徐晶宇
- 作品数：47 被引量：171H指数：7
- 供职机构：黑龙江八一农垦大学农学院更多>>
- 发文基金：黑龙江省自然科学基金国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学更多>>
- 玉米NRL基因家族鉴定与逆境表达分析被引量：1
- 2022年
- NRL(NPH3/RPT2-Like)是植物所特有的一类光响应蛋白,在向光素信号途径中发挥重要作用。利用生物信息学手段结合qRT-PCR技术,在玉米基因组水平对该家族基因进行鉴定并对其编码蛋白的性质、结构、进化、生育期组织表达和逆境表达进行分析。结果鉴定了31个ZmNRL基因,不均匀地分布于玉米9条染色体上,编码的氨基酸序列长度在464~749个,预测具有叶绿体、细胞核和细胞质等亚细胞定位。依据蛋白保守性将ZmNRL家族划分为四大类,基因结构也具有一定的保守性,多数基因含有4个外显子。基因启动子存在大量脱落酸、茉莉酸、光响应和抗氧化等顺式元件分析,其中G-box和Sp1等两类光相关元件数量较多。ZmNRL家族基因在生育期组织部位表达具有一定的时空特异性,总体表达量不高,仅有ZmNRL2、ZmNRL4、ZmNRL24和ZmNRL29相对高表达。通过生育期组织表达数据共表达及其模块GO富集分析发现,6个ZmNRL基因可通过叶绿体等生物发生及组装生物过程,参与对叶片生长发育的调控。qRT-PCR结果表明,高温处理玉米幼苗ZmNRL12上调表达显著,干旱、盐和病原物接种处理ZmNRL5、ZmNRL7和ZmNRL19基因下调表达。综上,在玉米基因组鉴定出31个ZmNRL基因,该家族基因不仅具有明显的组织表达特异性,而且可参与玉米幼苗对生物和非生物逆境应答。
- 赵长江都梦翔宋巨奇徐尚缘贺琳贺琳杨克军徐晶宇
- 关键词：玉米基因家族逆境胁迫
- 玉米低温响应NAC转录因子的分子特性分析被引量：2
- 2019年
- 利用Illumina HiSeq技术,分别构建5℃和22℃处理下的两个玉米叶组织转录组。从转录组数据中共分离出38条低温响应NAC基因,包括6条膜结合转录因子;38条NAC中30条为上调,8条为下调。38条ZmNACs被分为12个亚族(NAC a-1),其中,7条上调低温响应ZmNACs属于逆境相关亚家族(Stress related/NAC-h)。同一亚家族内,蛋白结构域和内含子/外显子结构相对保守。不同ZmNAC基因的在不同组织部位和发育阶段的表达模式有很大变化。许多重要的非生物胁迫相关元件在38条ZmNACs的启动子中高度富集。
- 边境徐晶宇赵长江于高波程殿君王帅奇王枫贺琳杨克军
- 关键词：玉米NAC生物信息学
- 蛋白质ZmNAC087在调控植物抗逆性中的应用
- 本发明公开了蛋白质ZmNAC087在调控植物抗逆性中的应用，蛋白质ZmNAC087的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。实验证明，在野生型拟南芥中过表达ZmNAC087基因可以提高拟南芥的抗旱性和抗寒性，抗旱性和抗寒...
- 贺琳徐晶宇杨克军赵长江王玉凤张翼飞王雪贺缘王浩宇高源
- 玉米盐碱响应基因ZmERF1和ZmERF2的分子特性分析被引量：1
- 2020年
- 乙烯响应因子(ERF)在植物不同发育过程和逆境反应中起重要作用。然而,在玉米中仅有少数关于ERF基因参与逆境的报道。研究集中对ZmERF1和ZmERF2两条玉米ERF基因展开研究。表达模式分析显示ZmERF1和ZmERF2在玉米根部都可以被盐碱胁迫诱导上调表达,且二者具有极为相似的表达模式。进化树分析显示ZmERF1和ZmERF2属于ERF-B4亚家族。此外,非生物逆境相关元件GCC-box、MBS、W-box、ARE、ABRE和LTR在ZmERF1和ZmERF2启动子中高度富集。这些结果表明ZmERF1和ZmERF2可以作为调节因子参与包括盐碱胁迫在内的多种非生物胁迫反应。研究结果有助于加深我们对玉米ERF基因家族的理解,为进一步的功能研究提供新线索。
- 程殿君郭耀祖吴庚锦边境徐晶宇李佐同贺琳
- 关键词：玉米ERF基因表达模式
