孙小芹
- 作品数：49 被引量：50H指数：4
- 供职机构：中国科学院植物研究所更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金国家科技基础性工作专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生化学工程更多>>
- 一种甜薯茎尖离体快速繁殖的方法
- 本发明公开了一种甜薯茎尖离体快速繁殖的方法。通过离体培养甜薯的成熟幼嫩的茎尖，筛选出了最佳实验条件，建立了甜薯组织培养的最佳快速繁殖体系，可以得出诱导出芽培养基中最佳激素浓度是NAA？0.1？mg/L+KT？2.0？mg...
- 孙小芹李定红杭悦宇
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- 一种农杆菌介导的诸葛菜转基因方法
- 本发明公开了一种农杆菌介导的诸葛菜转基因方法。当诸葛菜的主枝和部分侧枝现蕾并有几朵小花开放时，去除主花序和每个分枝花序已开放的花朵，只留下花蕾；将含有表达载体的农杆菌用渗透培养基悬浮，渗透培养基中含有表面活性剂Silwe...
- 孙小芹杭悦宇张艳梅
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- 鉴别太仓白蒜的分子特异性标记引物及方法
- 本发明公开了一种用于鉴定太仓白蒜的分子鉴别方法和引物。该方法是提取待鉴定样品DNA后，利用一对序列分别如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的特异性分子标记SCAR引物，通过常规的PCR方法进行扩增，并进行...
- 陈闽杭悦宇张艳梅孙小芹薛佳宇
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- 十字花科植物芥酸合成基因FAE1-closest的克隆及功能分析
- 2023年
- 对十字花科(Brassicaceae)中具代表性的高、低芥酸植物的FAE1-closest基因进行扩增,并对其编码的氨基酸序列进行序列比对;基于FAE1-closest氨基酸序列构建遗传关系树;将具有代表性的FAE1-closest基因在酵母中进行转化,比较不同植物来源的该基因调控芥酸合成能力的差异。结果显示:十字花科高、低芥酸植物FAE1-closest基因编码的氨基酸序列主要有A和B 2种类型,其对应的编码区全长分别约为1461和1389 bp,且B类型的氨基酸序列仅出现在高芥酸植物中;比较氨基酸序列的变异位点发现,高、低芥酸植物中共存在150个变异位点,高芥酸植物中第320位的氨基酸为赖氨酸(K),低芥酸植物中该位点为苏氨酸(T)。遗传关系树显示:12种芥酸植物可聚为Ⅰ和Ⅱ2个分支,大部分高芥酸植物的FAE1-closest氨基酸序列聚在分支Ⅰ;高芥酸植物银扇草(Lunaria annua Linn.)以及低芥酸植物涩荠〔Malcolmia africana(Linn.)R.Br.〕、鸟头荠〔Euclidium syriacum(Linn.)R.Br.〕和四齿芥〔Tetracme quadricornis(Stephan)Bunge〕的FAE1-closest氨基酸序列聚在分支Ⅱ。酵母转化实验结果显示:蔓菁(Brassica rapa Linn.)和洋基芥(Brassica tournefortii Gouan)的FAE1-closest基因转酵母产物中检测到了芥酸,涩荠、鸟头荠、四齿芥和银扇草的FAE1-closest基因转酵母产物中均未检测到芥酸,说明只有部分十字花科植物的FAE1-closest基因与芥酸合成相关。综上所述,低芥酸植物来源的FAE1-closest基因均不能合成芥酸,部分高芥酸植物来源的FAE1-closest基因能合成芥酸,不同十字花科植物中的FAE1-closest基因在芥酸合成过程中发挥作用的程度不同;FAE1-closest基因是否为芥酸合成过程中的主效基因,有待进一步验证。
- 王月薛佳宇周广灿杭悦宇孙小芹
- 关键词：十字花科芥酸克隆功能分析
- 一种甜薯茎段离体快速繁殖的方法
- 本发明公开了一种甜薯茎段离体快速繁殖的方法。通过离体培养甜薯的成熟幼嫩的单节茎段，筛选出了最佳实验条件，建立了甜薯组织培养的最佳快速繁殖体系，可以得出诱导培养基中最佳激素浓度是AD 0.8mg/L，继代培养基最佳激素浓度...
