邵志龙
- 作品数：2 被引量：10H指数：2
- 供职机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：江苏省基础研究计划国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 杨树PeAFB基因克隆及表达模式初步分析被引量：5
- 2015年
- 【目的】TIR1/AFB F-box作为生长素受体参与从生长素结合到Aux/IAA蛋白降解这一信号转导过程。通过克隆杨树AFB基因家族成员,并检测其在病原菌、激素和干旱胁迫下的表达模式,以期了解AFB基因在杨树生长发育及激素信号转导中的作用机制。【方法】以美洲黑杨杂种NL-895杨为材料,通过PCR与RACE技术,克隆NL-895杨AFB基因家族成员全长c DNA,进而利用在线分析软件和数据库对各成员编码蛋白质的理化参数、保守结构域、蛋白质三级结构进行分析和预测;根据氨基酸序列多重比对结果进行系统进化分析;采用实时定量PCR技术研究4个NL-895杨AFB基因家族成员在病原菌、激素和干旱胁迫下的表达模式。【结果】获得了4个NL-895杨AFB基因家族成员,分别命名为Pe AFB2-1,Pe AFB2-2,Pe AFB3和Pe AFB5,其全长c DNA分别为2 461,3 115,2 441,2 818 bp,对应的ORF分别为1 546,1 716,1 716,1 914 bp。4个Pe AFB蛋白亮氨酸含量均在10%以上,特别是Pe AFB2-1,高达13.4%,符合AFB蛋白质富含亮氨酸特征。氨基酸序列分析结果表明,Pe AFB家族成员均具有F-box蛋白特征,其N-端为典型的F-box结构域(IPR001810),还含有5个富含亮氨酸重复序列(LRR-rich repeat,IPR006553)。4个杨树AFB和其他模式植物TIR1/AFB F-box蛋白所构建系统发育树将47个AFB蛋白家族成员聚为4大类,4个杨树Pe AFB蛋白属于第Ⅰ类,并且与拟南芥的At AFB蛋白家族成员具有高度相似性。4个Pe AFB基因在茉莉酸甲酯(500μmol·L-1)、丁香假单胞菌DC3000和PEG(20%,m/V)等胁迫条件下,表达量均有不同程度的下调。【结论】本研究克隆了4个杨树Pe AFB家族成员,并揭示了其系统进化关系,基因表达分析表明4个Pe AFB基因在生物和非生物胁迫条件下,其表达量均有不同程度的下调,表明其可能参与了杨树对胁迫应答的负调控。
- 陈英邵志龙王浩然朱燕宇朱嵊黄敏仁
- 关键词：F-BOX蛋白胁迫应答
- ‘南林895’杨PdNAC1基因克隆及蛋白的亚细胞定位被引量：5
- 2015年
- 以‘南林895’杨（Populus deltoides×P．euramericana cv ‘Nanlin895’）为材料，通过RACE－PCR技术，获得了NAC1基因的全长cDNA，命名为PdNAC1。该序列含有1个长906 bp的开放阅读框，编码302个氨基酸。该蛋白的分子质量为34．23 ku，等电点为7．44。分析其氨基酸序列发现，该蛋白具有典型NAC转录因子特征，NAM结构域位于11-135个氨基酸之间，含有A、B、C、D、E 5个亚结构域，该区域可以结合DNA；而C端含有一个高度变异的转录激活区。利用杨树原生质体对PdNAC1蛋白进行细胞亚定位，结果发现PdNAC1不仅明显定位于细胞核中，而且在细胞膜上也有表达。但PdNAC1是否具有相应的跨膜结构域尚不明确。
- 王浩然邵志龙朱燕宇匡华琳黄敏仁陈英
- 关键词：NAC转录因子亚细胞定位
