张晓斌
- 作品数：9 被引量：22H指数：3
- 供职机构：扬州大学信息工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省自然科学基金江苏省教育厅自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 基于序列化及压缩的网格数据传输性能改进被引量：6
- 2008年
- 为了减少序列化产生的数据量,以基于网格的PDE.Mart为实验平台,使用APACHE AXIS,研究AXIS的不同服务类型,比较压缩前后直接SOAP序列化、Base64序列化以及字节流序列化后的网络传输数据量,提出一种二进制序列化与压缩相结合的方案,减少生成的消息数据,从而提高数据传输性能,使网格计算平台能适应较大规模数据的求解。
- 毛国勇张晓斌张武
- 关键词：序列化网络服务
- 云环境下基于二进制编码聚类的并行频繁项集挖掘算法
- 本文提出了一种云环境下基于二进制编码的并行频繁项集挖掘算法,利用一种特殊的二进制编码的依赖度计量方法对原始数据集合进行编码转换及依赖度聚类,然后将数据集分布部署在云环境中,并采用共享多头表的FP-Growth并行改进算法...
- 刘博李云张晓斌徐杰
- 关键词：依赖度二进制编码
- 文献传递
- 生物医学大数据处理的云计算解决方案被引量：10
- 2014年
- 随着二代测序、质谱分析、医学影像等生物医学技术的发展和应用,生物医学数据呈现爆炸性增长趋势,其处理面临数据量大、计算强度大、维度高等问题。云计算在资源分配、数据存储、计算、共享等方面具有优势,能够帮助解决生物医学大数据处理的相关问题。深入分析了云计算在生物医学大数据处理方面的特点,归纳总结了常见的生物云计算解决方案,对生物云计算的发展和挑战进行了展望。有望建立能够整合多源生物医学数据的新型计算方法,以解决复杂的生物医学问题。
- 孙磊胡学龙张晓斌李云
- 关键词：生物医学技术医学影像大数据云计算
- 基于垂直FP树的并行频繁项集挖掘
- 随着数据量的快速增长、数据存储的分散化程度不断提高.对并行分布式数据挖掘算法的需求越来越迫切.文章提出了一种基于垂直FP树的分布式频繁项集挖掘算法DVFP.DVFP采用一种称为垂直FP树(VFP)的格式来存放数据，并同时...
- 徐杰李云刘博张晓斌
- 关键词：频繁项集挖掘并行计算分布式计算
- 面向生物信息学的网格问题求解平台被引量：2
- 2010年
- 为了高效地整合互联网上各种分布式异构生物信息学资源,基于Web Service的生物信息学问题求解平台PSE-Bio使用统一的客户端生成器,便于加入多个以网络服务描述语言形式提供的生物信息学服务。PSE-Bio通过Java本地接口技术包装其自有的以及网络中开源的生物网络比对算法,并将其发布为Web服务,通过PSE-Agent实现对资源的有效管理,用SVG与AJAX实现交互式可视化。PSE-Bio基于浏览器完成任务提交、任务返回和结果可视化等任务,具有良好的易用性和可扩展性。
- 毛国勇张晓斌谢江
- 关键词：WEB服务生物信息学可视化
- 基于Linux的长非编码RNA信息系统
- 2016年
- 长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)已成为生物信息学研究领域的热点,涉及lncRNA基因注释、结构预测、功能和机制等研究方向。研究也产生了大量分布零散的lncRNA信息(包括lncRNA知识、研究方法和数据库等),而现有的lncRNA信息平台功能单一,缺乏对信息资源的整合。针对这一问题,文章建立基于Linux的lncRNA信息系统。该系统主要由数据库模块、网页服务模块和软件工具模块等3部分构成。基于此架构,系统通过由lncRNA知识、GBrowse浏览器、分析和计算、工具信息和数据库信息等页面向网络用户提供信息服务。测试结果表明,系统能够提供lncRNA知识的展示、数据可视化、预测和转录分析、常用的工具和数据库信息等服务。该系统能有效整合lncRNA研究相关的多源信息,进而提高lncRNA研究的效率。
- 孙磊马宏辉王诗佳张晓斌李云胡学龙
- 关键词：信息系统数据库数据可视化
- 云环境下基于二进制编码聚类的并行频繁项集挖掘算法被引量：1
- 2012年
- 本文提出了一种云环境下基于二进制编码的并行频繁项集挖掘算法,利用一种特殊的二进制编码的依赖度计量方法对原始数据集合进行编码转换及依赖度聚类,然后将数据集分布部署在云环境中,并采用共享多头表的FP-Growth并行改进算法挖掘频繁项集.实验表明,对于大规模数据集来说,本文算法可以取得良好的性能.
- 刘博李云张晓斌徐杰
- 关键词：云计算二进制编码聚类频繁项集
- 基于Web的PSE-Bio交互式可视化被引量：1
- 2010年
- PSE-Bio是一个基于Web服务面向生物信息学的问题求解平台。为了方便用户仅使用浏览器就能分析调用服务返回的结果,采用SVG技术实现基于WEB的可视化,设计了面向对象的统一可视化数据对象以封装调用不同Web服务返回的消息;设计了面向对象的可视化图形对象以利于交互可视化的实现;并用SVG脚本语言实现了用户与图形的交互以及可视化结果与服务的交互。实验结果表明,基于SVG的可视化方案能够满足生物信息数据的Web可视化需求。
- 毛国勇张晓斌谢江
- 关键词：可视化WEB
- 基于垂直FP树的并行频繁项集挖掘被引量：3
- 2012年
- 随着数据量的快速增长、数据存储的分散化程度不断提高,对并行分布式数据挖掘算法的需求越来越迫切。文章提出了一种基于垂直FP树的分布式频繁项集挖掘算法DVFP。DVFP采用一种称为垂直FP树(VFP)的格式来存放数据,并同时采用数据并行和任务并行的策略。文章还提出了一种新的序列化方法来对VFP树进行编码,大大减少了处理节点间的通信开销。实验验证DVFP算法在灵活性和处理时间上与现有的分布式算法相比具有较大优势。
- 徐杰李云刘博张晓斌
- 关键词：频繁项集挖掘并行计算分布式计算