- 孙小芹李定红杭悦宇
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- 基于AOX1和MCM5基因水芹地方品种的遗传关系分析及‘玉祁红芹’ISSR-SCAR标记建立
- 2021年
- 基于低拷贝核基因AOX1和MCM5的扩增结果,对采自南京的水芹〔Oenanthe javanica(Bl.)DC.〕野生种和太湖流域6个地方品种进行了遗传多样性分析,并基于ISSR标记开发了两步法鉴定‘玉祁红芹’(‘Yuqihongqin’)的SCAR标记。结果显示:水芹6个地方品种的AOX1基因中检测到22个SNP位点和7个InDel位点;MCM5基因中检测到33个SNP位点,其中3个位于编码区且均为同义突变,还有1个位于非编码区的InDel位点。与MCM5基因相比,AOX1基因提供的信息位点更多,基于AOX1基因构建的水芹野生种和6个地方品种的ML遗传关系树的支持率相对较高;其中‘玉祁红芹’、‘苏州圆叶芹’(‘Suzhouyuanyeqin’)和‘梅南水芹’(‘Meinanshuiqin’)的遗传关系较近,而‘常熟白芹’(‘Changshubaiqin’)、‘溧阳白芹’(‘Liyangbaiqin’)和‘江阴青芹’(‘Jiangyinqingqin’)的遗传关系较近。基于ISSR-880引物扩增得到‘溧阳白芹’的特异性片段,设计的第1对SCAR引物鉴定出‘玉祁红芹’和‘溧阳白芹’2个地方品种,再利用ISSR-836引物扩增得到‘玉祁红芹’特异性片段,设计的第2对SCAR引物在‘玉祁红芹’所有单株中扩增出特异性条带,而在‘溧阳白芹’所有单株中均未出现此条带。本研究开发的两步法鉴别‘玉祁红芹’的ISSR-SCAR标记可为水芹其他地方品种的鉴定、保存和利用提供参考。
- 王月刘佳陈闽张艳梅孙小芹杭悦宇周广灿
- 关键词：水芹
- 中国野芥菜群体的遗传多样性分析
- 野芥菜是十字花科芸薹属一年或两年生植物,广泛分布于中国的16个省份,是农田、荒地和路边常见的夏收作物恶性杂草,严重危害多种农作物的产量。为分析其传播路径及有效阻击该杂草的扩散蔓延,本研究利用11对多态性的微卫星引物对21...
- 李密密李莹孙小芹杭悦宇
- 关键词：十字花科微卫星
- 甜薯脱毒苗快速繁殖技术被引量：1
- 2020年
- 以甜薯的茎尖和单节茎段为试验材料,研究不同浓度激素组合对甜薯不定芽及再生植株的影响,从而建立一套甜薯快速繁殖体系。结果表明,茎尖诱导出芽最佳培养基为MS+NAA 0.1 mg/L+KT 2.0 mg/L,单节茎段诱导的最佳培养基为MS+AD 0.8 mg/L,增殖最佳培养基为MS+NAA 0.5 mg/L+KT 2.0 mg/L,生根最佳培养基为MS+IBA 2.0 mg/L。该方法能够提高甜薯繁殖系数,提高甜薯品质与产量,为甜薯产业化生产提供了理论依据和实践指导。
- 吴凡陈闽刘佳张艳梅孙小芹
- 关键词：脱毒苗茎尖快速繁殖技术
- 薯蓣茎生珠芽发生相关的转录组和PEBP家族基因表达特性分析被引量：1
- 2021年
- 以薯蓣(Dioscorea polystachya Turcz.)的具茎生珠芽品种‘铁棍山药’(‘Tiegun’)和无茎生珠芽品种‘花籽山药’(‘Huazi’)为研究对象,采集‘铁棍山药’具茎生珠芽、茎基部无茎生珠芽和茎上部无茎生珠芽的叶腋部位以及‘花籽山药’的叶腋部位4组样品进行转录组测序,并以‘铁棍山药’不同发育期茎生珠芽的叶腋部位为样品进行qRT-PCR分析,以期明确与薯蓣茎生珠芽发生相关的调控基因。