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川芎转录组SSR分析与EST-SSR标记的开发被引量：21: 2017年; 该研究通过组装川芎根转录组数据获得24 422个unigene,随后对得到的unigene进行了SSR检测,共检测到4 073个SSR位点。对检测到的EST-SSR进行特征分析,结果显示单核苷酸重复最多,占41.0%。SSR所在序列功能注释结果显示在Nr中有2 201条序列能够被注释,同时SSR所在序列还被注释到49个GO分类和242个KEGG代谢通路中。利用SSR检测结果进行了EST-SSR标记开发,合成其中235对引物进行验证,74对扩增效果较好。利用74对EST-SSR引物对34个川芎资源进行遗传多样性分析,结果显示收集的川芎资源多样性较好,UPGMA聚类显示川芎资源分为两大类,聚类结果表现出一定的地域性,PCo A分析与UPGMA聚类结果类似。该研究首次对川芎进行EST-SSR分析和标记开发,对推动川芎资源遗传多样性研究、品种纯度检测、基因定位和分子育种等具有重要意义。; 袁灿彭芳杨泽茂钟文娟牟方生龚一耘戢沛城蒲德强黄海燕杨晓张超; 关键词：川芎 EST-SSR 功能注释

赶黄草的转录组测序及分析被引量：4: 2017年; 目的获得赶黄草Penthorum chinense转录基因参考序列和表达量信息,探索赶黄草药用活性成分生物合成的遗传基础,为赶黄草的重要功能基因研究提供参考。方法采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术,对赶黄草进行转录组测序,对获得的数据进行过滤组装,对得到的unigene进行比对注释,同时对本研究获得赶黄草活性成分合成相关代谢通路基因进行分析。结果共获得了40 005 442条有效的短读序,通过de novo拼接得到42 306个unigene,开放阅读框(ORF)分析共计得到518个ORF,其中75个ORF具有转录因子结构域。通过KEGG分析,检测到33、32、59、68个unigene分别参与黄酮类生物合成、固醇类生物合成、萜类骨架生物合成和羧酸代谢。结论本研究发现的这些基因对赶黄草遗传改良和药用活性物质的生物合成路径相关基因研究有着重要意义。; 袁灿彭芳钟文娟牟方生戢沛城龚一耘蒲德强叶霄黄海燕杨晓张超; 关键词：赶黄草转录组槲皮素黄酮类萜类

葛根资源遗传多样性和性状关联分析被引量：17: 2017年; 通过研究葛根资源的遗传多样性和葛根表型性状与分子标记的关联分析,为葛根的分子育种和指纹图谱构建提供理论依据。鉴定分析了127份不同来源葛根资源的10个表型性状,并用ISSR标记研究127份葛根资源的遗传多样性,对ISSR标记与表型性状进行关联分析。表型性状鉴定结果显示葛根资源的10个性状变异大、多样性较好。利用ISSR标记获得多态性条带109条,平均每个引物扩增5.73条、平均Nei's基因多样性0.2085、平均Shannon's指数0.3378,最远遗传距离为0.46。ISSR分子标记聚类分析将127份资源聚为两大类,群体结构分析和PCo A分析结果类似将127份资源分为2个亚群。GLM分析发现3个与茸毛性状关联标记,MLM分析未发现与表型性状关联的标记。本研究收集的资源遗传多样性较好,葛根分子标记聚类结果与地域关系不大,综合GLM和MLM关联分析结果,本试验未发现与表型关联位点。; 袁灿钟文娟龚一耘蒲德强戢沛城黄海燕杨泽湖张超; 关键词：ISSR标记

基于川芎转录组序列开发的EST-SSR标记引物组的获取方法及应用: 本发明公开了一种基于川芎转录组序列开发的EST‑SSR标记引物组、其获取方法及应用，本发明基于川芎转录组序列开发的EST‑SSR标记引物组包括74对引物，其中各引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1至SEQ ID...; 袁灿彭芳杨泽茂张超钟文娟杨晓牟方生龚一耘蒲德强戢沛城叶霄熊淼黄海燕; 文献传递

川明参咀嚼片配方与制备工艺研究被引量：3: 2015年; 研究川明参咀嚼片的配方和工艺。以多指标感官评定为依据,采用单因素试验考察各填充剂用量,采用正交试验优化配方,筛选川明参咀嚼片最佳配方。结果表明川明参咀嚼片的最佳配方为:山梨醇25%,乳糖5%,柠檬酸0.5%(酸味剂),糊精10%,微晶纤维素28.5%,硬脂酸镁1.0%(润滑剂),川明参浸膏30%。该配方工艺简便,实用性强,所制得的川明参咀嚼片酸甜适宜,且入口顺滑细腻,咀嚼性强。; 雨田张超孙佩黄海燕钟文娟戢沛城蒲德强龚一耘牟方生; 关键词：川明参咀嚼片正交设计

基于川芎转录组序列开发的EST‑SSR标记引物组、其获取方法及应用: 本发明公开了一种基于川芎转录组序列开发的EST‑SSR标记引物组、其获取方法及应用，本发明基于川芎转录组序列开发的EST‑SSR标记引物组包括74对引物，其中各引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1至SEQ ID...; 袁灿彭芳杨泽茂张超钟文娟杨晓牟方生龚一耘蒲德强戢沛城叶霄熊淼黄海燕

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黄海燕