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一起副溶血性弧菌引起食物中毒的病原学鉴定及分型: 2018年; 目的对食物中毒事件中所采集样本进行副溶血性弧菌的分离鉴定,快速查明食物中毒原因并进行同源性分析。方法采用现行标准检验方法及实时荧光定量PCR对样本进行副溶血性弧菌分离鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对分离到的副溶血性弧菌进行分子分型。结果运用标准检验方法在22份食物样本中分离到副溶血性弧菌1株,7份粪便样本中分离到5株;实时荧光定量PCR在食物样本中检出核酸阳性1份,粪便样本中检出6份;所分离到的6株副溶血性弧菌经PFGE聚类分析得到4种PFGE带型,指纹图谱相似度为93.48%~97.44%。结论此次食物中毒由同一克隆副溶血性弧菌污染所致,PFGE可有效用于食物中毒的分型研究及溯源分析,实时荧光PCR可作为现行标准检验方法的有效补充。; 肖波孙松松周阳王斌邓建平; 关键词：副溶血性弧菌病原学鉴定

脉冲场凝胶电泳质控考核的实验条件优化: 2016年; 目的针对脉冲场凝胶电泳(PFGE)操作规范(Pulse Net China)为指导的质控考核,优化实验条件,从而得到高质量的实验结果。方法在充分了解实验原理的基础上,以脉冲场凝胶电泳操作规范(Pulse Net China)为指导,对部分实验条件进行优化和效果评价,总结出一套稳定、科学、准确的实验方法。结果通过反复实验,对一系列的实验条件优化后,得到了高质量的实验结果并顺利通过质控考核。结论黄金琼脂糖(SKG)凝胶浓度,酶切时间、电泳时间、胶块脱色时间的选择对结果图谱影响较大,是沙门菌PFGE实验的关键环节。; 肖波孙松松邓建平王红周阳; 关键词：脉冲场凝胶电泳质控考核

自贡市2014年农贸市场食品中单增李斯特菌污染状况调查被引量：9: 2019年; 目的探索自贡市农贸市场食品中单核细胞增生性李斯特菌(单增李斯特菌,Listeria monocytogenes,L. monocyto-genes)的污染状况。方法 2014年12月采集四川自贡市农贸市场的各类食品样品,分离单增李斯特菌,采用血清分型,多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对分离的单增李斯特菌进行分子分型,并用脉冲场凝胶电泳(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)研究菌株之间的同源性。结果从农贸市场626份各类食品中检出单增李斯特菌48株(阳性率7. 67%),牛羊肉样品的菌株分离率(37. 50%)最高。菌株分为3种血清型:1/2a(17株,占35. 41%)、1/2b(22株,占45. 83%)、1/2c(9株,占18. 75%)。9种ST型,以ST87型(13株,占27. 08%)、ST8型(12株,占25. 00%)、ST9型(9株,占18. 75%)为主;PFGE分为21种PT型,9个PFGE带型的菌株来自不同种类的食品。结论自贡市各类食品中单增李斯特菌污染情况广泛存在,不同食品存在交叉污染,食品监督部门应加强市场卫生情况的监管。; 张正东张玲王红陈曦王艳闫国栋邹年莉孙松松; 关键词：农贸市场单增李斯特菌血清型

多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用被引量：13: 2015年; 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。; 刘祥许彦梅王斌邓建平肖波孙松松周阳熊衍文王红

16SrDNA序列在艾伯特埃希菌鉴定中的应用被引量：8: 2016年; 目的通过16S rRNA基因序列分析快速鉴定艾伯特埃希菌。方法以30株疑似艾伯特埃希菌为材料,使用通用引物扩增其16S rRNA基因并进行测序。获得的序列与艾伯特埃希菌型菌株LMG 20976,基因组测序菌株KF1、NBRC107761、TW07627以及其他密切相关的细菌种(大肠埃希菌、赫曼埃希菌、费格森埃希菌、志贺菌和Shimwellia blattae)的16S rRNA基因序列进行比较,并使用N-J法构建进化树来分析其相关性。结果 30株疑似艾伯特埃希菌的16S rRNA基因序列与艾伯特埃希菌参考菌株的序列相似性最高,并与其聚类为一簇,为艾伯特埃希菌。结论 16S rRNA基因测序分析可用于艾伯特埃希菌的快速鉴定。; 王斌王红熊衍文许彦梅刘祥肖波孙松松周阳白锐张玲; 关键词：RDNA