结果显示:从2个品种不同部位的4组样品中共获得77981个All-unigenes,长度主要集中于300~3000 bp,占总量的99.44%;All-unigenes的平均长度为1050 bp,N50值为1764 bp,GC含量为42.66%;转录组unigenes与油棕(Elaeis guineensis Jacq.)和海枣(Phoenix dactylifera Linn.)的同源性较高。对具茎生珠芽叶腋样品与3组无茎生珠芽叶腋样品的差异unigenes进行功能注释和表达量比较。结果显示:经过GO注释分析,3组转录组分别有6098、8840和9141个差异unigenes注释在细胞组分、分子功能和生物过程3大类43个亚类中,其中,注释在代谢过程亚类的差异unigenes数分别占对应注释unigenes总数的10.6%、10.5%和10.7%;3组转录组分别有11182、13552和15918个差异unigenes注释在KEGG代谢通路,且主要集中在代谢和遗传信息处理;表达量均上调的unigenes有3531个,表达量均下调的unigenes有1084个;在具茎生珠芽叶腋部位中特异性表达的unigenes有235个,而在无茎生珠芽叶腋部位中均特异性表达的unigene仅1个。从转录组中共鉴定出11个PEBP家族成员,且在系统演化树上这些PEBP家族基因主要分布在TFL 1-like和FT-like分支上,其中位于TFL 1-like分支的Unigene40804_All与拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕中已知功能的TFL 1基因高度同源,被命名为DpTFL 1,且DpTFL 1基因仅在‘铁棍山药’具茎生珠芽的叶腋部位表达。qRT-PCR分析结果显示:随‘铁棍山药’茎生珠芽发育,DpTFL 1基因的表达量逐�
- 孙玲王月陈闽孙小芹杭悦宇张艳梅
- 关键词：薯蓣转录组
- 基于CRISPR/Cas9技术的水稻抗稻瘟病基因Pita突变体的创制被引量：3
- 2020年
- 以粳稻品种‘日本晴’(Oryza sativa subsp.japonica‘Nipponbare’)为转基因受体,利用CRISPR/Cas9技术对抗稻瘟病基因Pita的第6至第25位碱基进行定点编辑,对突变体进行鉴定,筛选出不含T-DNA区的纯合突变体,并对该基因纯合突变体的稻瘟病抗性及6个稻瘟病病程相关基因的表达水平进行分析。结果表明:在获得的8株T0代阳性转基因植株中,有7株为突变体植株,包括1株杂合体和6株纯合体,突变率和纯合突变率分别为87.5%和85.7%,突变类型包括碱基置换、碱基插入和碱基缺失。通过PCR检测获得42株T1代T-DNA阴性植株,全部为纯合突变体。纯合突变体的稻瘟病抗性分析结果表明:接种稻瘟病菌小种CH199(Magnaporthe oryzae strain CH199)后,Pita基因编辑材料V1-38-5的T2代植株叶片病斑面积明显大于野生型‘日本晴’,平均病级为4.1±0.2,极显著(P<0.01)高于野生型‘日本晴’(3.0±0.2)。此外,与野生型‘日本晴’相比,V1-38-5的T2代植株PR2和PR1b基因的相对表达量在接种稻瘟病菌小种CH19912 h时较低,其PR2、PR1b、PR3和E2F基因的相对表达量在接种稻瘟病菌小种CH19924 h时也较低。研究结果显示:利用CRISPR/Cas9技术对水稻Pita基因进行定点编辑能够获得稳定遗传且更易感病的纯合突变体材料,这些材料可用于水稻抗性品种选育和品质改良,在一定程度上加速水稻定向分子育种的进程。
- 吴凡王月陈闽刘佳杭悦宇孙小芹
- 关键词：水稻
