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中药对环境内分泌干扰物染毒大鼠下丘脑GnRH及其受体、垂体GH、FSH、LHmRNA和蛋白表达的影响: 2010年; 乔丽丽孙春美沈伟勤樊志荣张小丽; 关键词：蛋白表达滋阴泻火环境内分泌干扰物垂体医院中药制剂

应用基因集富集分析和加权基因共表达网络分析挖掘支气管肺发育不良的关键基因: 2023年; 目的挖掘与支气管肺发育不良(BPD)密切相关的hub基因,为揭示BPD发病机制提供理论依据。方法从高通量基因表达(GEO)数据库获取BPD患儿的血mRNA数据集GSE32472、GSE108756、GSE189582基因表达矩阵,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出关键模块,通过GO、KEGG功能富集和GSEA分析获取关键模块基因参与的生物学过程。将GSE32472关键模块基因与GSE108756差异表达基因取交集后得出hub基因,再经受试者工作特征曲线(ROC)联合Logistic回归分析后得出与BPD关系密切的3个hub基因,验证这3个hub基因在外部数据集GSE189582中的诊断效能。结果WGCNA分析得出GSE32472中与BPD最密切相关的red模块共370个基因,GO分析集中在细胞因子介导信号通路、白细胞迁移及趋化、中性粒细胞激活、免疫受体等生物学功能。GSEA发现BPD组主要集中在免疫相关的分泌颗粒、三级颗粒、分泌囊泡的信号转导上。KEGG富集在病毒相关的细胞因子受体交互信号通路、雌激素信号通路、糖代谢相关的信号通路。red模块基因与GSE108756中201个差异表达基因取交集后的ROC结果显示3个hub基因(IL1R2、ADM、FPR2)对诊断BPD具有良好的特异度和敏感度,曲线下面积(AUC)均>0.7。IL1R2、ADM、FPR2对诊断BPD的OR值达到1.70、2.16、2.47(均P<0.05)。3个hub基因构建的逻辑回归模型在GSE189582中绘制出的ROC曲线AUC达到0.882。结论通过构建基因共表达调控网络筛选出3个hub基因,可能成为潜在的BPD基因生物标志物,为揭示BPD发病机制奠定一定的理论基础。; 胡诤贇史建伟张灵凤张涛陈曦孙春美; 关键词：支气管肺发育不良 ROC曲线 LOGISTIC模型

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孙春美

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