食品中副溶血性弧菌检测能力验证分析被引量：4: 2017年; 目的通过参加CNAS(中国合格评定国家认可委员会)食品中副溶血性弧菌检测能力验证计划,对实验室检测检测能力及质量进行确认。方法采用国标法及实时荧光PCR法对标识为VP-162考核样品及超市随机抽取的50份动物性海水产品进行副溶血性弧菌定性检测,通过检测结果比较进行方法评价。结果 VP-162考核样品中检出副溶血性弧菌,考核结果为满意。随机抽取的50份动物性海水产品,干制生化试剂及API20E均检出6份(检出率12.0%),全自动微生物生化鉴定系统检出5份(检出率10.0%),实时荧光PCR法检出8份(检出率16.0%)。结论实时荧光PCR检测结果准确、灵敏、快速,在运用国标法进行检测过程中,采用生化鉴定试剂与全自动微生物生化鉴定系统分别进行鉴定时,其鉴定结果存在一定差异。; 肖波周阳孙松松; 关键词：副溶血性弧菌

自贡地区艾伯特埃希菌的筛查及菌株特征分析被引量：7: 2017年; 目的了解自贡地区人群、动物源性食品、家禽及鸟类携带艾伯特埃希菌情况及菌株特征.方法采集市售牛肉、羊肉、猪肉、鸡肉、鸭肉、鸭肠及鸡肠,不同鸟类粪便及腹泻患者和密切接触人群粪便,经EC肉汤增菌后,PCR检测eae基因,阳性增菌液接种麦康凯琼脂,挑取不发酵乳糖、eae阳性菌落进一步通过16S rDNA测序及多位点序列分型分析（MLST）,确定为艾伯特埃希菌,并对菌株进行eae、cdtB多态性分析及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型分析.结果本研究共鉴定51株艾伯特埃希菌（19株来源于鸭肠及其内容物、18株来源于鸡肠及其内容物、3株来源于腹泻患者粪便、3株来源于密切接触人群粪便、1株来源于白鹭粪便、3株来源于鸡肉、2株来源于鸭肉、1株来源于猪肉、1株来源于羊肉）.eae分为6种亚型,分别为sigma、rho、iota2、epsilon3,nu及N5,而51株艾伯特埃希菌均具有Ⅱ/Ⅲ/ⅤcdtB亚型,其中3株菌同时具有Ⅰ/ⅣcdtB亚型.51株分离株共分为40种PFGE带型,呈多态性分布.结论首次在中国腹泻患者、密切接触人群、野生白鹭、家禽和动物源性食品中证实了艾伯特埃希菌的存在,对进一步深入开展艾伯特埃希菌病原学、流行病学研究具有重要实际意义.; 王红刘祥许彦梅白向宁张玲陈曦范正轩缪以懋李新琼闫国栋肖波孙松松周阳张正东熊衍文李群; 关键词：动物源性食品多位点序列分型脉冲场凝胶电泳

自贡市2007-2010年鼠伤寒沙门菌感染的脉冲场凝胶电泳分析被引量：2: 2018年; 目的回顾性分析自贡市2007-2010年分离到的沙门菌菌株,评估分子分型技术在食源性传染病暴发识别和处置中的价值。方法对自贡市2007-2010年从食品和腹泻患者中分离的沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用Bio Numerics软件分析菌株之间的相似度。结果 55株沙门菌中,来源于2007-2008年的10个腹泻患者粪便和2008年的15个皮蛋中的25株鼠伤寒沙门菌菌株PFGE带型相似度为100%,均为P9带型。结论感染鼠伤寒沙门菌的皮蛋是导致自贡市2007-2008年10名患者腹泻暴发的污染源,为快速准确识别食源性疾病暴发并及时溯源、控制,应在食品安全监测中普及PFGE等分子分型技术。; 张玲刘祥陈曦肖波王斌孙松松周阳王红; 关键词：脉冲场凝胶电泳鼠伤寒沙门菌皮蛋腹泻

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孙松松

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