蒋思宇
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 供职机构：大连理工大学化工学院(石油化工学院)更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生化学工程更多>>
- 三嗪环的生产工艺综述
- 2015年
- 三嗪环(Thiotriazinone)在医药及农药合成中有着广泛的用途,是制备半合成头孢曲松等药物的重要中间体。文章综述了国内外三嗪环的生产情况、工艺、应用和发展前景,并且对三嗪环的生产进行了简单的工艺设计,其中也提供了一些新的数据参考,对今后三嗪环的大规模工业化生产有一定的指导意义。
- 林峰王艳红李燕蒋思宇
- 关键词：三嗪环
- 3C-like蛋白酶抑制剂的构效关系、分子对接和分子动力学被引量：5
- 2016年
- 3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-Co V)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-Co V同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-Co V)的43个肽类3C-like蛋白酶抑制剂分子,建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。在基于配体叠合的基础上,发现比较分子相似性指数分析法(Co MSIA)中的四个场组合(位阻场、静电场、氢键供体场与氢键受体场)为最优的模型(Q2=0.522,R2ncv=0.996,R2pre=0.904;Q2:交叉验证相关系数,R2ncv:非交叉验证相关系数,R2pre:验证集分子的预测值相关系数),并借助该模型通过分子对接(docking)与分子动力学(MD)方法阐明了配受体结合作用。实验结果表明:(1)基于最优的Co MSIA模型基础上的三维等势图形象地说明了分子基团的位阻作用、静电作用、氢键供体与氢键受体作用对分子生物活性的影响;(2)分子对接研究结果显示了疏水性以及结晶水、氨基酸His166和Glu169在配体和受体结合过程中产生重要作用;(3)分子动力学模拟进一步验证了分子对接模型的可靠性,并发现了两个新的关键氨基酸Ser24与Gln192,它们与配体产生了两个较强的氢键。此外,根据这些结果,一些新的具有潜在抑制活性的肽类化合物作为3C-like蛋白酶抑制剂被获得。以上结果能够帮助深入了解3C-like蛋白酶与肽类抑制剂的作用机理,并且能够为今后的抗MERS-Co V药物设计提供有价值的参考。
- 林峰付新梅王超蒋思宇王景辉张述伟杨凌李燕
- 关键词：三维定量构效关系分子对接分子动力学