- 玉米PLCs基因家族鉴定及表达谱分析被引量：6
- 2018年
- 磷脂酶C(phospholipase C,PLC)是一类能够水解磷脂的酶,作为磷脂酶家族中的一员,在调节植物生长及响应逆境胁迫中发挥重要作用。本文通过对ZmPLCs蛋白的系统发育、其基因结构及启动子中的逆境相关顺式作用元件数量,以及基因的组织特异性表达模式等生物信息学进行研究;并用NaHCO_3和低温处理玉米转录组数据,构建ZmPLCs基因表达谱。结果显示,在玉米基因组水平上共鉴定出9个玉米PLCs基因,基于玉米PLCs水解底物的不同,9个ZmPLCs基因被分为2个亚族,分别定位在玉米的1、2、3、5和9号染色体上。ZmPI-PLCs编码蛋白包含典型的X、Y和C_2结构域,ZmNPCs蛋白包含典型的磷酸酯酶结构域,ZmPLCs蛋白N端由延长链和螺旋结构组成,多定位于线粒体和叶绿体。ZmPLCs基因替换发现ZmPLCs家族可能是通过变异进行扩增的。在9个ZmPLCs基因启动子上包括脱落酸、盐和低温等激素和非生物胁迫相关元件高度富集,转录组数据分析ZmPI-PLC2和ZmNPC2上调响应Na HCO_3,ZmPI-PLC5和ZmNPC3上调响应低温,ZmPI-PLC3和ZmPI-PLC4与玉米根系发育有关,这与基因表达模式相印证,进一步表明玉米PLCs基因参与植物对多种非生物逆境的响应,以及作物对非生物抗性利用的潜在应用价值。
- 董洁静徐晶宇林俊俊贺琳贺琳李佐同
- 关键词：玉米PLC非生物逆境生物信息学
- 玉米KNOX基因家族鉴定及组织和逆境表达分析被引量：3
- 2021年
- 为揭示玉米转录因子KNOX家族基因功能,采用生物信息学手段在玉米基因组水平鉴定KNOX家族成员,并对家族基因逆境和组织表达谱进行分析。结果显示:(1)玉米基因组有22个ZmKNOX基因,根据其在染色体上的位置依次命名为ZmKNOX1-ZmKNOX22;编码蛋白质亚细胞定位预测发现,除ZmKNOX5、ZmKNOX11、ZmKNOX12和ZmKNOX15定位于线粒体以及ZmKNOX7定位于细胞质外,其余家族蛋白质均定位于细胞核;进化树分析表明,大多数ZmKNOX与高粱聚在一个分支,表明两物种系统发育关系较近,且基因结构与蛋白进化分类存在一定关联性。(2)全生育期组织表达分析发现,ZmKNOX具有不同的表达模式,且基因的生育期表达模式与蛋白进化分类具有一定相关性。其中ZmKNOX13、ZmKNOX20、ZmKNOX1和ZmKNOX21属全生育期组成型高表达,ZmKNOX3、ZmKNOX5、ZmKNOX6和ZmKNOX14为全生育期组成型低表达,而ZmKNOX4、ZmKNOX8、ZmKNOX9和ZmKNOX17-19的表达具有阶段性和组织特异性,并在胚胎、种子萌发时期、胚芽鞘、茎尖、茎节间、顶端分生组织和花序中较高表达;进一步对生育期数据进行共表达分析发现,ZmKNOX13所在的与根分生发育期相关性最高的模块,与蛋白质泛素化生物学过程密切相关。(3)在盐、冷、热和UV处理下,有8个ZmKNOX家族基因表现出不同的响应模式,但基因表达量变化不大。其中冷处理下ZmKNOX6表达明显上调,热处理下ZmKNOX14明显下调表达,盐胁迫下ZmKNOX13明显上调表达而ZmKNOX13和ZmKNOX14却明显下调,上述3个基因(除ZmKNOX13)均具有生育期低表达的特点。(4)测序数据分析发现,盐处理下叶片中上调的ZmKNOX3和ZmKNOX13基因,根系中下调的ZmKNOX3、ZmKNOX6和ZmKNOX17基因的表达模式基本一致,在不同处理时间ZmKNOX3在叶片和根中均稳定表达,但表达方式相反。研究表明,玉米ZmKNOX家族基因在玉米生长发育和逆境响应过程中具有重要作用。
- 赵长江宋巨奇都梦翔徐尚缘徐晶宇徐晶宇
- 关键词：玉米基因家族
- 一种玉米II型二酰基甘油酰基转移酶及编码该玉米II型DGAT的基因
- 一种玉米II型二酰基甘油酰基转移酶及编码该玉米II型DGAT的基因，它涉及一种玉米二酰基甘油酰基转移酶及编码该玉米二酰基甘油酰基转移酶的基因。本发明提供了一种玉米II型二酰基甘油酰基转移酶及编码该玉米II型DGAT的基因...
