张晓飞
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 供职机构：华中师范大学数学与统计学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- 基因调控网络的边预测被引量：2
- 2015年
- 为构建基因调控网络,提出了一个基于基因表达水平和网络反传递的算法.该算法用网络反传递思想来分析由传统相关性计算方法产生的间接效果,并考虑了调控网络的稀疏性,在模型算法中加入了控制网络稀疏性的l_1范数惩罚项.在大肠杆菌实验数据上测试该算法,这种方法提高了相关性分析对调控网络中边的预测能力,皮尔逊相关系数提高了6.42%,斯皮尔曼相关系数提高了5.92%,互信息提高了9.35%.总的来说,这个模型为修饰大量系统的相关性数据提供一种新思路,可以应用到网络边的预测和推断生物网络的控制动力学中.
- 黎妍张晓飞易鸣刘妍岩
- 关键词：基因调控网络斯皮尔曼等级相关系数
- 组织特异性蛋白质复合体的识别
- 2017年
- 本文研究了组织特异性蛋白质复合体的识别问题.利用蛋白质相互作用网络数据以及组织特异性基因表达数据构建组织特异性蛋白网络,利用多种代表性聚类算法对该网络进行聚类,并利用非负矩阵分解对聚类结果进行合并聚类,得到了组织特异性蛋白质复合体.结果表明,聚类效果得到明显提升,并且能识别出组织特异性蛋白质复合体.
- 丁霞张晓飞易鸣
- 关键词：蛋白质相互作用网络组织特异性非负矩阵分解
