL基因表达量与总黄酮含量变化趋势相似,而Ft MYB3与Ft F3’H表达量与总黄酮含量变化趋势相反。相关性分析表明,总黄酮含量与Ft MYB2(相关系数为0.864)和Ft JAZ1(相关系数为0.863)显著正相关,与Ft MYB3负相关(相关系数为-0.70),与所有黄酮合成关键酶基因均成正相关。本研究为进一步揭示茉莉酸甲酯参与苦荞黄酮代谢调控的机制奠定了基础。
- 雒晓鹏朱冬寅黄云吉李茂菲姚攀锋高飞李成磊赵海霞
- 关键词：茉莉酸甲酯黄酮基因表达
- 苦荞黄酮醇合酶基因FtFLS4的克隆及其在大肠杆菌的表达被引量：1
- 2018年
- 【目的】克隆苦荞FtFLS4基因,深入研究其酶学活性。【方法】根据苦荞转录组数据克隆FtFLS4基因,对其进行生物信息学分析;构建原核表达载体pET-30b(+)-FtFLS4并在大肠杆菌BL21(DE3)中诱导表达,对表达产物进行活性鉴定。【结果】FtFLS4基因的cDNA为1 026 bp,编码341个氨基酸,编码蛋白具有属于α-ODD家族中黄酮醇合酶的结构特征,且其三维模型能与3种二氢黄酮醇底物进行分子对接;FtFLS4在大肠杆菌BL21(DE3)中实现可溶性表达,酶学分析表明该重组蛋白具有将二氢黄酮醇催化为黄酮醇的活性。【结论】克隆得到FtFLS4基因,实现其在大肠杆菌中有活性的表达。
- 李青青张润敏石冠蓝姚攀锋王晓丽李成磊
- 关键词：苦荞基因克隆原核表达活性鉴定
- 苦荞锌指蛋白基因FtLSD1的克隆及其对非生物胁迫的应答被引量：4
- 2015年
- 根据苦荞(Fagopyrum tataricum)花期转录组数据,分别以苦荞DNA和cDNA为模板,克隆得到1个苦荞C2C2型锌指蛋白基因FtLSD1(GenBank登录号KP252134)的DNA序列和cDNA序列,采用实时荧光定量PCR方法,研究了FtLSD1基因在非生物胁迫下的表达模式。结果显示:苦荞FtLSD1基因DNA全长2 427bp,由6个外显子和5个内含子构成,符合GU-AG剪切原则;cDNA序列包含一个528bp开放阅读框,编码175个氨基酸,具有LSD1家族的典型结构域;UV-B照射和水杨酸处理均能使FtLSD1基因的表达量上升,且UV-B处理在6h达到最大,为0h(CK)的3.84倍;水杨酸处理于10h达到最大,为0h(CK)的3.44倍,而4℃冷胁迫下该基因表达量保持稳定。推测该基因可能参与苦荞抗UV-B和高浓度水杨酸等非生物胁迫的应答反应,为苦荞的抗逆性研究提供新的视角。
- 高飞姚攀锋雒晓鹏李成磊吴琦姚慧鹏
- 关键词：苦荞基因克隆非生物胁迫
- 苦荞糖基转移酶基因的克隆及活性鉴定被引量：2
- 2016年
- 糖基化修饰在调控各种小分子的溶解度、稳定性及生物活性中具有重要的作用。该研究基于苦荞转录组数据,克隆获得2条糖基转移酶基因(FtUFGT4和FtUFGT5),并对其在大肠杆菌中的表达产物进行酶催活性鉴定。结果表明:(1)获得的苦荞糖基转移酶基因cDNA分别为1 434和1 470bp,其编码蛋白同属于拟南芥糖基转移酶E类群,可能参与黄酮类化合物的糖基化。(2)多重序列比对表明,FtUFGT4和FtUFGT5蛋白C端都具有PSPG框,其催化活性位点分别是H17和H16;FtUFGT4和FtUFGT5都是典型的植物糖基转移酶GT-B结构,二者的蛋白模型能与矢车菊素和UDP进行分子对接。(3)FtUFGT4和FtUFGT5在大肠杆菌中获得了可溶性表达,薄层层析实验表明二者均具有催化矢车菊素糖基化为矢车菊素-3-O-葡萄糖苷的活性。
- 李茂菲周婧姚攀锋赵学荣李成磊吴琦
- 关键词：苦荞基因克隆活性鉴定
- 苦荞WD40转录因子的基因克隆及其对花青素合成的影响
- 苦荞(Fagopyrum tataricum)是一种药食两用小杂粮,其主要生物活性物质是以黄酮醇和(原)花青素等为代表的黄酮类化合物.本课题组在前期已完成有关参与(原)花青素合成调控FtMYB转录因子和参与非生物胁迫Ft...
- 姚攀锋赵海霞李成磊陈惠姚慧鹏吴琦
- 关键词：苦荞转录因子
- 苦荞WD40转录因子的基因克隆及其对花青素合成的影响
- 苦荞(Fagopyrum tataricum)为蓼科荞麦属双子叶禾谷类作物。苦荞作为一种药食两用作物，其最重要的生物活性成分为黄酮，以芦丁为代表的黄酮醇是其主要储存形式。然而，在遭受冷和紫外等胁迫时，另外一类黄酮花青素的...
- 姚攀锋
- 关键词：苦荞基因克隆花青素合成工艺
- 文献传递