- 徐晶宇闫博巍李佐同许晓萱
- 文献传递
- 啶酰菌胺对向日葵核盘菌生物活性的影响被引量：6
- 2021年
- 旨在明确新型杀菌剂啶酰菌胺对向日葵核盘菌生物活性的影响,为其推广应用提供科学依据。以向日葵核盘菌菌丝、孢子和菌核为试材,采用生物测定方法测定啶酰菌胺对向日葵核盘菌菌丝生长、孢子萌发及菌核形成的影响。研究结果表明,啶酰菌胺处理后的核盘菌菌丝生长速率受到抑制,其抑制菌丝生长的EC50为0.2152μg/mL。随杀菌剂浓度的升高,核盘菌菌丝生长量明显下降,浓度为16.667μg/mL时,对核盘菌形成菌核数量的抑制率达到84.62%,对核盘菌形成菌核总干重的抑制率达到61.07%。孢子萌发试验结果表明,啶酰菌胺处理后子囊孢子萌发受到抑制,其抑制子囊孢子萌发的EC50为0.056μg/mL。在浓度为0.267μg/mL时,孢子芽管伸长抑制率达到78.15%。啶酰菌胺不仅对核盘菌菌丝生长有抑制作用,还可以降低子囊孢子的侵入、阻止子囊孢子萌发形成的芽管在植物组织的继续侵染,有效降低田间土壤中菌核残留量。对向日葵菌核病的防治前景十分广阔,可以作为田间防治向日葵菌核病的轮换药剂。
- 张海洋李海燕孟庆林何超群潘文瀚徐晶宇
- 关键词：向日葵菌核病啶酰菌胺核盘菌菌丝生长孢子萌发
- 木薯普通花叶病毒侵染性克隆及GFP表达载体的构建与分析
- 2022年
- 木薯普通花叶病毒(Cassava common mosaic virus,CsCMV)(Potexvirus属,Alphaflexiviridae科)是新发现的一种潜在威胁木薯产业的病毒。本研究以前期在中国首次报道发现的CsCMV海南儋州Hainan-DZ分离物(CsCMV-HN)为基础,利用In-Fusion无缝克隆将CsCMV-HN全长cDNA片段克隆到植物表达载体pGreenII-35S上,构建其全长cDNA侵染性克隆pCsCMV-HN。通过农杆菌介导法将侵染性克隆pCsCMV-HN注射接种本生烟,接种10 d后开始出现褪绿及叶皱缩等症状,经RT-PCR检测和病症观察统计,侵染效率达100%。在此基础上,采用90 bp重复的CP亚基因组启动子(subgenomic RNA promoter,SGP)策略构建其携带gfp报告基因的病毒表达载体pCsCMV-GFP,农杆菌注射接种本生烟7~10 d后,在紫外灯下可观察到非接种叶有较强的绿色荧光,RT-PCR检测和Western blot分析表明pCsCMV-GFP可在本生烟上系统性表达GFP。本研究成功构建的CsCMV侵染性克隆及GFP表达载体将为进一步研究该病毒基因功能及致病机制提供借鉴。
- 俞春烨庹德财沈文涛言普黎小瑛周鹏周鹏
- 关键词：侵染性克隆绿色荧光蛋白
- 增强UV-B辐射对立枯丝核菌抗氧化酶及细胞壁降解酶活性影响研究
- 2021年
- 作为太阳光谱的一部分,到达地球表面的UV-B辐射有逐渐增加的趋势,影响地球生态系统。为揭示增强UV-B辐射对立枯丝核菌的影响,本文采用UV-B灯辐照处理病菌菌丝,并对菌丝生长、菌核形成,活性氧稳态和细胞壁降解酶进行分析。结果表明,增强UV-B辐射可导致供试菌株菌丝生长抑制、刺激菌核提早形成。处理菌株O^(■)_(2)和H_(2)O_(2)的含量随处理时间的延长呈现不同程度的增加,其中U60处理较对照分别增加132.3%和71.3%;尽管SOD、APX、POD和CAT抗氧化酶活性也随处理时间增加而显著增强,但菌株MDA含量依然显著逐渐增加。同时,立枯丝核菌纤维素酶Cx、FPA的活性以及PG、PMG的活性均随辐射处理时间的延长而下降。此外,UV-B辐射处理菌株对高粱幼苗致病表型减弱。综上所述,增强的UV-B辐射打破立枯丝核菌体内活性氧稳态平衡,致使菌丝生长受到抑制,细胞壁降解酶活性降低,从而影响病菌致病性。
- 赵长江郭怀刚徐晶宇徐晶宇
- 关键词：UV-B立枯丝核菌菌丝细胞壁降解酶
