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miR-199a-3p靶基因预测及生物信息学分析被引量：6: 2016年; 目的为深入研究miR-199a-3p在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析miR-199a-3p序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析;构建TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果 miR-199a-3p序列在多物种间具有高度保守性;GO分析发现miR-199a-3p的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P<0.01);KEGG Pathway分析发现miR-199a-3p的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM受体的相互作用通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等;根据构建的TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受miR-199a-3p调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论 miR-199a-3p可能通过直接靶向作用mTOR,调节PI3K-Akt-mTOR信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。; 谢小娟潘晶晶魏力强陈葳; 关键词：生物信息学 MTOR PI3K-AKT MAPK 蛋白聚糖

长链非编码RNA UCA1与miRNA-99b在膀胱癌细胞株和膀胱癌组织表达的相关性分析被引量：7: 2015年; 目的:验证LncRNA UCA1与miRNA-99b的相关性。方法:采用荧光定量PCR法检测UCA1和miRNA-99b在过表达和敲低表达UCA1的膀胱癌细胞、膀胱癌组织中的表达。结果:在敲低UCA1表达的膀胱癌细胞5637中,UCA1表达下调60%,而miRNA-99b的表达上调250%;在过表达UCA1的膀胱癌细胞UMUC2中,UCA1表达上调410%,而miRNA-99b的表达下调60%;UCA1在膀胱癌中的表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05),而miRNA-99b在膀胱癌中的表达水平明显低于癌旁组织(P<0.05);UCA1与miRNA-99b在膀胱癌组织中的表达呈负相关(R=-0.502,P<0.05)。结论:UCA1负向调节miRNA-99b的表达,但是它对miRNA-99b的调节在膀胱癌发生发展中的作用机制还需深入研究。; 谢小娟潘晶晶侯慧莲李旭陈葳; 关键词：膀胱肿瘤

UCA1与keratin 10结合对膀胱癌发展的影响: 目的筛选lncRNA UCA1相互作用的蛋白,揭示UCA1在膀胱癌发展中的功能机制.方法体外转录获得地高辛标记的lncRNA-UCA1,通过反RNA Pull-down实验,结合质谱分析获得与UCA1相互作用的蛋白....; 吴守振潘晶晶薛梅丁禄陈葳李旭; 关键词：角蛋白10 膀胱癌 AKT

膀胱癌细胞来源外泌体的提取与鉴定被引量：3: 2017年; 目的:提取并鉴定膀胱癌5637细胞来源外泌体。方法:收集膀胱癌5637细胞培养上清液,采用多步骤离心法提取膀胱癌5637细胞外泌体。透射电子显微镜观察外泌体形态及颗粒直径。Bradford法定量外泌体蛋白含量。蛋白质免疫印迹鉴定外泌体标志蛋白。结果:20 m L 5637细胞培养基可收集约50-80μg外泌体。膀胱癌5637细胞来源外泌体呈典型的茶杯样形态,外泌体颗粒直径大约在30-150 nm。膀胱癌5637细胞外泌体提取物中可检测到标志蛋白CD63、TSG101、Hsp70和Hsp90表达。结论:多步骤离心法可以用于提取膀胱癌5637细胞外泌体,为后续开展膀胱癌5637细胞外泌体作用与机制的研究奠定了基础。; 薛梅陈葳向安潘晶晶庞欢李旭; 关键词：膀胱癌细胞外泌体离心

miRNA-148a 在膀胱癌组织中的表达及生物信息学分析被引量：5: 2015年; 目的：探索 miRNA-148a 在膀胱癌发生发展中的作用。方法收集35例膀胱癌组织和16例非癌组织，采用荧光定量 PCR 方法检测 miRNA-148a 的相对表达量，并分析其与临床特征的相关性；采用生物信息学分析，预测 miRNA-148a的靶基因和转录因子，构建 TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图，并对其靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析。结果miRNA-148a 在膀胱癌中的相对表达量（0.0008±0.0002）明显低于非癌组织（0.0021±0.0005）（t＝2.46，P ＜0.05），其相对表达量在不同性别、年龄、病理分级、临床分期、淋巴结转移组的差异无统计学意义（P ＞0.05）。3个软件都预测到的 miRNA-148a 靶基因268个；预测到 miRNA-148a 的转录因子60个，结合评分＞80的结合位点657个；对268个靶基因进行 GO 富集分析，发现其靶基因主要涉及神经细胞分化、发育、增殖、mRNA 合成，蛋白连接等众多的生物学过程（P ＜0.001，相对于背景具有统计意义）；KEGG Pathway 分析发现268个靶基因参与 p53，恶性肿瘤、前列腺癌、PI3K-AKT 等信号通路（P ＜0.05，相对于背景具有统计意义）；根据构建的 TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图，挖掘出可能调控 miRNA-148a 的转录因子有 SP1，ESR1，AP1，MYC，BRCA1等；可能受 miRNA-148a 调控的基因有 IGF1，P27 kip1，NCOA1，PTEN， SERPINE1等。结论miRNA-148a 在膀胱癌中表达下调，可能参与膀胱癌的发生发展，生物信息学分析为后续研究提供一定的思路。; 谢小娟朱娜潘晶晶魏力强陈葳; 关键词：膀胱癌生物信息学

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