王宇哲
- 作品数:31 被引量:1H指数:1
- 供职机构:中国农业大学更多>>
- 相关领域:农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 全基因组SNP分型策略及基因组选择在畜禽中的应用
- 2023年
- 基因组选择技术是利用覆盖全基因组的遗传标记进行个体基因组育种值的估计。单核苷酸多态性标记(Single nucleotide polymorphisms,SNP)被广泛应用于各遗传学领域。近年来,各种全基因组SNP标记开发方法的发展使得研究者们能够以低成本获得大量遗传标记,推动了基因组选择技术的发展。该文综述了三种主要的全基因组SNP分型策略,并总结了基因组选择技术在不同畜禽动物育种中的应用情况,同时展望了其未来发展前景,以期为基因组选择过程中选择合适的SNP分型策略提供借鉴和参考。
- 王亦秋姜自琴王宇哲徐振强胡晓湘
- 关键词:单核苷酸多态性基因分型畜禽
- 全基因组关联分析鉴定太行鸡产蛋性状功能基因
- 2023年
- 鸡蛋是人类重要的蛋白质来源,产蛋性状是鸡重要的经济性状,鉴定鸡产蛋性状相关的重要功能位点对于蛋鸡育种意义重大。本研究采集了1 100只太行鸡样本,记录其产蛋数和开产日龄2个表型,使用目前在农业动物中广泛应用的低深度重测序技术对全部样本进行基因分型。本研究共鉴定到覆盖全基因组的680万个单核苷酸多态性位点。针对产蛋数性状和开产日龄性状分别进行方差组分估计和全基因组关联分析,遗传力估计结果显示2个性状的遗传力均较低,其中开产日龄估计遗传力为0.155,产蛋数估计遗传力为0.102。在全基因组关联分析中发现了影响开产日龄的4个候选主效基因CPD、ENSGALG00000007646、ENSGALG00000007656和CDX4,以及16个SNP标记。通过功能富集分析鉴定到了细胞黏附和细胞膜相关通路、质膜钙信号通路以及磷脂酰肌醇信号通路等在产蛋数性状中发挥的重要作用。本研究为太行鸡产蛋相关性状选育提供了重要的分子标记,为下一步的保种育种工作奠定了基础。
- 朱迪谢艳华王宇哲刘华格褚素欣褚素乔
- 关键词:产蛋性状全基因组关联分析
- 一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法
- 本发明属于基因工程技术领域,提供了一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计...
- 胡晓湘王宇哲曹学敏李宁
- 文献传递
- 一种鸡屠宰率性状育种80K SNP测序分型芯片及应用
- 本发明涉及一种鸡屠宰率性状育种80K SNP测序分型芯片及应用。本发明利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡屠宰率性状相关的功能标记信息,极大剔除了测序数据信息中的噪音位点,同时保留与鸡屠宰率性状...
- 胡晓湘王宇哲朱迪吴寒宇李宁
- 一种鸡屠体重性状育种17K SNP测序分型芯片及应用
- 本发明涉及一种鸡屠体重性状育种17K SNP测序分型芯片及应用。本发明技术区别于传统的固相芯片和基于测序的“液相芯片”原理,利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡屠体重相关的功能标记信息,极大剔除...
- 吴寒宇王宇哲胡晓湘朱迪李宁
- 一种鸡开产日龄性状育种15K SNP测序分型芯片及应用
- 本发明涉及一种鸡开产日龄性状育种15K SNP测序分型芯片及应用。本发明利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡开产日龄相关的功能标记信息,极大剔除了测序数据信息中的噪音位点,同时保留与开产日龄相关...
- 王宇哲胡晓湘朱迪李宁
- 与鸡体重性状相关的单倍型分子标记及应用
- 本发明公开了与鸡体重性状相关的单倍型分子标记及应用。所述单倍型分子标记由SNP1~SNP6共6个SNP位点组成,所述6个SNP位点位于鸡1号染色体末端169.195~169.209Mb范围内。本发明的单倍型分子标记用于区...
- 王宇哲胡晓湘曹学敏罗成龙李宁高菲
- 文献传递
- 一种鸡91日龄体重性状育种7K SNP测序分型芯片及应用
- 本发明涉及一种鸡91日龄体重性状育种7K SNP测序分型芯片及应用。本发明利用大规模低深度全基因组重测序技术得到的遗传标记特异性筛选与鸡91日龄体重相关的功能标记信息,极大剔除了测序数据信息中的噪音位点,同时保留与鸡91...
- 胡晓湘王宇哲朱迪吴寒宇李宁
- 实验室里的鸡家族
- 2015年
- 鸡不仅在生活中与人们有着密切的联系,也是最早进入实验室的模式动物之一,是禽类乃至脊椎动物研究的模式生物,在遗传学研究、畜牧业养殖、人类疾病研究等方面发挥着举足轻重的作用。
- 王宇哲
- 关键词:实验室家族模式动物模式生物脊椎动物人类疾病
- 基于SNP位点数据的系谱推断方法、装置及电子设备
- 本发明涉及基于SNP位点数据的系谱推断方法、装置、电子设备及存储介质,该方法包括:获取待构建基因组系谱的育种群体及所述育种群体中每个个体的SNP数据;在所述育种群体中,基于每个目标子代样本与候选亲本的SNP数据,使用亲子...
- 王宇哲朱迪胡晓湘吴寒宇